RNA-Seq数据的直观分析
随着生物信息学领域的成熟，RNA测序（RNA-Seq）数据分析比以往更容易。Illumina提供了具有直观用户界面的按键式RNA-Seq软件工具，该工具专为生物学家设计。
这些用户友好型工具支持从基因表达分析到总RNA表达谱分析等多种新一代测序（NGS）研究。
使用Illumina工具进行RNA-Seq数据分析的优势
可以在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub（Illumina多组学云端计算平台）中快速安全地传输、存储和分析RNA-Seq数据。两个平台均提供对DRAGEN Bio-IT平台的云内访问，以便对RNA-Seq和其他NGS数据进行准确、超快速的二次分析。
DRAGEN采用无损基因组数据压缩技术，最多可将数据存储空间缩小5倍，同时保持数据完整性。了解详情：
我们的BaseSpace RNA-Seq应用程序:
- 适用于任何研究人员，无论是否有生物信息学经验
- 专家优选的RNA-Seq软件工具套装，这些应用程序或是由Illumina开发或优化，或是选自不断发展的第三方应用程序供应商生态系统
- 为支持从转录本丰度测定到检测新转录本、编码序列单核苷酸多态性（cSNP）、基因融合等常见转录组研究而设计
- 适用于人类、小鼠和大鼠RNA-Seq分析（某些应用程序支持更多物种）
- 兼容所有Illumina测序系统
核心实验室使用BaseSpace分析mRNA-Seq数据
英属哥伦比亚大学的BRC-Seq核心测序实验室使用了BaseSpace Sequence Hub来分析和共享数据。他们的研究经常涉及对mRNA测序数据的分析，以评估不同实验处理对转录组的影响。BaseSpace工作流程可帮助BRC-Seq追踪样本并为客户提供高质量的测序数据。
阅读访谈录Featured RNA-Seq Analysis Apps
基于经常引用的RNA-Seq分析流程，这些App支持多种转录组数据分析需求。用于常用方法的Illumina BaseSpace RNA-Seq App列于下表中。
| 方法 | 特色App |
|---|---|
| mRNA测序 | |
| 靶向RNA测序 | BaseSpace RNA Amplicon App |
| 小RNA测序 | BaseSpace Small RNA App |
| 传染病测序 |
RNA-Seq数据的解析
数据分析结束后，结果可以方便地传送至BaseSpace Correlation Engine进行功能注释，以了解基因表达变化引起的生物学效应。BaseSpace Correlation Engine含有来自数以千计的公开研究的数据组，可用于生物学解析。该软件可将RNA-Seq实验得出的差异性基因表达数据与疾病关联，或将相关基因与小RNA靶标图形化。
查看BaseSpace Correlation Engine
查看样本数据集
查看我们的基因组学云计算环境BaseSpace Sequence Hub中多种方法的样本数据组，或者试用BaseSpace App并交互评估结果。
注意，客户需要登录才能访问BaseSpace Sequence Hub和查看特定数据集。