产品

AmpliSeq for Illumina BRCA Panel

用于研究BRCA1和BRCA2基因的体细胞和生殖系变异的靶向研究panel。

5小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间）

分析时间

<1.5小时

手动操作时间

1–100 ng（建议每个混池10 ng）

起始量

详情请参见规格表

概览

AmpliSeq for Illumina BRCA Panel是一款靶向重测序分析套装，用于研究BRCA1和BRCA2基因的体细胞和生殖系变异。

主要特点

  • 相关基因内容 - 靶定BRCA1与BRCA2基因的所有外显子区域和侧翼内含子序列

  • 快速的一体化工作流程 - 可在一天内使用起始量低至1 ng的高质量样本或10 ng福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）的样本制备直接测序的文库

  • 准确的数据 - 使用本地或云端分析方法检测变异等位基因频率低至5%的体细胞突变

BRCA Panel是集成工作流程的一部分，该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）的文库制备、采用Illumina边合成边测序（SBS）的新一代测序（NGS）技术以及自动化分析过程。

BRCA1 和 BRCA2 是人类肿瘤抑制基因，携带特定突变时，与乳腺癌和卵巢癌风险增加有关。即用型panel帮助研究人员节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。

深入了解AmpliSeq for Illumina

规格

Cancer type Solid Tumor
Method Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing
Specialized sample types FFPE Tissue, Blood
Variant class Germline variants, Insertions-deletions (indels), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants
作用机制 多重PCR
内容说明 BRCA1和BRCA2的外显子区域和侧翼内含子序列
分析时间 5小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间）
多重分析 96个双标签序列组合
手动操作时间 <1.5小时
扩增子数 共265个。2个混合池。（池1：132个扩增子。 池2：133个扩增子）。
技术 Illumina测序
核酸类型 DNA
物种 人
系统 MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System
说明 BRCABRCA1BRCA2的生殖系和体细胞分析研究。
起始量 1–100 ng（建议每个混池10 ng）

需要的产品

AmpliSeq for Illumina  BRCA Panel工作流程需要 BRCA Panel、Library PLUS试剂盒和标签接头。

/

应用

工作流程示例

1
制备

AmpliSeq for Illumina  BRCA Panel

2
测序
3
分析

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
iSeq 100 System

12 samples per run (assumes minimum coverage of 500×)
96 samples per run (assumes minimum coverage of 50x)

2 × 150 bp
2 × 150 bp
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 24, high output: 80 (assumes minimum coverage of 500×)

2 × 150 bp
MiSeq System

Samples per run at 500x minimum coverage (by reagent kit version): v2 nano: 3, v2 micro: 12, v2: 48, v3: 80
Samples per run at 50x minimum coverage (by reagent kit version): v2 nano: 32, v2 micro: 96

2 × 150 bp
2 × 150 bp

相关应用和方法

靶向重测序

通过靶向重测序，可以分离出一部分基因或基因组区域并进行测序，从而节约实验室资源。

病理学和临床癌症研究

我们的临床癌症研究解决方案能提供准确的基因组信息，让实验室能够在单次检测中分析多个基因。

文档

产品资料
支持文档

比较

AmpliSeq for Illumina BRCA Panel TruSight Cancer
Cancer type Solid Tumor Pan-Cancer
Method Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing
Specialized sample types FFPE Tissue, Blood Not FFPE-Compatible
Variant class Germline variants, Insertions-deletions (indels), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants Germline variants
作用机制 多重PCR
内容说明 BRCA1和BRCA2的外显子区域和侧翼内含子序列 固定的探针集富集了与常见和罕见癌症相关的94个基因和284个SNP。
分析时间 5小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间） 1.5天
多重分析 96个双标签序列组合 多达96重
手动操作时间 <1.5小时 5小时
扩增子数 共265个。2个混合池。（池1：132个扩增子。 池2：133个扩增子）。
核酸类型 DNA DNA
物种 人 人
系统 MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer
说明 BRCABRCA1BRCA2的生殖系和体细胞分析研究。 常见和罕见癌症的生殖系突变检测研究。
起始量 1–100 ng（建议每个混池10 ng） 50 ng DNA

选择工具：

文库制备和芯片试剂盒选择器

寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。

Panel (1)

AmpliSeq™ BRCA Panel for Illumina®

20019168

靶向panel，评估BRCA1和BRCA2基因的所有外显子。试剂盒可进行24次反应。Library PLUS和标签均为单独出售。

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文库制备 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。

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标签接头 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。

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配套产品 (2)

AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

包括24次反应，用于使用AmpliSeq for Illumina实验方案从未染色的玻片固定FFPE组织中制备DNA，无需脱蜡或DNA纯化。

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时，包含用于文库归一化的磁珠和试剂。

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MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。

iSeq 100试剂

iSeq 100系统的试剂采用即用型卡盒以及单通道SBS化学和CMOS技术，可实现简单、低成本的测序。

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