Infinium Global Screening Array-24 Kit

基因分型芯片为群体遗传学、药物基因组学研究和精准医学研究提供了一种可扩展、经济高效的解决方案。

每周约5760个样本

样本通量

每张芯片24个样本

样本数量

654,027个固定标记。自定义标记附加功能: 高达100K 

标志物数量

详情请参见规格表

概述

Infinium Global Screening Array-24 BeadChip是一款先进、可扩展且经济高效的群体规模遗传研究解决方案。

主要特点

  • 选择多种族全基因组内容,在所有26 1000个基因组项目中实现>1%的高填补准确性

  • 每周对数百至数千个样本进行高通量处理,3天的工作流程用于群体规模的研究

  • 临床研究应用包括疾病风险分析研究、药物基因组学研究、健康表征和复杂疾病发现

优化的全球人群内容

v3.0中的临床研究内容包括具有已确定疾病关联的变异、相关药物基因组学标志物,以及源自ClinVar、NHGRI、PharmGKB和ExAC数据库的精选外显子内容。

广泛采用

研究人员、医疗保健网络、消费者基因组学公司和基因组服务提供商已经订购了超过1500万个Global Screening Array样本。

广泛的应用

世界各地的精准医疗研究计划利用Global Screening Array来研究疾病风险,对样本进行分层,并激励人们参与各种临床应用。


性能参数


所需产品

选择与每次运行的样本数量相匹配的试剂盒大小。每个试剂盒均按单批次处理,不可用于多个实验。如果要处理多个低通量批次,请订购多个小型试剂盒。

您可以选择使用DesignStudio Microarray Assay Designer 自定义您的内容,也可以从联盟助推器提供的附加内容列表中选择。Booster附加内容可用于:

  • 多种疾病(约50,000个SNP)

  • 常见精神疾病(约30,000个SNP)

  • 直接面向消费者的健康和生活方式(约28,000个SNP)

  • 肿瘤学(约90,000个SNP) 

请咨询您的销售代表,确认供货情况和定价。

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应用

Infinium Global Screening Array-24是一款功能强大且经济高效的BeadChip芯片,适用于群体规模的遗传研究、变异筛查和精准医疗研究。它涵盖了广泛的疾病,能够验证疾病关联、风险分析、抢先筛查研究和药物基因组学研究。

工作流程示例

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选择内容

Infinium Global Screening Array-24 Kit

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3
追踪、分析和报告

相关应用和方法

比较

Infinium Global Screening Array-24 Kit Infinium Global Diversity Array-8 Kit Infinium Asian Screening Array-24 Kit Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24
Assay type Infinium HTS Infinium LCG Infinium HTS
Automation capability Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader
Method Genome-Wide Genotyping Array, High-Throughput Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array, High-Throughput Genotyping Array High-Throughput Genotyping Array, Cytogenomic Array
Specialized sample types FFPE Tissue, Buccal Swabs, Blood, Saliva FFPE Tissue, Buccal Swabs, Blood, Saliva FFPE Tissue, Blood FFPE Tissue, Buccal Swabs, Blood, Saliva
Variant class Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Loss of heterozygosity (LOH) Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH)
技术 Illumina芯片 Illumina芯片 Illumina芯片 Illumina芯片
标志物数量

654,027个固定标记。自定义标记附加功能: 高达100K 

1,825,277个固定标记。定制标记物扩展容量:高达175K

固定标记物:约660,000,定制标记物扩展容量可达50,000
样本数量 每张芯片24个样本 每个芯片8个样本 每张芯片24个样本 每张芯片24个样本
样本通量 每周约5760个样本 每周约1728个样本

约2304个样本/周(估计假设1个iScan系统、1个AutoLoader、2个Tecan机器人,每周工作5天) 

核酸类型 DNA DNA DNA DNA
物种
系统 iScan iScan iScan iScan
说明

Infinium Global Screening Array-24 Kit是用于群体规模遗传学、转化研究、变异筛查研究和精准医学研究的经济型基因分型芯片,结合了优化的多种族全基因组内容、精选的临床研究变异和QC标记。

8样本的Infinium Diversity Array为整个基因组的4800多个关键基因提供了目标区域覆盖度。BeadChip中包含约180万个标记物,可高度覆盖疾病相关区域的外显子,提供高度准确的拷贝数变异检出,平均分辨率为1.5 Mb。

先进的基因分型芯片,为东亚和东南亚人群的群体规模遗传研究、变异筛查和精准医疗研究提供了高价值、可扩展且经济高效的解决方案。 

24样本Infinium Global Screening Array with Cytogenetics-24可靶向覆盖整个基因组中的4800多个关键基因。BeadChip芯片上包含约700K个标记,可在疾病相关区域实现高外显子覆盖度,提供高度准确的拷贝数变异检出,平均分辨率为2.5 Mb。
起始量 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng gDNA 200 ng DNA

选择工具:

