随着生物信息学领域的成熟,RNA测序(RNA-Seq)数据分析比以往更容易。Illumina提供了具有直观用户界面的按键式RNA-Seq软件工具,该工具专为生物学家设计。
这些用户友好型工具支持从基因表达分析到总RNA表达谱分析等多种新一代测序(NGS)研究。
可以在BaseSpace Sequence Hub(Illumina基因组学计算平台)中快速安全地传输、存储和分析RNA-Seq数据。BaseSpace Sequence Hub包含优选 的RNA-Seq软件工具套装,由Illumina开发和优化。
我们的BaseSpace RNA-Seq应用程序:
英属哥伦比亚大学的BRC-Seq核心测序实验室使用了BaseSpace Sequence Hub来分析和共享数据。他们的研究经常涉及对mRNA测序数据的分析,以评估不同实验处理对转录组的影响。BaseSpace工作流程可帮助BRC-Seq追踪样本并为客户提供高质量的测序数据。
阅读访谈录基于经常引用的RNA-Seq分析流程,这些App支持多种转录组数据分析需求。用于常用方法的Illumina BaseSpace RNA-Seq App列于下表中。
方法 | 特色App |
---|---|
mRNA测序 | |
靶向RNA测序 | BaseSpace RNA Amplicon App |
小RNA测序 | BaseSpace Small RNA App |
查看我们的基因组学云计算环境BaseSpace Sequence Hub中多种方法的样本数据组,或者试用BaseSpace App并交互评估结果。
注意,客户需要登录才能访问BaseSpace Sequence Hub和查看特定数据集
了解典型的BaseSpace Sequence Hub RNA测序数据分析工作流程。了解如何分析结果,查看软件生成的易于解析的表格和图片实例。
阅读技术说明数据分析结束后,结果可以方便地传送至BaseSpace Correlation Engine进行功能注释,以了解基因表达变化引起的生物学效应。BaseSpace Correlation Engine含有来自数以千计的公开研究的数据组,可用于生物学解析。该软件可将RNA-Seq实验得出的差异性基因表达数据与疾病关联,或将相关基因与小RNA靶标图形化。
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