分子流行病学简介
分子流行病学描述了确定疾病遗传基础的过程，其中包括宿主和病原体中影响感染、传播和预防的变异。研究人员会确定感染源、传播途径以及与毒力和耐药性相关的分子途径和基因，以此来支持医院感染的控制和流行病学调查。
新一代测序（NGS）可以对多种分离物进行高度准确、无假设的分析，能取代用于鉴定生物体及检测耐药性和毒力的多种检测方法。相比之下，传统的病原体鉴定和表征方法通常以一系列假设为指导，并且只针对有限数量的生物体进行了优化。
特色分子流行病学文章
NGS在分子流行病学中的优势
NGS的一个重要优势是研究人员可以生成能够鉴定一系列生物（细菌、病毒和寄生虫）的基因组序列数据。检测基因组间的变异可以支持横断研究，有助于更好地了解引起感染和传播的机制，并且能通过系统发育分析来确定生物之间的亲缘关系。
利用全基因组测序数据进行高分辨率病原体分型可以区分许多传统方法无法区分的生物体。
微生物全基因测序 有助于流行病学家应对追踪疾病起源和调查疫情爆发的传统挑战。
追踪病原体的挑战
Jennifer Gardy博士将说明NGS如何帮助开展公共卫生工作，以及如何将其用于重建加拿大不列颠哥伦比亚省的结核病爆发后的相关工作，帮助您了解基因组流行病学。
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参考文献
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