癌症样本的表观遗传学分析
癌症表观遗传学变化的研究（如异常甲基化和转录因子结合改变）可以提供对重要致癌通路的了解。甲基化变化常常会使基因激活或沉默，表观基因组的变化可以影响基因表达和癌症进展的速度。
新一代测序（NGS）和芯片技术可以检测到甲基化模式和癌症中其他表观遗传学的变化。Illumina与癌症表观遗传学专家进行了合作，确保其NGS和芯片解决方案能满足该领域快速变化的需求。
检测肿瘤中DNA-蛋白质相互作用的变化
转录因子结合的改变是另一个与癌症相关的常见表观遗传学变化。染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq）能提供癌症细胞和正常细胞在整个基因组内与DNA相关的蛋白活性的信息。
这种方法能让研究人员以一种无假设的方法来研究基因表达调控。深度测序能检测通常在转录因子中观察到的低丰度蛋白质-DNA相互作用。
深入了解ChIP-Seq对癌症表观基因组进行测序
在第49集Illumina基因组学播客中，Susan Clark博士介绍了表观遗传学在癌症和人类生物学领域的作用。
Profiling Accessible Chromatin
The assay for transposase-accessible chromatin with sequencing (ATAC-Seq) involves sequencing regions of open chromatin across the genome. This information can provide insights into how chromatin packaging affects cancer gene expression.This method does not require prior knowledge of regulatory elements, making it a powerful epigenetic discovery tool.
Learn More About ATAC-Seq
Cancer Epigenomics and a Cacophony of Gene Expression
In episode 21 of the Illumina Genomics Podcast, we discuss the epigenetics and epigenomics of cancer with Dr. Peter Scacheri, Professor of Genetics and Genome Sciences at Case Western Reserve University in Cleveland, Ohio.
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