研究整个群落的基因组

更好地理解微生物在人类健康和疾病中的作用

人类微生物组分析

人类微生物组分析是对人体表面及体内微生物群落的研究。人类微生物组分析旨在了解微生物对健康和疾病的影响。

在以前,研究人类的皮肤、粪便或血液样本需要培养和分离单个生物,然后进行表型或基因型分析,这种微生物学技术费时费力。而且这些方法无法在单个样本中进行微生物群落分析。

人类微生物组分析简介

新一代测序(NGS)的出现催生了几个重大研究合作项目,包括人类微生物组计划MetaHIT,这些项目以NGS作为基础工具,发表了大量人类微生物组的相关数据。

NGS的高通量和成本的降低促进了宏基因组学研究,该研究能够研究整个群落的基因组,包括那些无法培养的生物体的基因组。

用于分析人体微生物组的实验性NGS方法包括:
鸟枪法宏基因组测序
  • 一种DNA测序方法,能够对给定的复杂样本中存在的所有生物体的所有基因进行全面的检测。
16S rRNA测序
  • 一种16S核糖体RNA基因测序方法,用于鉴定和比较给定样本中的细菌。
微生物宏转录组学
  • 对复杂样本中的一组微生物编码的所有RNA进行分析。
对口腔微生物进行测序
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MiSeq系统让Saca la Lengua项目研究小组能够对数千个样本进行测序,以鉴定人类口腔中的各种细菌和真菌。

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基于NGS的微生物组分析的全面工作流程推动了宏基因组学研究。

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研究继续探索宿主与微生物组的相互关系,希望能影响癌症进展和治疗有效性。

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在过去的几十年里,复杂的疾病急剧增多。许多复杂的疾病都与微生物组成异常有关,但具体的因果关系还有待进一步研究。为了解决这个重要问题,内布拉斯加州立大学在2016年9月16日宣布了一项富有远见的计划,准备通过新建的内布拉斯加健康食品中心(NFHC)来改变人们的饮食、农业生产和医疗方式。

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用于微生物组研究的微生物测序
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