TruSight One Sequencing Panel

以高分析灵敏度和特异性靶向外显子中疾病相关区域的全面测序研究panel。

6.5小时

分析时间

约2小时

手动操作时间

50 ng DNA

起始量

详情请参见规格表

TruSight One和TruSight One Expanded enrichment寡核苷酸现在可单独购买,与Illumina DNA Prep with Enrichment一起使用。TruSight One文库制备试剂盒(货号 FC-141-1006和FC-141-1007)和TruSight One Expanded(货号 FC-141-2007)已停产。 

概述

TruSight One Sequencing Panel基于多个基因组数据库和行业专家的指导,为疾病相关基因提供广泛的内容和高覆盖度。 

  • 靶向多达6700个与人类疾病相关的基因,覆盖度至少为20倍

  • 扩展现有菜单,简化工作流程,或通过单次检测创建完整的测序选项组合

  • 通过用户自定义的基因过滤和报告生成简化解读

提供两种panel选项,为临床研究实验室提供了管理多种检测产品组合的经济解决方案。

TruSight One Sequencing Panel

该panel全面覆盖了12 Mb的基因组内容,包括>4800个与特定临床表型相关的疾病相关基因,使研究人员能够专注于与疾病相关的已知基因。 

TruSight One Expanded Sequencing Panel

此panel进一步优化了原始panel,以提高覆盖度。Expanded Panel除了原始>4800外,还靶向约1900个额外基因,总共16.5 Mb的基因组内容。 


性能参数


所需产品

需要: 

  • 购买TruSight One Sequencing Combo捆绑解决方案(支持15个样本,包含1个TruSight One – Enrichment Oligos试剂盒、1个Illumina DNA Prep with Enrichment、(S) Tagmentation 16个样本和5个MiSeq Reagent Kit v3,600个循环), 或 

  • 为各个panel单独购买富集寡核苷酸,为16或96个样本单独购买带有或不带富集的Illumina DNA Prep,以及为您的系统购买测序试剂 

无论您选择组合包解决方案还是单独购买富集和文库制备,IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes(A–D)都需要单独购买。  

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应用

TruSight One Sequencing Panel提供了广泛的内容,并高度覆盖了疾病相关靶区,使实验室能够扩展现有菜单,简化工作流程,并用单次检测代替反复检测。 

工作流程示例


项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
MiSeq System

TruSight One: 3 samples per run with v3 reagents

长达2 × 150 bp 

NextSeq 550 System

TruSight One (samples per run): mid output: 12, high output: 36  

TruSight One Expanded: 24 samples per run (high output) 

高达2 × 150 bp 

高达2 × 150 bp 

NextSeq 2000 System

TruSight One: 96 samples per run (P3 flow cell) 

TruSight One Expanded: 66 samples per run (P3 flow cell) 

高达2 × 150 bp 

长达2 × 150 bp

NovaSeq 6000 System

TruSight One Expanded: 96 samples per run (S1 flow cell) 

长达2 × 150 bp

建议的样本数量基于目标内容的平均覆盖度为100倍。


相关应用和方法

其他人如何使用该产品

比较

TruSight One Sequencing Panel Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
Method Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing Target Enrichment, Exome Sequencing, Targeted DNA Sequencing
Specialized sample types Not FFPE-Compatible Blood, Saliva
Variant class Germline variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs) Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants
内容说明 TruSight One:约12 Mb基因组内容(约4800个基因)。
TruSight One Expanded:约16.5 Mb基因组内容(约6700个基因)。

37.5 Mb编码内容(≥99%的RefSeq、CCDS、ClinVar和ACMG致病/可能致病变异,COSMIC癌症基因普查内容),OMIM

分析时间 6.5小时 6.5小时
多重分析 多达96重 对多达12重预富集文库混合池进行测试。试剂盒配置支持多达192个样本的多重分析。最多支持384个样本。
手动操作时间 约2小时 约2小时
技术 Illumina测序 Illumina测序
核酸类型 DNA DNA
物种
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
起始量 50 ng DNA 50-1,000 ng高质量基因组DNA(如果直接使用血液和唾液样本,请参阅参考指南)

选择工具:

TruSight One Sequencing Panels全球基因内容贡献者

TruSight One panel专注于具有已知疾病相关变异的基因组外显子区域。结合来自多个公共来源的数据可确保panel覆盖临床研究环境中当前审查的所有基因。

TruSight One和Illumina酶切法片段化化学技术

TruSight One富集寡核苷酸与Illumina磁珠上酶切法片段化化学技术配合使用,提供了一种快速、简单的靶向基因富集方法。该工作流程结合了文库制备和目标富集步骤,可在1.5小时内完成。

相关资源

了解开发TruSight内容集的协作方法。

捆绑式解决方案 (1)

TruSight One Sequencing Combo (15 Samples)

20042621

足够用于15个样本,包括TruSight One – Enrichment Oligos(货号20029227)、Illumina DNA Prep with Enrichment、(S) Tagmentation(16个样本)(货号20025523)和5个MiSeq Reagent Kit v3(600个循环)(货号 MS-102-3003)。单独购买IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes。

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富集panel (2)

TruSight One – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)

20029227

与Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation搭配使用时,足以进行六次富集反应。单独购买文库制备试剂、富集试剂和标签接头。

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TruSight One Expanded – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)

20029226

与Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation搭配使用时,足以进行六次富集反应。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。

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文库制备 (4)

Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

包含用于制备和富集16个文库的试剂(16,1重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

包含用于制备16个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(16样本))一起订购。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

包含用于制备96个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(96样本))一起订购。

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

包括用于制备和富集96个文库的试剂(8次12重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。

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标签接头 (6)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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常见问题解答

Illumina建议使用基于荧光的方法,该方法特异于双链DNA,例如QuantiFluor或PicoGreen。有关详细信息,请参阅TruSight One Library Prep Guide中的输入建议。

Illumina建议在酶切法片段化和富集清洗步骤中使用微加热系统。如果微加热系统不可用,您可以使用扩增仪。按照说明使用96孔硬壳板设置酶切法片段化反应。对于富集清洗步骤,大样本量需要对实验方案进行调整,以获得可靠的性能。请参阅TruSight One Sequencing Panel参考指南中的附录A,了解完整详细信息。

TruSight One Sequencing Panel仅靶向编码区域,不包括UTR或启动子区域。
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将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

经过优化的试剂盒,可提供更高的簇密度和读长,与早期版本相比,提高了测序质量分值。

TruSight Oncology 500

靶向多种变异类型(包括微卫星不稳定性(MSI)和肿瘤突变负荷(TMB))的检测。

Illumina DNA Prep

快速、集成的工作流程,用于制备文库,用于广泛的测序应用。

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