订购NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Illumina Microbial Amplicon Prep（IMAP）是一款基于扩增子的文库制备试剂盒，采用的化学技术与COVIDSeq一致。利用该试剂盒可迅速、简单地完成文库制备，所得文库与几乎所有因美纳测序系统兼容。它适用于各种传染性疾病、公共卫生监测和微生物研究应用，包括病毒全基因组测序、抗菌药物耐药性标志物分析、细菌和真菌鉴定等应用。
Illumina Microbial Amplicon Prep
一款灵活、一体化的NGS文库制备试剂盒，适用于多种公共卫生监测和微生物研究应用。
< 9小时
分析时间
48个样本约3小时
手动操作时间
因样本来源而异
起始量
概述
扩展您的微生物研究能力
以低手动操作时间，在任何规模获得出色的数据质量和准确性的测序结果。
该试剂盒可与各种定制、已发布或市售的引物集（不包括引物寡核苷酸）配合使用，并且与提取自培养物、拭子（鼻咽、皮肤和鼻腔）、废水等样本的RNA或DNA兼容。可使用Basespace Sequence Hub上的DRAGEN Targeted Microbial App和预加载的靶标进行数据分析，此外，还可以轻松上传文件进行自定义分析。
性能参数
| Automation capability | Liquid Handling Robots |
|---|---|
| Method | Amplicon Sequencing |
| Variant class | Single nucleotide variants (SNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs) |
| 作用机制 | 多重PCR |
| 分析时间 | < 9小时 |
| 手动操作时间 | 48个样本约3小时 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 样本类型详情 | 可处理从鼻拭子到废水等各种类型的样本 |
| 核酸类型 | DNA, RNA |
| 物种 | Other, Yeast, Virus, Bacteria |
| 系统 | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System |
| 说明 | Illumina Microbial Amplicon Prep（IMAP）是一种基于扩增子的文库制备解决方案，包含48个样本的RT-PCR、文库制备和标签。它基于与COVIDSeq相同的化学技术，可用于DNA和RNA样本。试剂盒中未包含寡核苷酸引物，需单独购买。 |
| 起始量 | 因样本来源而异 |
应用
工作流程示例
制备
Illumina Microbial Amplicon Prep
相关应用和方法
了解废水监测如何有助于在社区层面开展新发传染性疾病监测、突变追踪和变异趋势追踪。
NGS supports effective genomic surveillance strategies through identification of novel strains of coronavirus and other emerging infectious disease agents.
PCR扩增子的超深度测序能够分析感兴趣的特定基因组区域。深入了解扩增子测序并查找全面的解决方案。
文档
支持文档
Illumina测试的实验方案
- 基孔肯雅热1
- 登革热1
- 痘1
- RSV1
- 寨卡病毒1
客户证明的实验方案*
- 登革热I-IV2 （protocols.io/view/dengueseq-a-pan-serotype-whole-genome-amplicon-seq-kqdg39xxeg25/v3）
- 肿块性皮肤病3 （doi.org/10.1007/s00705-023-05705-w）
- Mpox4 （protocols.io/view/monkeypox-virus-multiplexed-pcr-amplicon-sequencin-5qpvob1nbl4o/v4）
- RSV5 （protocols.io/view/whole-genome-amplification-of-respiratory-syncytia-eq2lyjzbrlx9/v2）
- SARS-CoV-2 ARTIC v5.3.26 （community.artic.network/t/sars-cov-2-version-5-3-2-scheme-release/462）
- 狂犬病7 （protocols.io/view/rabies-virus-bat-clade-sequencing-8epv5x3bng1b/v1）
*方案仅供参考。这并不意味着Illumina验证或支持实验方案。
参考文献
1. Illumina。2023年9月8日从 Illumina Microbial Amplicon Prep获取，用于病毒监测
2. DengueSeq：登革热病毒V.2的泛血清型全基因组扩增子测序方案。2023年9月8日访问www https://www.protocols.io/view/dengueseq-a-pan-serotype-whole-genome-amplicon-seq-kqdg39xxeg25/v2
3. Bhatt L、Bhoyar RC、Jolly B、Israni R、Vignesh H、Scaria V、Sivasubbu S。印度爆发的块状皮肤病病毒的 基因组序列表明该病毒具有独特的谱系。Arch Virol. 2023年2月5日；168（3）：81. doi：10.1007/s00705-023-05705-w.
4. 猴痘病毒多重PCR扩增子测序（PrimalSeq）V.4. 2023年9月8日访问www https://www.protocols.io/view/monkeypox-virus-multiplexed-pcr-amplicon-sequencin-5qpvob1nbl4o/v4?step=2
5. 使用Illumina CovidSeq试剂进行新一代测序V.2的呼吸道合胞病毒（RSV） 全基因组扩增。2023 年 9 月 8 日访问，请访问 https://www.protocols.io/view/whole-genome-amplification-of-respiratory-syncytia-eq2lyjzbrlx9/v2
6. SARS-CoV-2 v 5.3.2方案发布。2023年9月12日访问www https://community.artic.network/t/sars-cov-2-version-5-3-2-scheme-release/462
7. 狂犬病病毒蝙蝠进化枝测序。2023年10月30日，访问www https://www.protocols.io/view/rabies-virus-bat-clade-sequencing-8epv5x3bng1b/v1
Illumina Microbial Amplicon Prep
20097857
包含cDNA转化、文库制备和标签的48样本扩增子试剂盒。不包括引物。
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MiSeq Reagent Kit v3
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
COVIDSeq Assay（96个样本）
这种中低通量NGS检测使任何规模的实验室都能识别和追踪新型SARS-CoV-2变异的出现和流行。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
文库制备和富集试剂盒，可提供高度灵敏、全面的呼吸道病原体鉴定和抗菌素耐药性见解。
Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit
简化的工作流程可对包括SARS-CoV-2毒株在内的常见呼吸道病毒进行高度灵敏的检测和表征。
Viral Surveillance Panel
通过靶向富集对66种病毒进行全基因组测序和表征，包括SARS-CoV-2、流感和脊髓灰质炎。
Illumina RNA Prep with Enrichment
一种快速、集成的工作流程，用于从各种样本类型和RNA起始量中制备富集和标签测序文库。
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