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Illumina Microbial Amplicon Prep

一款灵活、一体化的NGS文库制备试剂盒，适用于多种公共卫生监测和微生物研究应用。

Illumina Microbial Amplicon Prep

一款灵活、一体化的NGS文库制备试剂盒，适用于多种公共卫生监测和微生物研究应用。

< 9小时

分析时间

48个样本约3小时

手动操作时间

因样本来源而异

起始量

详情请参见规格表

概述

Illumina Microbial Amplicon Prep（IMAP）是一款基于扩增子的文库制备试剂盒，采用的化学技术与COVIDSeq一致。利用该试剂盒可迅速、简单地完成文库制备，所得文库与几乎所有因美纳测序系统兼容。它适用于各种传染性疾病、公共卫生监测和微生物研究应用，包括病毒全基因组测序、抗菌药物耐药性标志物分析、细菌和真菌鉴定等应用。

拓展微生物研究能力

在任何规模下都能获得兼具出色的数据质量和准确性的测序结果，并缩短手动操作时间。

  • 使用即用型或实验室设计的寡核苷酸检测靶标变异

  • 使用基于多重PCR的工作流程

  • 使用简单的分析解决方案解读数据

  • 可对多种样本进行测序

该试剂盒可与各种定制、已发布或市售的引物集（不包括引物寡核苷酸）配合使用，并且与提取自培养物、拭子（鼻咽、皮肤和鼻腔）、废水等样本的RNA或DNA兼容。可使用Basespace Sequence Hub上的DRAGEN Targeted Microbial App和预加载的靶标进行数据分析，此外，还可以轻松上传文件进行自定义分析。

Illumina测试的实验方案
  • 基孔肯雅热1
  • 登革热1
  • 猴痘1
  • 呼吸道合胞病毒1
  • 寨卡病毒1
客户证明的实验方案*

*仅供信息参考，并不代表 Illumina 已对其验证或提供支持。

规格

分析时间 < 9小时
自动化功能 ⾃动化⼯作站
说明 Illumina Microbial Amplicon Prep（IMAP）是一种基于扩增子的文库制备解决方案，包含48个样本的RT-PCR、文库制备和标签。它基于与COVIDSeq相同的化学技术，可用于DNA和RNA样本。试剂盒中未包含寡核苷酸引物，需单独购买。
手动操作时间 48个样本约3小时
起始量 因样本来源而异
系统 MiSeq测序仪, iSeq 100测序仪, NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, MiSeqDx测序仪下的科研模式, MiniSeq测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000测序仪, MiSeq i100 Plus系统, MiSeq i100系统
作用机制 多重PCR
方法 扩增子测序
核酸类型 DNA, RNA
样本类型详情 可处理从鼻拭子到废水等各种类型的样本
物种 其他, 酵母, 病毒, 细菌
技术 Illumina测序
变异类别 单核苷酸多态性（SNP）, 单核苷酸位点变异（SNV）

应用

工作流程示例

1
制备

Illumina Microbial Amplicon Prep

2
测序
3
分析

相关应用和方法

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文档

产品资料
支持文档

*方案仅供参考。这并不意味着Illumina验证或支持实验方案。

 

参考文献

1.  Illumina。2023年9月8日从 Illumina Microbial Amplicon Prep获取，用于病毒监测

2. DengueSeq：登革热病毒V.2的泛血清型全基因组扩增子测序方案。2023年9月8日访问www https://www.protocols.io/view/dengueseq-a-pan-serotype-whole-genome-amplicon-seq-kqdg39xxeg25/v2

3. Bhatt L、Bhoyar RC、Jolly B、Israni R、Vignesh H、Scaria V、Sivasubbu S。印度爆发的块状皮肤病病毒的 基因组序列表明该病毒具有独特的谱系。Arch Virol. 2023年2月5日；168（3）：81. doi：10.1007/s00705-023-05705-w.

