抗菌药物耐药性监测
什么是抗菌药物耐药性（AMR）检测？
抗菌药物耐药性（AMR）检测是指识别对治疗感染常用的抗菌药物具有耐药性的微生物（如细菌、病毒、真菌或寄生虫）的过程1,2。AMR检测的目标之一是提供病原体对不同抗菌药物的耐药性信息，并指导做出决策，尽量减少耐药菌株的扩散3。
AMR主要基于微生物通过基因组变化进行适应的能力。这些基因组变化可以利用新一代测序（NGS）技术的强大功能进行检测，NGS可实现高通量，能够识别低频变异和基因组排列。
如何利用抗菌药物耐药性检测？
结合NGS的强大功能，AMR可以有效地用于以下方面：
早期检测
通过耐药基因组监测，掌握新出现的耐药性标志物。了解科学家如何利用早期检测来尽可能减少AMR病原体的传播。
检测松鼠葡萄球菌的耐药性基因
本文介绍了在一种新型嵌合质粒中发现的耐药性基因，强调了开展全基因组研究以揭示AMR细菌的身份、特征和进化的必要性。
城市AMR监测
科学家们展示了如何将废水分析与传统监测工作相结合，帮助识别当前和新出现的AMR威胁。
疫情应对
在应对疫情期间，追踪传播途径和监测值得关注的变异是至关重要的环节。了解科学家如何利用基于NGS的检测方法应对疫情。
利用基因组学进行全球AMR追踪
本出版物概述了AMR追踪如何从基于NGS的解决方案和应用（如WGS）中获益，以强化疫情期间的实时数据分析。
检测耐多药细菌中的基因水平转移
在这篇文章中，科学家从一家医院的医疗相关感染中筛选了细菌基因组，结果表明，在这种情况下发生了遗传元件的转移，包括对多种药物产生耐药性的遗传元件。
临床研究
对疾病机理的深入了解不仅有助于诊断和治疗方法的开发，还能采取战略性应对措施，防止AMR耐药性的进一步增强。请参阅下面的论文，进一步了解如何利用NGS在AMR检测方面取得的进展来控制病原体耐药性。
在研究过程中了解AMR
了解研究人员如何结合NGS、功能宏基因组学和统计建模来研究AMR基因的丰度、多样性、功能、背景和获取。
基于测序的AMR研究方法
这篇内容丰富的综述介绍了抗菌药物耐药性的鉴定和表征方法，包括最新的深度学习方法。此外，作者还讨论了基于测序的耐药性发现以及抗菌药物耐药性研究中使用的工具和数据库。
从WGS数据中检测AMR
进一步了解研究人员如何设计和验证生物信息学工具，从WGS数据中检测细菌AMR的基因组决定因素。
基于NGS的AMR检测方法
NGS是一种革命性的工具，为对抗AMR提供了突破性的检测能力。因美纳提供从样本到数据的创新解决方案，以跟上微生物针对抗菌化合物的快速进化步伐。了解我们不断扩展的基于NGS的解决方案，让您在AMR检测方面取得新的进展。
全基因组测序
通过全基因组测序（WGS），您可以获得关于微生物起源、鉴定、表型、进化行为等方面的全面基因组信息，这对AMR相关研究至关重要。利用高分辨率变异检测，无需特定探针。在NGS的支持下，微生物WGS可以通过简化的工作流程进行，利用多重分析的强大功能对多个样本进行测序。
鸟枪法宏基因组学
利用鸟枪法宏基因组学，可以靶向复杂样本中的特定基因，以研究新出现的疾病或与AMR相关的活动。这种方法可以在不进行靶向富集的情况下，对所有生物体的所有基因进行集中采样，包括那些难以培养的生物体。作为一种基于NGS的应用，鸟枪法宏基因组学实现了高序列覆盖率，可检测低丰度的抗菌药物耐药性微生物，同时能够并行分析数千个样本。
杂交捕获
当只需要对某些基因或特定基因组区域进行测序时，靶向富集方法可以让您有效地集中精力和资源。通过靶向富集，您可以灵敏、准确地检测AMR，例如，通过高突变分辨率识别新型变异。
特色产品
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel
这种NGS靶向富集工作流程可鉴定多种呼吸道病原体和抗菌药物耐药性等位基因，还提供了IDbyDNA支持的简化数据分析。
现在订购
Illumina DNA Prep
Illumina DNA Prep是一种快速、用户友好的解决方案，适用于微生物等多种应用。该试剂盒还可从不同类型的样本中提取DNA，可灵活地对大型复杂基因组以及扩增子或微生物物种进行测序。
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
Urinary Pathogen ID/AMR Panel（UPIP）旨在检测导致尿路感染（UTI）和合并感染的尿路病原体，检测AMR，并对关键病原体进行菌株分型，以研究其进化和传播。
相关资源
公共卫生监测
了解公共卫生监测如何成为识别传染病病原体、变异、AMR等的重要工具。
医疗相关感染监测
全面了解因美纳的医疗相关感染监测及相关解决方案。
废水监测
探索废水监测如何识别病原体（包括与AMR相关的菌株）以及社区中的变异。
微生物全基因组测序
了解因美纳微生物全基因组测序解决方案，利用多重分析的强大功能分析数百种生物。可靠地检测低频变异和基因组重排。
微生物学测序平台比较工具
因美纳提供多种平台，助您在AMR领域获得新发现。使用该平台比较NGS系统，找到适合您的实验室或应用的系统。
将测序数据转化为有意义的结果
NGS产生的海量数据需要利用生物信息学工具进行分析。探索将测序数据转化为AMR相关见解的分析解决方案。
References
- About Antibiotic Resistance. cdc.gov/drugresistance/about. Accessed September 20, 2023.
- Antimicrobial resistance. who.int/news-room/fact-sheets/detail/antimicrobial-resistance. Accessed September 20, 2023.
- Antimicrobial Resistance Information from FDA. fda.gov/emergency-preparedness-and-response/mcm-issues/antimicrobial-resistance-information-fda. Accessed September 20, 2023.