产品

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome

简化的RNA-Seq解决方案，可对编码和非编码转录组进行清晰、全面的分析，具有出色的研究灵活性。
kits

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome

简化的RNA-Seq解决方案，可对编码和非编码转录组进行清晰、全面的分析，具有出色的研究灵活性。

约7小时

分析时间

＜3小时

手动操作时间

标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 

起始量

详情请参见规格表

概述

它能准确检测基因和转录本丰度，并能检测编码RNA和多种形式的非编码RNA中已知的和新的特征 能够可靠地揭示替代转录本、基因融合和等位基因特异性表达。此外，Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus Microbiome还能为宏转录组学应用提供高质量的数据。

主要特点

  • 出色的性能——在单次反应中去除多个物种的原核和真核核核糖体RNA（rRNA）和珠蛋白RNA，实现丰富的转录组分析

  • 高质量数据——从低RNA起始量（1–1000 ng）和困难的样本类型中实现高灵敏度，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）、粪便样本和其他低质量样本

  • 快速、灵活的工作流程——制备文库的速度比同类试剂盒快40%。工作流程的创新包括更短的孵育时间和更少的样本纯化步骤，总实验时间比TruSeq Stranded mRNA缩短约40%（图6）。

性能参数

Automation capability Liquid Handling Robots
Method Whole-Transcriptome Sequencing, Metatranscriptome Sequencing
Specialized sample types Microbiome Samples, Low-Input Samples, FFPE Tissue
Strand specificity Stranded
Variant class Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts
作用机制 酶法rRNA去除，连接接头和标签
内容说明 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA
分析时间 约7小时
多重分析 多达384个唯一双标签（UDI）
手动操作时间 ＜3小时
技术 Illumina测序
核酸类型 RNA
物种 小鼠, 人, 大鼠, Bacteria
物种详情

Ribo-Zero Plus可去除多个物种的大量转录本，包括：人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌（大肠杆菌和枯草芽孢杆菌）rRNA以及人类β珠蛋白转录本 

Ribo-Zero Plus Microbiome去除了多个物种的大量转录本，包括：在Ribo-Zero Plus中去除的转录本以及多种微生物物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 
系统 NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
说明

用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 
起始量

标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 

需要的产品

选择满足您处理需求的文库制备试剂盒大小（16个样本或96个样本）。

标签单独出售，是多重分析所必需的。选择最适合您目标测序通量的标签选项。测序通量和多重分析能力可能因测序仪和流动槽试剂而异。

深入了解多重分析

/

应用

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome Kit可在约7小时内从低RNA起始量和低质量样本中制备全转录组测序可用文库，手动操作时间不到3小时。

工作流程示例

1
制备

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome

2
测序
3
分析

计划推荐

仪器 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

Mid output: 2 samples per flow cell 

High output: 8 samples per flow cell 

2 × 50 bp
NextSeq 2000 System

P2: 8 samples per flow cell 

P3: 24 samples per flow cell

2 × 50 bp
NovaSeq 6000 System

SP: 16 samples per flow cell 

S1: 32 samples per flow cell

S2: 82 samples per flow cell 

S4: 200 samples per flow cell 

2 × 50 bp

应用和方法

总RNA测序

分析编码RNA和多种形式的非编码RNA，获得完整的转录组视图。

微生物转录组学

RNA测序（RNA-Seq）提供了一种用于分析和量化细菌、病毒以及其他微生物转录本的无偏倚方法。

基因表达分析

Learn how to profile gene expression changes for a deeper understanding of biology.

