TruSight Oncology UMI Reagents
使用唯一分子标记（UMI）对新一代测序文库进行误差修正。
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这些试剂减少了测序数据中的背景噪声，能够检测低频变异，如在细胞游离DNA (cfDNA)中发现的变异。
循环肿瘤DNA (ctDNA)可能代表cfDNA的一个非常小的部分，接近下一代测序(NGS)的检测极限。TruSight肿瘤学UMI试剂通过UMIs和纠错软件解决了这一挑战，将错误率降低到0.007%，并能够检测低频变异。较低的错误率增加了分析的特异性，从而提高了NGS数据的可信度。
TruSight肿瘤学UMI试剂包括UMI适配器和标签，以及DNA文库准备和富集试剂。这些试剂也可以与TruSight Tumor 170 DNA寡核苷酸配对。UMIs的集成不会在库准备工作流程中创建任何额外的步骤。
UMI纠错应用程序对读取数据进行对齐，然后使用UMI排除误报，减少变异调用错误。UMI纠错应用可以在基于云的BaseSpace Sequence Hub中使用，也可以在本地安装。
为了准确检测罕见变异，将UMI与误差修正软件集成，能够将真正的突变与背景噪声区分开来。下图说明了通过消除导致假阳性的固有错误来降低错误率，如何可以将真正的突变（红点）与背景噪声（灰点）更好地区分开来。
| 测序运行 | 平均错误率（未拆分的read） | 平均错误率（拆分的read） |
|---|---|---|
| 1 | 0.038% | 0.0023% |
| 2 | 0.043% | 0.0024% |
| 3 | 0.035% | 0.0024% |
| 4 | 0.084% | 0.0019% |
将TruSight Oncology UMI Reagent与TruSight Tumor 170 DNA检测中的DNA内容结合进行文库制备，并将31个样本分配至HiSeq 4000系统上的四个独立测序运行中。显示了使用UMI Error Correction App时未拆分和拆分read的平均错误率。
Detection of low-frequency variants in cfDNA using TruSight Tumor 170 with the TruSight UMI Toolkit
Application Note | PDF 2 MB
Application Note | PDF 2 MB
Options for Circulating cfDNA Control Materials with NGS Analysis
Technical Note | PDF < 1 MB
TruSight Oncology UMI Reagents
Data Sheet | PDF < 1 MB
TruSight Oncology UMI Reagents Support - Documentation & Literature
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* NovaSeq 6000系统的性能已得到证明，但未经过广泛测试。
