NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Urinary Pathogen ID/AMR Panel（UPIP）是一款新一代测序（NGS）研究试剂盒，能够检测和定量超过170种引起尿路感染（UTI）和合并感染的尿路病原体，涵盖超过3700种与抗菌药物耐药性（AMR）相关的标志物及其等位基因。
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
文库制备和富集试剂盒，可对常见和未充分识别的尿路病原体和AMR基因进行灵敏、无需培养的检测和分析。
文库制备和富集时间＜9小时
分析时间
文库制备和富集时间＜2小时
手动操作时间
基于体积（非浓度依赖性）
起始量
概述
主要特点
一体化的工作流程
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit包含所有文库制备和富集试剂、标签和探针，用于磁珠上酶切法片段化，然后是用于生成富集文库的单个杂交步骤。将富集试剂盒与DNA提取、测序和Explify UPIP数据分析相结合，为UTI的检测和鉴定提供了一个全面而简单的工作流程。
规格
| 分析时间 | 文库制备和富集时间＜9小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | 液体处理机器人 |
| 内容说明 | 检测120多种细菌、14种真菌、35种病毒、4种寄生虫，包括27种性传播病原体和>3700种抗菌药物耐药性标记 |
| 说明 | 整合DNA提取、使用Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit进行文库制备、测序和Explify UPIP数据分析的一体化工作流程，用于检测和鉴定各种样本类型的尿路病原体和抗菌素耐药性标记。 |
| 手动操作时间 | 文库制备和富集时间＜2小时 |
| 起始量 | 基于体积（非浓度依赖性） |
| 系统 | MiSeq 系统, NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq基因测序仪, 研究模式下的NextSeq 550Dx |
| 作用机制 | 磁珠上酶切法片段化，然后进行单个杂交步骤 |
| 方法 | 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | 使用唯一双标签，单次运行最多可分析384个样本 |
| 核酸类型 | DNA |
| 样本类型详情 | 从人类泌尿系统临床研究样本和其他监测相关样本中提取的DNA，如废水 |
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE |
| 物种 | 其他, 人, 病毒, 细菌 |
| 物种详情 | 真菌、寄生虫 |
| 技术 | Illumina测序 |
需要的产品
无需配件。
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结果
应用
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit用于检测和鉴定170多种尿路病原体和3700多种抗菌素耐药性标记及其等位基因，这些标记及其等位基因来自临床泌尿研究、环境和其他样本类型。
特色工作流程
制备
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
分析
项目建议
相关应用和方法
图
Urinary Pathogen ID/AMR Panel上覆盖的微生物
Urinary Pathogen ID/AMR Panel Kit可检测和定量174种生物，包括常见和不常见的尿路病原体和27种性传播病原体。
敏感病原体检测
与鸟枪法宏基因组学（SM）和培养方法相比，Urinary Pathogen ID/AMR Panel（UPIP）Kit提供了更灵敏的病原体鉴定。通过UPIP在342/399（86%）个尿液样本中检测到一种或多种尿路病原体，通过SM在262/399（66%）个样本中检测到一种或多种尿路病原体，通过尿培养在205/399（51%）个样本中检测到一种或多种尿路病原体。
提高分析灵敏度
UPIP测得的SM阳性细菌负荷高于SM阴性样本（p＜0.0001），这与预测靶向富集测序的分析灵敏度高于SM一致。与鸟枪法宏基因组学相比，检测SM阴性样本中的细菌进一步证明了富集的灵敏度更高。
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set A (RUO)（96标签，96样本）
20090308
包括文库制备和富集所需的所有试剂，包括酶切法片段化和PCR试剂、IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A和Urinary Pathogen ID/AMR Panel，可从96个样本制备文库，然后进行32次3重富集反应。
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set B (RUO)（96标签，96样本）
20090309
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit（UPIP）包含用于靶向3，500种抗菌素耐药性（AMR）标记、121种细菌、14种真菌、35种病毒和4种寄生虫的所有文库制备试剂、标签和panel。结合Illumina DNA prep with Enrichment试剂盒和BaseSpace Sequence Hub上的UPIP Explify应用程序进行分析，UPIP富集panel可广泛检测泌尿系统病原体并分析AMR，以鉴定混合合并感染。试剂盒包含文库制备试剂、标签（Set B）和panel，可使用UPIP Explify应用程序制备3重96个样本并进行分析。
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set C (RUO)（96标签，96样本）
20090310
包括文库制备和富集所需的所有试剂，包括酶切法片段化和PCR试剂、IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set C和Urinary Pathogen ID/AMR Panel，可从96个样本制备文库，然后进行32次3重富集反应。
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set D (RUO)（96标签，96样本）
20090311
包括文库制备和富集所需的所有试剂，包括酶切法片段化和PCR试剂、IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set D和Urinary Pathogen ID/AMR Panel，可从96个样本制备文库，然后进行32次3重富集反应。
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常见问题解答
不需要，无需在提取DNA之前培养样本。Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit包含所有文库制备和富集试剂、标签和panel探针，用于磁珠上酶切法片段化，然后进行单个杂交步骤，为生成富集文库进行测序提供了快速的工作流程。
我们建议使用离心柱试剂盒分离DNA，因为这些试剂盒是最可靠的，通常用于NGS。有关Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit的DNA提取方案，请点击此处。
无论病原体类型如何，文库制备和测序步骤都可以在两天内在台式测序系统上完成。但是，在测序过程中使用MiniSeq测序系统和MiniSeq Rapid Reagent Kit时，检测可在＜24小时内完成。
该试剂盒中的panel包含可识别10种不同市售对照品的探针。但是，这些对照品不作为本试剂盒的一部分提供，必须单独购买，然后在提取DNA和RNA之前加标到样本中。每个实验/样本只需要一个加标对照品。
我们通常建议从每个样本1M单端read开始，或使用至少1 × 100 bp或2M × 100 bp的测序化学技术进行2M双端read。这些数字只是起点，应根据样本类型和目标丰度进行优化。
是的。如果此panel中涵盖的靶标与您的实验目标一致，您可以使用从各种样本类型中提取的DNA。通常使用此试剂盒检测废水样本，以监测这些病原体及其相关AMR。对于废水样本，我们通常建议将read数量增加到10M单端read或20M双端read。
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结果
MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
NextSeq 500/550 v2.5试剂盒
与早期版本相比，v2.5试剂盒使用弹性流动槽，可保持起始荧光强度，具有更高的稳定性和性能。
MiniSeq试剂盒
MiniSeq基因测序仪试剂盒采用即用型卡盒和双通道SBS化学技术，即使样本量较少也能实现经济高效的测序。
MiSeq v3试剂盒
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
文库制备和富集试剂盒，可提供高度灵敏、全面的呼吸道病原体鉴定和抗菌素耐药性见解。
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