新一代测序的成本
NGS的成本
随着持续创新带来的成本降低，测序从未如此简单或经济实惠
重新定义发现价格
研究人员正在转向NGS，以扩大其基因组学研究的规模和发现能力。凭借台式测序系统的简单性和成本效益，各种规模的实验室都可以使用NGS设备。
许多实验室选择将NGS引入内部，以提高实验室效率，节省时间，并加强对数据隐私和NGS项目的控制。有些人认为NGS与其他方法相比过于昂贵，但事实是，NGS可以是一种非常经济的方法来补充或替代其他分子方法。NGS可以在单个实验室中增加大量价值和实用性，无需专业知识。
需要考虑的关键问题
在开始决策过程时，首先要评估您的研究目标和实验室需求。在购买NGS系统之前，请考虑以下关键问题：
- 我最常使用哪些方法和应用？
- 对于我的方法和研究规模，最好的仪器选项是什么？
- 如何确保数据、仪器和工作流程的质量？
- 初次购买后，持续的成本是多少？
- 如何分析和存储NGS数据？
- 我将如何与其他研究人员合作？
- 我将获得什么级别的产品支持？
评估NGS成本：整体视图
在购买NGS平台时，需要考虑许多因素，而不仅仅是仪器价格或成本/Gb——这些因素本身可能会产生相当大的误导性。总拥有成本需要仔细评估，包括从设置到辅助设备、易用性、支持/仪器正常运行时间水平、公司声誉/寿命、培训等等。
运行费用
- 每次实验的成本
- 每个样本的成本（比如，DNA分离、文库制备及测序试剂）
- 对于产出更高的应用，规模经济有助于降低成本
实验室空间和辅助设备
- 考虑您的实验室空间和设施系统
- 核酸定量仪器
- 核酸质量分析仪
- 单独的簇生成仪器
- 扩增仪
- 超声波破碎仪（用于某些文库制备方法）
- 离心机
- 常见的实验室用品（比如，移液器、96孔板、离心管）
- 其他专用设备
数据质量、分析和存储
- 防止重复操作的数据质量（Q值）
- 软件许可证
- 存储数据/服务器（通常是许可成本的一部分）
- 运行数据分析应用程序（也称为计算成本）
- 安全性和合规性要求
- 分析流程可扩展性
- 数据压缩和存档解决方案
测序仪兼容性
- 入职培训和员工培训
- 故障诊断设备的机会成本
- 通过主动监测仪器进行预防性维护
- 手动操作时间：效率和工作流程简单，节省实验室技术时间
- 外包时周转时间可能很昂贵（机会成本，更少的实验）
选择NGS系统：分步指南
本综合指南将帮助您评估研究目标和实验室需求，从而引导您完成整个决策过程。
- 在购买NGS系统之前需要询问的关键问题
- 测序和数据分析平台的关键注意事项
- NGS采购清单
完整的测序生态系统
随着新一代测序成本的持续下降，Illumina正在引领通过持续创新使NGS更经济、更易获取。自2013年以来，每个基因组的平均成本降低了96%1,2。我们致力于帮助各种规模的实验室充分利用这项强大技术的潜力。
当您购买Illumina测序仪时，您将受益于：
完整且互联的产品组合生态系统，简化工作流程
创新，操作简单，入门快速简便
全面的产品支持，客户满意度达到96%，平均维修时间＜1天，全天候技术支持等
由工程师、技术应用科学家、生物信息学家和IT专家组成的高素质服务团队组成的仪器服务计划
分享最佳实践和方法的领先研究人员社区
强大且易于使用的数据分析和存储解决方案
“成本壁垒已经大大降低。这可能是让人们无法参与其中的事情之一。但Illumina在以更低的成本让测序技术更加普及方面取得了长足的进步。专业知识就在那里。”
参考文献
- National Human Genome Research Institute. DNA Sequencing Costs: 数据。genome.gov/about-genomics/fact-sheets/DNA-Sequencing-Costs-Data。2023年4月10日查阅。
- 30亿。全基因组测序成本为2023年。https：//3billion.io/blog/whole-genome-sequencing-cost-2023。2023年4月10日查阅