MethylationEPIC v1.0将于2023年年中停产,Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit是推荐的替代产品。因美纳始终致力于为您提供高质量的支持和服务。
Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kit是一种全基因组甲基化筛选工具,靶向人类甲基化组最具生物学意义的区域中超过935,000个CpG位点,同时在其前代产品MethylationEPIC v1.0的基础上极大的提高了向后兼容性。该芯片保留了以单核苷酸分辨率定量分析全基因组CpG的能力,同时提供高度准确和精确的甲基化测量,不受测序深度的影响。可使用精简、用户友好的Infinium甲基化检测分析多种DNA样本类型,包括从FFPE分离的DNA样本。与其他方法相比,MethylationEPIC v2.0具有可扩展性和更低的单个样本总成本,因此可用于筛选大型队列,发现关于疾病机制的有影响力的生物学见解。
根据专家对EPIC v1.0的评估,去除了性能不佳的探针,替换为前沿内容,以便为表观遗传学研究提供更强大的发现能力。EPIC v2.0上新增的186,000个CpG靶向增强子和超级增强子、更多CTCF结合位点、CNV检测区域、EPIC v1.0覆盖不足的CpG岛以及常见癌症驱动突变。更新后的v2.0 Beadchip也可分析通过ATAC-Seq和ChIP-seq实验鉴定的染色质开放区域。有关MethylationEPIC v2.0所覆盖内容的详细说明请参阅产品数据表。
Illumina Methylation BeadChip支持表观遗传学领域的突破性研究已有十余年,迄今为止大多数已发表的全表观基因组关联研究(EWAS)都是利用MethylationEPIC或其前代产品HumanMethylation450完成的。因此,研究人员可受益于诸如Gene Expression Omnibus(GEO)或癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库中公开的大量甲基化芯片数据。此外,根据甲基化芯片数据建立了肿瘤和其他疾病的机器学习分类方法,可通过甲基化BeadChip数据格式轻松访问。
MethylationEPIC v2.0数据分析由GenomeStudio Methylation Module提供支持。GenomeStudio软件可实现直观的初级分析和质量控制。它具有直观的可视化工具,让研究人员能够在单幅图(如热图、散点图和曲线图)中查看数据。对于高级下游分析,R软件框架中的许多免费软件包支持甲基化数据的归一化和差异分析(SeSAMe、minfi等)。视频教程和全面用户指南介绍了这些数据分析包的用法。
Infinium甲基化检测的可靠性有助于从FFPE组织样本获得高质量数据。FFPE兼容性对于癌症研究极为重要,能够支持以大型肿瘤生物样本库为基础的研究。Infinium检测同样兼容新鲜/冷冻组织、全血、口腔细胞、cfDNA、唾液和其他样本类型。
Infinium Methylation BeadChip Application Note
Application Note | PDF < 1 MB
Analyzing FFPE Samples with Infinium Microarrays
Technical Note | PDF < 1 MB
Automated bisulfite conversion for Infinium™ Methylation BeadChips
Technical Note | PDF 2 MB
Qualification update for Infinium BeadChips
Technical Note | PDF 1 MB
Technical Note | PDF < 1 MB
Illumina Methylation BeadChips achieve breadth of coverage using two Infinium chemistries
Technical Note | PDF < 1 MB
Data Sheet | PDF | 5 versions
Infinium Assay Consumables and Equipment List Documentation
Infinium HD Methylation Assay Auto Workflow Checklist Documentation
Infinium MethylationEPIC v2 Kit Support Documentation
BeadArray Controls Reporter Software Guide Documentation
Infinium HD Methylation Assay Reference Guide Documentation
Infinium HD Assay for Methylation Lab Tracking Form Documentation
Infinium HD Methylation Assay Manual Workflow Checklist Documentation
Infinium LiHa and Infinium RoMa Operating Manual Documentation
自定义协议选择器
Generates customized, end-to-end instructions