鉴定癌症的表观遗传学变化

癌症表观遗传学的研究方法有助于了解致癌通路和癌症进展

癌症表观遗传学

癌症表观遗传学变化的研究(如异常甲基化和转录因子结合改变)可以提供对重要致癌通路的了解。甲基化变化常常会使基因激活或沉默,表观基因组的变化可以影响基因表达和癌症进展的速度。

新一代测序(NGS)和芯片技术可以检测到甲基化模式和癌症中其他表观遗传学的变化。Illumina与癌症表观遗传学专家进行了合作,确保其NGS和芯片解决方案能满足该领域快速变化的需求。

癌症表观遗传学插画

异常甲基化是癌症中常见的表观遗传学变化。NGS可以帮助研究人员鉴定和比较癌症细胞和正常细胞的甲基化,在单核苷酸水平上了解甲基化模式。

深入了解甲基化测序
追踪肿瘤进展

Christopher Mason博士介绍了如何通过转录组、表观基因组和表观转录组测序来追踪肿瘤进展。

甲基化芯片能进行全表观基因组关联研究,可以同时分析多个癌症样本。芯片可以定量分析整个基因组的甲基化位点,帮助研究人员了解癌症相关基因和通路的调控。

深入了解甲基化芯片
研究表明甲基化水平在乳腺癌确诊前数年就已下降

一项对诊断前血液样本的研究鉴定了可以预测乳腺癌风险的全表观基因组低甲基化变化。

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特色癌症表观遗传学研究

 
胶质瘤样本
用于脑肿瘤研究的NGS和甲基化芯片

Se Hoon Kim(医学博士)介绍了NGS panel和甲基化芯片如何共同为临床研究中的肿瘤鉴定提供支持。

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癌症转移之谜相关文章
甲基化和转移

研究人员使用甲基化芯片和NGS来研究癌症发展和转移的表观遗传学。

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烟叶
口腔癌的遗传基础

研究人员鉴定了与致死性口腔癌相关的基因组改变,包括体细胞和生殖系变异,以及启动子甲基化和转录的变化。

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转录因子结合的改变是另一个与癌症相关的常见表观遗传学变化。染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)能提供癌症细胞和正常细胞在整个基因组内与DNA相关的蛋白活性的信息。

这种方法能让研究人员以一种无假设的方法来研究基因表达调控。深度测序能检测通常在转录因子中观察到的低丰度蛋白质-DNA相互作用。

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对癌症表观基因组进行测序

在第49集Illumina基因组学播客中,Susan Clark博士介绍了表观遗传学在癌症和人类生物学领域的作用。

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癌症表观基因组学和基因表达中的“杂音”

在Illumina基因组学播客的第21集节目中,我们与来自俄亥俄州克利夫兰凯斯西储大学的遗传学与基因组科学教授Peter Scacheri博士探讨了癌症的表观遗传学和表观基因组学。

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Cacophony of Gene Expression

染色质转座酶可及性测序分析(ATAC-Seq)涉及对整个基因组的开放染色质区域进行测序。这些信息可以帮助研究人员了解染色质包装如何影响癌症基因表达的见解。这种方法不需要事先了解调控元件,因此是一种强大的表观遗传学发现工具。

深入了解ATAC-Seq
Alt Name
Infinium MethylationEPIC BeadChip Kit
  • 包含专家精选内容的芯片
  • 每份样本覆盖超过850,000个甲基化位点,可达单核苷酸分辨率
  • FFPE兼容性
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iScan芯片扫描仪
  • 高样本通量
  • 灵活匹配多种应用
  • 高数据质量
  • 自动化兼容性
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TruSeq Methyl Capture EPIC Library Prep Kit
  • 靶向甲基化测序
  • 靶向超过330万个CpG。能检测有重要生物学意义的甲基化组靶点。
  • 500 ng人类基因组DNA起始量
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甲基化芯片在脑肿瘤研究中的应用

来自海德堡大学的Andreas von Deimling教授展示了在神经肿瘤学研究中使用甲基化芯片和NGS获得的结果。对于未来如何将这些分析应用于脑肿瘤诊断,他分享了自己的观点。

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Pipetting into Eppendorf tubes
卡罗来纳乳腺癌研究中乳腺癌启动子甲基化的种族变异

研究人员利用Illumina的甲基化芯片对肿瘤和PBL进行了分析,鉴定了非裔美国女性和非非裔美国女性的乳腺癌发展的差异。

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髓母细胞瘤亚群在原发部位和转移部位保持了稳定

研究人员使用了甲基化指纹图谱来对髓母细胞瘤亚群进行分类,从而进行更好的鉴定。

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前列腺癌的表观遗传学生物标记:新一代技术

这篇综述介绍了最近的前列腺癌表观遗传学领域的发现,重点介绍了其作为诊断、细分和监测的生物标记的潜力。

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图像
甲基化检测方法领域指南

这篇基于芯片和测序的甲基化检测方法综述提供了有用的癌症表观遗传学研究资源。

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甲基化研究人员
DNA甲基化分析

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