其他人如何使用该产品

利用宏转录组学捕获微生物组的动态变化

文档

产品资料

  • 应用指南 PDF < 1 MB 3 版本

支持文档

比较

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus或Ribo-Zero Plus Microbiome TruSeq Stranded Total RNA TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
Automation capability Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots
Method Whole-Transcriptome Sequencing, Metatranscriptome Sequencing Whole-Transcriptome Sequencing Whole-Transcriptome Sequencing
Specialized sample types Microbiome Samples, Low-Input Samples, FFPE Tissue FFPE Tissue Blood
Strand specificity Stranded
Variant class Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts
作用机制 酶法rRNA去除，连接接头和标签 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR 基于磁珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR
内容说明 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA
分析时间 约7小时 11.5小时 11.5小时
多重分析 多达384个唯一双标签（UDI） 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起）, 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本 高通量试剂盒：使用组合双标签序列或唯一双标签序列制备96个标签样本, 低通量试剂盒：混合最多12个样本。或混合24个样本（组A和B一起）
手动操作时间 ＜3小时 5.5小时 5.5小时
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序
核酸类型 RNA RNA RNA
物种 小鼠, 人, 大鼠, Bacteria 小鼠, 人, 大鼠 小鼠, 人, 大鼠
物种详情

Ribo-Zero Plus可去除多个物种的大量转录本，包括：人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌（大肠杆菌和枯草芽孢杆菌）rRNA以及人类β珠蛋白转录本 

Ribo-Zero Plus Microbiome去除了多个物种的大量转录本，包括：在Ribo-Zero Plus中去除的转录本以及多种微生物物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006 

 rRNA去除：去除人类、小鼠和大鼠rRNA rRNA去除：消耗人、小鼠和大鼠rRNA（细胞质和线粒体）和球蛋白mRNA
系统 NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
说明

用于从低RNA起始量和低质量样本制备全转录组测序文库，支持多种RNA-Seq应用。包括Ribo-Zero Plus，用于单管去除来自多个物种的rRNA和珠蛋白RNA，以便进行丰富的转录组分析。 

 用于全转录组测序研究。Total RNA版本可去除细胞质rRNA，而Total RNA Gold版本可去除细胞质和线粒体rRNA。 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。
起始量

标准质量RNA样本为1–1000 ng总RNA。建议至少10 ng总RNA，以获得最佳性能和FFPE样本 

 0.1 – 1 ug高质量总RNA。低质量样本可能需要进一步优化。 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA

选择工具

文库制备和芯片试剂盒选择器

寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。

'图 '

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus工作流程

Illumina Stranded Total Prep提供了快速的工作流程，且手动操作时间短。时间长短因使用的设备、处理的样本数量、自动化程序或用户经验而异。

性能参数比较

性能参数比较——将Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus与TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero进行比较。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus更高效，尤其是在使用10 ng和1 ng的低起始量总UHR RNA的情况下。

使用Ribo-Zero Plus Microbiome Depletion试剂盒开展可靠的核糖核酸去除

Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit可有效去除粪便样本中的rRNA（5S、16S和23S）水平。将Ribo-Zero Plus rRNA Depletion试剂盒的检测结果与X公司的市售核酸去除试剂盒进行了比较。共检测了两份粪便混合物样品。

可去除的目标RNA种类

Illumina Stranded Total RNA Prep Kit包括（A） Ribo-Zero Plus，用于去除人类、小鼠、大鼠、细菌和流行病学样本等多个物种的大量rRNA，或（B） Ribo-Zero Plus Microbiome，可稳定去除包括粪便样本在内的复杂微生物样本中的大量rRNA，用于宏转录组研究。

A. Ribo-Zero Plus试剂盒

去除靶标 rRNA靶标
人细胞质rRNA 28S、18S、5.8S和5S
人线粒体rRNA 12S和16S
人β珠蛋白转录本 HBA1、HBA2、HBB、HBG1和HBG2
小鼠和大鼠 12S、16S、28S、18S、5.8S和5S
革兰氏阴性细菌rRNA 大肠埃希菌：5S、16S、23S
革兰氏阳性细菌rRNA 枯草芽孢杆菌：5S、16S、23S

Ribo-Zero Plus Microbiome

去除靶标 rRNA靶标
微生物组rRNA* 来自不同微生物的5S, 16S, 23S，包括常见成人、婴儿细菌物种和ATCC MSA-2002, MSA-2005和MSA-2006

*仅包含在Illumina Stranded Total Ribo-Zero Plus Microbiome Kit（货号20072063）中。rRNA去除针对人类微生物组rRNA进行了优化，使用其他样本类型时性能可能会有所不同。

