FFPE样本分析

FFPE测序和芯片

专为降解或有限的基因组材料分析而设计的解决方案

精心设计的Illumina FFPE系列解决方案能够解决福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)样本的基因分析难题,能提供全方位的FFPE测序和芯片应用。这些解决方案针对通常包含部分降解或有限的基因组材料的FFPE样本优化了工作流程和技术。研究人员现在可以分析之前难以分析的样本,获得高质量的基因组数据和见解。创新的制备方法、领先的新一代测序和芯片平台、以及直观的数据分析工具组成了无缝解决方案,使得FFPE测序和芯片研究从未如此简单。

全新的FFPE测序QC方法

研究人员可利用全新的QC方法成功对FFPE肿瘤样本的降解DNA进行测序。

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靶向测序专注于根据背景知识选择的一组基因或基因区域。通过对靶向DNA区域进行测序,研究人员能以更精简的数据分析流程进行经济有效的高深度测序。

为便于进行靶向癌症FFPE测序研究,Illumina为您提供性能优异的固定基因集的panel和定制扩增子解决方案,通过该方案研究人员可选择自己感兴趣的扩增子。

TruSight Oncology 500: 此分析方法靶向多种变异类型,包括肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI),即使是低质量样本同样适用。

TruSight Tumor 15能够对FFPE组织样本的实体瘤标本进行分子分析,以最高水平的灵敏度检测最小等位基因。

AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2:用于研究50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域的靶向研究panel。

AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel:用于研究409种与癌症具有已知关联的基因外显子区域的靶向研究panel。

FFPE样本QC建议

FFPE组织的提取方法通常会产生高度降解的DNA和RNA。查看我们的FFPE质量控制建议,确定您的FFPE样本是否适合作为Illumina文库制备试剂盒的起始材料。

查看要点
FFPE Sample QC Recommendations

RNA测序

使用RNA测序(RNA-Seq)文库制备试剂盒系列产品进行FFPE测序,能够在转录水平上精确测量基因表达、发现或者验证基因融合。

深入了解FFPE RNA-Seq
测序FFPE肿瘤样本

了解Yasser Riazalhosseini博士如何对充满挑战的FFPE癌症样本进行测序,鉴定出驱动基因和新的生物标记物。

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特色RNA测序方案

The TruSight RNA Pan-Cancer Panel可全面检测1385种基因融合和基因表达变化,研究人员可重点研究癌症中与功能相关的改变。该panel能够检测总RNA起始量低至20 ng的FFPE组织。总之,TruSight RNA Pan-Cancer Panel提供一种高灵敏性、高重复性及经济的方案,可用来研究癌症中动态表达变化及功能机制。

TruSight Oncology 500: 此分析方法靶向多种变异类型,包括肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI),即使是低质量样本同样适用。

Illumina RNA Prep with Enrichment让您能够以极高的捕获效率和覆盖度均一性实现对大量靶基因的快速靶向检测。

Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus使用多种样本快速制备文库,以极大的灵活性来研究编码和非编码转录组。

靶向RNA测序是一种准确、低成本的方法,可同时测量数十个乃至数千个RNA靶标,是确认基因表达芯片和RNA测序研究成果的理想之选。

采用一体化的工作流程,Illumina所有的定制、半定制、和市售芯片都可用于FFPE样本的基因分型。该工作流程利用Infinium FFPE DNA Restoration Solution鉴定用于下游基因分型的质量可靠的样本、修复样本中受损的DNA,从而简化前期的样本处理流程。

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通过甲基化芯片可以在单核苷酸水平上对整个基因组的所选甲基化位点进行定量检测。Illumina甲基化芯片是唯一能提供专家精选位点的全面覆盖、FFPE样本兼容性、高样本通量、可靠性价比的产品。

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