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TruSight Oncology UMI Reagent

使用唯一分子标记（UMI）对新一代测序文库进行误差修正。

1.5天

分析时间

5小时

手动操作时间

30 ng游离DNA

起始量

详情请参见规格表

概述

这些试剂降低了测序数据中的背景噪声，能够检测低频变异，例如游离DNA（cfDNA）中的变异。

降低错误率

循环肿瘤DNA（ctDNA）可能代表cfDNA的极小部分，接近新一代测序（NGS）的检测限。TruSight Oncology UMI Reagent通过UMI和错误校正软件解决了这一挑战，将错误率降低至＜0.007%，并能够检测低频变异。较低的错误率增加了分析特异性，导致NGS数据的置信度更高。

工作流程集成

TruSight Oncology UMI Reagent包括UMI接头和标签，以及DNA文库制备和富集试剂。这些试剂还可以与TruSight Tumor 170 DNA寡核苷酸配对。集成UMI不会在文库制备工作流程中创建任何额外步骤。

用于纠错的直观软件

UMI Error Correction App进行比对read，然后使用UMI排除假阳性，减少变异检出错误。UMI Error Correction App在基于云的BaseSpace Sequence Hub中可用，也可用于本地安装。

查看整个TruSight Oncology产品系列

规格

分析时间 1.5天
癌症类型 泛癌种
手动操作时间 5小时
起始量 30 ng游离DNA
系统 NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NovaSeq 6000系统
方法 靶向DNA测序
核酸类型 DNA
特殊的样本类型 不兼容FFPE, 游离DNA
物种 人
技术 Illumina测序

需要的产品

 

TruSight Oncology UMI Reagent不含任何富集探针。如果您想使用TruSight Tumor 170 DNA探针组，请单独购买TruSight Tumor 170 Content Set。

为方便起见，TruSight cfDNA 仪器套装包含生成文库和在所选仪器上以推荐的测序深度对 48 个样本进行测序所需的所有试剂。

/ 结果

应用

工作流程示例

1
制备

TruSight Oncology UMI Reagent

TruSight Tumor 170
2
测序
3
分析
BaseSpace Sequence Hub中的UMI Error Correction App

Local UMI Error Correction App

请联系您当地的因美纳支持团队以访问Local UMI Error Correction App。

*NovaSeq 6000系统的性能已得到证明，但未经过广泛测试。

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文档

产品资料
支持文档

图

背景减少有助于准确检出变异

为了准确检测罕见变异，将UMI与误差修正软件集成，能够将真正的突变与背景噪声区分开来。下图说明了通过消除导致假阳性的固有错误来降低错误率，如何可以将真正的突变（红点）与背景噪声（灰点）更好地区分开来。

使用UMI降低错误率

使用TruSight Oncology UMI Reagent与TruSight Tumor 170 DNA检测的DNA内容配对进行文库制备。在HiSeq 4000系统上，在四次独立测序运行中分配了31个样本。显示了使用UMI Error Correction App时未拆分和拆分read的平均错误率。

测序运行 平均错误率（未拆分的read） 平均错误率（拆分的read）
1 0.038% 0.0023%
2 0.043% 0.0024%
3 0.035% 0.0024%
4 0.084% 0.0019%

TruSight Oncology UMI Reagents (16 indexes, 48 samples)

20024586

包含TruSight Oncology DNA文库制备和富集试剂以及TruSight UMI工具包。提供足够的试剂，用于生成48个含UMI的文库，包含16个唯一标签对。用于生成错误率较低的文库，能够检测低频变异。不含富集探针——TST170内容可单独购买。

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TruSight® Tumor 170 Content Set

20010188

TST170试剂盒中170个基因的DNA和RNA探针。

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