资源

利用宏转录组进行无偏差细菌分析

来自Diversigen和DNA Genotek的Tonya Ward、Emily Hollister和Le François博士如何为宏转录组研究开发工作流程，并阅读他们对该研究领域如何潜在影响未来的看法。

阅读客户聚焦

宏转录组学：挑战和机遇

在此网络研讨会中，该领域的三位顶尖专家将分享他们在样本采集和处理、rRNA去除和生物信息学分析方面的见解和主要观点。

观看网络研讨会

文库制备 (3)

Illumina® Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (16 Samples)

20040525

包含用于制备16个样本的试剂和Ribo-Zero Plus去除模块。仅与IDT for Illumina RNA UD标签、Ligation兼容。标签和纯化磁珠单独出售。

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Illumina® Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (96 Samples)

20040529

包含用于制备96个样本的试剂和Ribo-Zero Plus去除模块。仅与IDT for Illumina RNA UD Index、Ligation兼容。标签和纯化磁珠单独出售。

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Illumina® Stranded Total RNA Prep with Ligation, Ribo-Zero Plus Microbiome (96 Samples)

20072063

包含用于制备96个文库的试剂和Ribo-Zero Plus Microbiome去除模块。仅与IDT for Illumina RNA UD Index、Ligation兼容。标签单独出售。

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标签接头 (8)

Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091655

Illumina® RNA UD Indexes Set A， Ligation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备试剂。

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Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091657

Illumina® RNA UD Indexes Set B， Ligation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备试剂。

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Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091659

Illumina® RNA UD Indexes Set C， Ligation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备试剂。

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Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091661

Illumina® RNA UD Indexes Set D， Ligation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备试剂。

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040553

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备和探针panel。

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040554

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备和探针panel。

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040555

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备和探针panel。

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Discounts:

IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040556

包含96、10 bp标签，足以标记96个样本和RNA Index Anchor板。配合Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep Kit使用。单独购买文库制备和探针panel。

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服务 (1)

Illumina Stranded Total RNA Library Prep Training

20044764

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常见问题解答

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ligation， Ribo-Zero Plus Microbiome Kit包含扩展捕获探针，可靶向来自不同微生物物种的5S, 16S和23S rRNA，包括常见的成人和婴儿肠道细菌，而Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit靶向 大肠杆菌和枯草芽孢杆菌的 5S, 16S和23S。 

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ligation、Ribo-Zero Plus Microbiome可去除人类珠蛋白转录本和多个物种的rRNA，包括人类、小鼠、大鼠和人类肠道和皮肤中常见的多种细菌菌株。Illumina无法保证去除所列物种以外的rRNA。

建议将Agilent Technologies的Universal Human Reference RNA阳性样本对照品（货号740000）与Illumina Stranded Total RNA Prep一起使用。

为了检查最终文库的质量和浓度，可以使用以下两种方法：

  • • 如果使用NextSeq 1000/2000测序系统，按1:10000x稀释文库，然后使用KAPA qPCR Library Quantification Kit分析2 μL文库。

  • • 如果使用其他测序系统，使用Agilent 2100 Bioanalyzer和DNA 1000 Kit分析1 µL文库。

Illumina Stranded Total RNA Prep靶向起始链。

使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ligation， Ribo-Zero Plus Microbiome Kit时，RNA的最低推荐起始量为25 ng，以获得最佳性能。

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订购NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。

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快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。

BaseSpace Sequence Hub订购

在BaseSpace Sequence Hub中管理运行、分析、存储和共享测序数据。查找应用程序、订阅选项和文档。

Illumina Stranded mRNA Prep

快速、经济高效的工作流程，通过精确测量链信息准确、无偏差地检测蛋白质编码转录组。

Illumina UD Indexes

独特的双（UD）标签能够制备高质量的文库，可进行多重分析，从而提高通量并节省成本。

BaseSpace Sequence Hub

数据管理和简化的生物信息学，可帮助刚开始接触相关应用的实验室快速扩展新一代测序（NGS）操作。

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