BovineLD Genotyping BeadChip

利用这一专家设计的基因分型芯片,可将基因组选择扩展到整个畜群,并以经济实惠的价格提供可扩展的内容。Read More...
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BovineLD v2.0 BeadChip(48样本)

WG-451-2001

BovineLD v2.0 BeadChip+(48样本)

WG-451-2011

BovineLD v2.0 BeadChip(288样本)

WG-451-2002

BovineLD v2.0 BeadChip+(288样本)

WG-451-2012

BovineLD v2.0 BeadChip(1152样本)

WG-451-2003

BovineLD v2.0 BeadChip+(1152样本)

WG-451-2013

Product Highlights

BovineLD BeadChip芯片试剂盒实现了准确的基因分型,有助于了解基因对产奶量、繁殖、健康及其他方面的影响。该试剂盒以实惠的价格提供可扩展的专家精选内容,可将基因组选择扩展到整个畜群。该芯片具备:

  • 强大的推断工具,可准确估计基因组的育种价值
  • 高检出率,经证明推断效率可达98%以上
  • 以专业水准选择的内容,可扩展至多达80,000个定制标记物
  • 包括ISAG牛亲缘鉴定panel中的全部200个SNP(100个核心SNP和100个其他SNP)
  • 可平行检测多达24个样本
高性价比的畜群基因分型

BovineLD v2.0 BeadChip结合Infinium BovineSNP50 BeadChipInfinium BovineHD BeadChipiSelect Custom BeadChip,共同构成了全面的基因分型产品组合,育种人员可据此来对遗传变异进行特征分析并准确地估计基因组的育种价值。

虽然BovineHD和BovineSNP50 BeadChip也能够很好地检测出高价值动物体内的遗传变异并支持全基因组研究,但BovineLD v2.0 BeadChip还能对低价值动物进行高性价比的基因分型。

高推断准确性

SNP经过了精心挑选,可靠性经过了验证,平均等位基因频率(MAF)高,且在牛基因组中均匀分布,并对全球多种奶牛品种有着卓越的推断性能。BovineLD v2.0 BeadChip上的7,931个SNP在多个品种上经过了严格的功能测试,确保其出色的性能。Illumina保证每个BovineLD BeadChip对普通奶牛和肉牛品种的平均检出率高于99%。

出色的可扩展内容

Illumina联手全球牛畜农业的思想领袖,共同开发了BovineLD联盟的BovineLD v2.0 BeadChip。Illumina科学家和合作者参考了BovineSNP50 BeadChip所生成的历史数据,识别出了全球奶牛品种中可提高推断效率的最佳SNP内容。1

通过计算机模拟测试,已确定可通过优化靶向品种的MAF和以染色体末端的高标记物密度在整个牛基因组中均匀排布SNP来实现最高推断效率。内容覆盖所有染色体,包括X染色体、已知Y染色体单倍型和线粒体DNA。

高通量形式

Infinium实验分析方法支持此多样本基因分型panel,具备高检出率和出色的重现性。该实验分析方法的无PCR单管样本制备功能可显著减少工作量和潜在样本处理错误。2,3多样本的形式使得育种人员可平行检测多达24个样本,从而进一步减少实验变数和项目总成本。

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案例研究

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参考文献
  1. Boichard D, Chung H, Dassonneville R, et al.Design of a bovine low-density SNP array optimized for imputation.PLoS One.2012;7:e34130.
  2. Gunderson KL, Steemers FJ, Lee G, Mendoza LG, Chee MS (2005) A genome-wide scalable SNP genotyping assay using microarray technology.Genet 37: 549–554.
  3. Steemers FJ, Chang W, Lee G, Barker DL,Shen R, et al.(2006) Whole-genome genotyping with the single-base extension assay.Nat Methods 3: 31–33.