NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Illumina Microbial Amplicon Prep（IMAP）是一款基于扩增子的文库制备试剂盒，采用的化学技术与COVIDSeq一致。利用该试剂盒可迅速、简单地完成文库制备，所得文库与几乎所有因美纳测序系统兼容。它适用于各种传染性疾病、公共卫生监测和微生物研究应用，包括病毒全基因组测序、抗菌药物耐药性标志物分析、细菌和真菌鉴定等应用。
Illumina Microbial Amplicon Prep
一款灵活、一体化的NGS文库制备试剂盒，适用于多种公共卫生监测和微生物研究应用。
< 9小时
分析时间
48个样本约3小时
手动操作时间
因样本来源而异
起始量
概述
拓展微生物研究能力
在任何规模下都能获得兼具出色的数据质量和准确性的测序结果，并缩短手动操作时间。
该试剂盒可与各种定制、已发布或市售的引物集（不包括引物寡核苷酸）配合使用，并且与提取自培养物、拭子（鼻咽、皮肤和鼻腔）、废水等样本的RNA或DNA兼容。可使用Basespace Sequence Hub上的DRAGEN Targeted Microbial App和预加载的靶标进行数据分析，此外，还可以轻松上传文件进行自定义分析。
规格
| 分析时间 | < 9小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 说明 | Illumina Microbial Amplicon Prep（IMAP）是一种基于扩增子的文库制备解决方案，包含48个样本的RT-PCR、文库制备和标签。它基于与COVIDSeq相同的化学技术，可用于DNA和RNA样本。试剂盒中未包含寡核苷酸引物，需单独购买。 |
| 手动操作时间 | 48个样本约3小时 |
| 起始量 | 因样本来源而异 |
| 系统 | MiSeq 系统, iSeq 100系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000系统 |
| 作用机制 | 多重PCR |
| 方法 | 扩增子测序 |
| 核酸类型 | DNA, RNA |
| 样本类型详情 | 可处理从鼻拭子到废水等各种类型的样本 |
| 物种 | 其他, 酵母, 病毒, 细菌 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 单核苷酸位点变异（SNV） |
应用
工作流程示例
制备
Illumina Microbial Amplicon Prep
相关应用和方法
了解通过新一代测序进行的污水监测，以实现对传染病的社区级监测、突变追踪以及变异趋势监测。
NGS通过识别新型冠状病毒及其他新发传染病病原体的新毒株，支持有效的基因组监测策略。
对PCR扩增子进行超深度测序能够分析特定感兴趣的基因组区域。了解有关扩增子测序的更多信息，并寻找全面的解决方案。
文档
支持文档
Illumina测试的实验方案
- 基孔肯雅热1
- 登革热1
- 痘1
- RSV1
- 寨卡病毒1
客户证明的实验方案*
- 登革热I-IV2 （protocols.io/view/dengueseq-a-pan-serotype-whole-genome-amplicon-seq-kqdg39xxeg25/v3）
- 肿块性皮肤病3 （doi.org/10.1007/s00705-023-05705-w）
- Mpox4 （protocols.io/view/monkeypox-virus-multiplexed-pcr-amplicon-sequencin-5qpvob1nbl4o/v4）
- RSV5 （protocols.io/view/whole-genome-amplification-of-respiratory-syncytia-eq2lyjzbrlx9/v2）
- SARS-CoV-2 ARTIC v5.3.26 （community.artic.network/t/sars-cov-2-version-5-3-2-scheme-release/462）
- 狂犬病7 （protocols.io/view/rabies-virus-bat-clade-sequencing-8epv5x3bng1b/v1）
*方案仅供参考。这并不意味着Illumina验证或支持实验方案。
参考文献
1. Illumina。2023年9月8日从 Illumina Microbial Amplicon Prep获取，用于病毒监测
2. DengueSeq：登革热病毒V.2的泛血清型全基因组扩增子测序方案。2023年9月8日访问www https://www.protocols.io/view/dengueseq-a-pan-serotype-whole-genome-amplicon-seq-kqdg39xxeg25/v2
3. Bhatt L、Bhoyar RC、Jolly B、Israni R、Vignesh H、Scaria V、Sivasubbu S。印度爆发的块状皮肤病病毒的 基因组序列表明该病毒具有独特的谱系。Arch Virol. 2023年2月5日；168（3）：81. doi：10.1007/s00705-023-05705-w.
4. 猴痘病毒多重PCR扩增子测序（PrimalSeq）V.4. 2023年9月8日访问www https://www.protocols.io/view/monkeypox-virus-multiplexed-pcr-amplicon-sequencin-5qpvob1nbl4o/v4?step=2
5. 使用Illumina CovidSeq试剂进行新一代测序V.2的呼吸道合胞病毒（RSV） 全基因组扩增。2023 年 9 月 8 日访问，请访问 https://www.protocols.io/view/whole-genome-amplification-of-respiratory-syncytia-eq2lyjzbrlx9/v2
6. SARS-CoV-2 v 5.3.2方案发布。2023年9月12日访问www https://community.artic.network/t/sars-cov-2-version-5-3-2-scheme-release/462
7. 狂犬病病毒蝙蝠进化枝测序。2023年10月30日，访问www https://www.protocols.io/view/rabies-virus-bat-clade-sequencing-8epv5x3bng1b/v1
Illumina Microbial Amplicon Prep
20097857
包含cDNA转化、文库制备和标签的48样本扩增子试剂盒。不包括引物。
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MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，经过优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
COVIDSeq Assay (96样本)
这种低通量至中通量的NGS检测让任何规模的实验室能够识别并追踪新型SARS-CoV-2变异的出现和流行情况。
Illumina RNA Prep with Enrichment
快速、集成的工作流程，针对各种样本类型和RNA起始量生成富集并标记的测序文库。
Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit
简化的工作流程，可高度灵敏地检测和表征常见的呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2毒株。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
文库制备和富集试剂盒，可提供高度灵敏、全面的呼吸道病原体鉴定和抗菌素耐药性见解。
Viral Surveillance Panel v2
对＞200种病毒和亚型进行全基因组测序和表征，包括SARS-CoV-2、流感病毒、虫媒病毒和肝炎，并进行靶向富集。
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