TruSight Oncology UMI Reagents

使用唯一分子标记(UMI)对新一代测序文库进行误差修正。 阅读更多...
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TruSight Oncology UMI Reagents (16个标签,48个样本)

20024586

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TruSight® Tumor 170内容集

20010188

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20023394

适用于HiSeq 4000的TruSight cfDNA UMI(48个样本)

20023395

适用于NovaSeq S2的TruSight cfDNA UMI(48个样本)

20023396

产品特色

这些试剂减少了测序数据中的背景噪声,能够检测低频变异,如在细胞游离DNA (cfDNA)中发现的变异。

减少错误率

循环肿瘤DNA (ctDNA)可能代表cfDNA的一个非常小的部分,接近下一代测序(NGS)的检测极限。TruSight肿瘤学UMI试剂通过UMIs和纠错软件解决了这一挑战,将错误率降低到0.007%,并能够检测低频变异。较低的错误率增加了分析的特异性,从而提高了NGS数据的可信度。

工作流集成

TruSight肿瘤学UMI试剂包括UMI适配器和标签,以及DNA文库准备和富集试剂。这些试剂也可以与TruSight Tumor 170 DNA寡核苷酸配对。UMIs的集成不会在库准备工作流程中创建任何额外的步骤。

直观的纠错软件

UMI纠错应用程序对读取数据进行对齐,然后使用UMI排除误报,减少变异调用错误。UMI纠错应用可以在基于云的BaseSpace Sequence Hub中使用,也可以在本地安装。

请参阅TruSight整个肿瘤产品系列

Frequently Purchased Together

规格

具体的方法工作流程范例

 

支持数据和图像

背景减少有助于获得准确的变异检出
Background Reduction Facilitates Accurate Variant Calling

为了准确检测罕见变异,将UMI与误差修正软件集成,能够将真正的突变与背景噪声区分开来。下图说明了通过消除导致假阳性的固有错误来降低错误率,如何可以将真正的突变(红点)与背景噪声(灰点)更好地区分开来。

 
使用UMI降低错误率
测序运行 平均错误率(未拆分的read) 平均错误率(拆分的read)
1 0.038% 0.0023%
2 0.043% 0.0024%
3 0.035% 0.0024%
4 0.084% 0.0019%

将TruSight Oncology UMI Reagent与TruSight Tumor 170 DNA检测中的DNA内容结合进行文库制备,并将31个样本分配至HiSeq 4000系统上的四个独立测序运行中。显示了使用UMI Error Correction App时未拆分和拆分read的平均错误率。

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* NovaSeq 6000系统的性能已得到证明,但未经过广泛测试。