Infinium Global Screening Array内容

内部饼图显示了选择用于全基因组覆盖、临床研究和质量控制(QC)的芯片的比例。外环显示1kGP中存在的唯一变异的加权参考全局等位基因频率。1未标记1kGP中的变异。计数代表唯一变异。

Global Screening Array上的临床研究内容

临床研究内容是由专家从科学界公认的数据库中挑选的,用于为临床研究应用创建一款信息量大的芯片。变异数量可能会有变化。

Global Screening Array上广泛的药物基因组学内容

根据CPIC指南和PharmGKB数据库选择。2PGx公共数据库变异,在PharmGKB、PharmVar、CPIC中注释的变异;全基因组PGx覆盖度,包括位于扩展ADME基因或CPIC A级基因中的标记,包括靶向填补标签SNP和CPIC A级CNV标签。

Global Screening Array涵盖广泛的疾病类别

Global Diversity Array临床研究内容包含基于NHGRI数据库的多种疾病类别的标记。

(A) 根据ClinVar美国医学遗传学会(ACMG)注释按病理学分类范围分类的变异。

(B) ClinVar数据库中按类别划分的全球多样性芯片临床研究内容。变异计数可能会发生变化。 

相关资源

缩略图

了解经济高效的高通量Infinium芯片支持的群体规模应用。

固定内容 (3)

Infinium Global Screening Array-24 v3.0 Kit (48 Samples)

20030770

Infinium Global Screening Array-24 v3.0结合了高度优化的通用全基因组骨架、专家精选的临床研究变异和样本追踪内容,为群体规模的基因组学和筛查创建了经济的芯片。每个试剂盒内有2个BeadChip芯片和可用于48个DNA样本的扩增、片段化、杂交、标记和检测试剂。

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Infinium Global Screening Array-24 v3.0 Kit (288 Samples)

20030771

Infinium Global Screening Array-24 v3.0结合了高度优化的通用全基因组骨架、专家精选的临床研究变异和样本追踪内容,为群体规模的基因组学和筛查创建了经济的芯片。每个试剂盒包含12个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测288个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Screening Array-24 v3.0 Kit (1152 Samples)

20030772

Infinium Global Screening Array-24 v3.0结合了高度优化的通用全基因组骨架、专家精选的临床研究变异和样本追踪内容,为群体规模的基因组学和筛查创建了经济的芯片。每个试剂盒包含48个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测1152个DNA样本的试剂。

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附加内容 (5)

Infinium Global Screening Array-24+ v3.0 Kit (48 Samples)

20030773

Infinium Global Screening Array-24 v3.0将专家精选和相关临床研究变异与覆盖全球人群的强大全基因组骨架相结合,为群体规模的基因组学和筛查创建了经济的芯片。每个试剂盒包含2个可定制的BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测48个DNA样本的试剂

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Infinium Global Screening Array-24+ v3.0 Kit (288 Samples)

20030774

Infinium Global Screening Array-24+ v3.0 Kit(288样本)

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Infinium Global Screening Array-24+ v3.0 Kit (1152 Samples)

20030775

Infinium Global Screening Array-24 v3.0将专家精选和相关临床研究变异与覆盖全球人群的强大全基因组骨架相结合,为群体规模的基因组学和筛查创建了经济的芯片。每个试剂盒包含48个可定制的BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测1152个DNA样本的试剂。

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Infinium HTSE GSA-24+ v3.0(4,608 Spl)

20034098

Infinium HTSE GSA-24+ v3.0(4,608 Spl)

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Infinium HTSE GSA-24+ v3.0(23,040 Spl)

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Infinium HTSE GSA-24+ v3.0(23,040 Spl)

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服务 (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

在客户现场提供为期三天的实践指导,帮助用户熟悉Infinium实验方案的基本步骤。本课程提供了有关样本和BeadChip制备、使用iScan系统进行样本扫描以及使用芯片分析软件进行原始数据评估和分析的实践培训。

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常见问题解答

Global Screening Array是新一代基因分型芯片,结合了经过优化的多种族全基因组内容和临床研究变异,用于群体规模的遗传学和筛查研究。

Infinium Global Screening Array-24 BeadChip第3版仅供研究使用。它利用了来自ClinVar、CPIC和PharmGKB的最新和相关临床研究筛查标志物。

Infinium Global Screening Array采用高度可扩展的Infinium HTS格式,每周可对数百至数千个样本进行灵活的通量处理。这种格式提供了快速的3天工作流程,手动操作时间最短。

Infinium检测是一种高通量SNP分析化学技术,可用于基因分型和甲基化研究的SNP鉴定。Infinium芯片产品已被多家领先机构用于群体规模的基因分型、表观基因组关联研究、精准医疗研究和其他应用。深入了解 Illumina芯片技术。或探索芯片试剂盒

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与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

参考文献
  1. 千人基因组计划。http://www.1000genomes.org。Accessed May 20, 2020.
  2. PharmGKB,药物基因组学知识库。www.pharmgkb.org。Accessed May 20, 2020.

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