4. 猴痘病毒多重PCR扩增子测序（PrimalSeq）V.4. 2023年9月8日访问www https://www.protocols.io/view/monkeypox-virus-multiplexed-pcr-amplicon-sequencin-5qpvob1nbl4o/v4?step=2

5. 使用Illumina CovidSeq试剂进行新一代测序V.2的呼吸道合胞病毒（RSV） 全基因组扩增。2023 年 9 月 8 日访问，请访问  https://www.protocols.io/view/whole-genome-amplification-of-respiratory-syncytia-eq2lyjzbrlx9/v2

6. SARS-CoV-2 v 5.3.2方案发布。2023年9月12日访问www https://community.artic.network/t/sars-cov-2-version-5-3-2-scheme-release/462

7. 狂犬病病毒蝙蝠进化枝测序。2023年10月30日，访问www https://www.protocols.io/view/rabies-virus-bat-clade-sequencing-8epv5x3bng1b/v1

Illumina Microbial Amplicon Prep

20097857

包含cDNA转化、文库制备和标签的48样本扩增子试剂盒。不包括引物。

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参考文献
  1. Illumina. Accessed September 8, 2023, from Illumina Microbial Amplicon Prep for viral surveillance
  2. de La Roque, DGL, Santos EV, Policastro LR, et al. 2024. Exploring the Chikungunya virus landscape in a dengue-endemic Brazilian area. Journal of Infection and Public Health 17(7): 102442
  3. Vogels CB, Hill V, Breban MI, et al. 2024. DengueSeq: a pan-serotype whole genome amplicon sequencing protocol for dengue virus. BMC Genomics. 25(1): 433
  4. Naveca FG, Pires de Almeida TA, Souza V, et al. 2024. Human outbreaks of a novel reassortant Oropouche virus inthe Brazilian Amazon region. Nature Medicine. Epub ahead of print. Accessed 19 Sep 2024 from https://www.nature.com/articles/s41591-024-03300-3.epdf
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  8. Davina-Nunez C, Perez-Castro S, Cabrera-Alvargonzalez JJ, Montano-Barrientos J, Godoy-Diz M, Regueiro, B. 2023. The Modification of the Illumina® CovidSeq™ Workflow for RSV Genomic Surveillance: The Genetic Variability of RSV during the 2022–2023 Season in Northwest Spain. International Journal of Molecular Sciences. 24(22): 16055
  9. SARS-CoV-2 version 5.4.2 scheme release. Accessed 17 Sep 2024 from https://community.artic.network/t/scheme-release-artic-sars-cov2-400-v5-4-2/546
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  11. Sicilia P, Fantilli AC, Cuba F, et al. 2024. Hepatitis A virus whole genome sequencing strategy using NGS/Illumina technology. medRxiv pre-print. Accessed 17 Sep 2024 from https://doi.org/10.1101/2024.05.05.24306642
  12. Bhoyar RC, Jolly B, Vignesh H, Bhatt L, Senthivel V, Israni R, Scaria V, Sivasubbu S. 2024. Protocol for next-generation sequencing of the LSD virus genome using an amplicon-based approach. STAR Protocols. 5(3):103020.
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  16. Tomás G, Marandino A, Rodríguez S. et al. 2024. Diagnosis and genomic characterization of the largest western equine encephalitis virus outbreak in Uruguay during 2023–2024. npj Viruses 2, 70 
  17. Kim I, Nam J, Kim C, Choi Y, Lee H, An B, et al. Pathogenicity of Highly Pathogenic Avian Influenza A(H5N1) Viruses Isolated from Cats in Mice and Ferrets, South Korea, 2023. Emerg Infect Dis. 2024;30(10):2033-2041.
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  20. Hikmat H, Le Targa L, Boschi C, et al. 2025. Five‐Year (2017–2022) Evolutionary Dynamics of HumanCoronavirus HKU1 in Southern France With Emergenceof Viruses Harboring Spike H512R Substitution. J Med Virol 97:e70217
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