癌症研究, 产品

新工作流程:实验室如何从TSO 500更新中受益

创新的功能提升简化了内部全景变异分析的实施

新工作流程:实验室如何从TSO 500更新中受益
2020年11月16日

越来越多的机构开始在内部实施全景变异分析 (CGP),然而这项工作需要更高效的运作。Illumina强大的TruSight Oncology 500(TSO 500)产品系列支持实体瘤CGP,该产品系列将于2020年秋季开始发布多种产品和更新。每个新的功能提升都能简化和改善从样本到报告的工作流程。更快速的自动化数据分析以及将数据存储在云端的选项等功能可为客户节省时间和金钱,增加分析的样本量。此外,TruSight Oncology 500 ctDNA的流程改进可提供更高的分析灵敏度和更少的假阳性。

“新版本不仅仅是更新了软件和提供了自动化选项,”Illumina高级副总裁兼首席产品官Susan Tousi说道。“它们提供了之前版本缺少的部分,能帮助实验室独立运作,并享受更简单、更快速、更具可扩展性的工作流程。”

新的功能提升包括:

·      适用于TSO 500的自动化文库制备试剂盒和方法: 可节省多达50%的手动操作时间

·      与适用于TSO 500 HT和ctDNA的NovaSeq 6000 v1.5 Reagent Kit兼容: 提高测序效率,节省样本测序成本

·      利用DRAGEN Bio-IT平台(本地或云端): 超快速的变异检出意味着分析时间将缩短10倍。可选择在本地或云端运行分析的灵活性有助于满足各个实验室的需求

·      TSO 500 ctDNA的流程功能提升: 免疫肿瘤学检测的MSI灵敏度更强、新的肿瘤组分指标(MSAF)、以及通过新过滤方法减少的假阳性

为了进一步简化从样本到答案的工作流程,Illumina正在推出适用于TSO 500和TSO 500 High-Throughput(大样本量)的文库制备自动化试剂盒和方法,分别在现在和2021年上市。自动化可以节省人工成本、减少人为错误、并能让实验室增加检测的样本量。(LTS Health关于TSO 500的第三方报告发现,自动化将手动操作时间缩短了一半。)

普罗维登斯俄勒冈区域实验室(Providence Oregon Regional Laboratory)的肿瘤分子病理学和病理学信息学医学主任Carlo Bifulco采用了CGP来整合检测和寻找生物标志物。“CGP的部署显著增加了靶向疗法的使用,这种方法能够在多种肿瘤组织中有效且可重复地鉴定出IO合格的TMB-H和MSI-H病例。”Bifulco博士说道。“将CGP纳入常规病理学工作流程有助于快速、一致地向医疗保健人员提供相关的可操作结果。最后,基因组学数据的机构所有权将为动态、即时匹配以及其他实际的循证努力奠定坚实的基础,这将推动肿瘤学的发展。”

总部位于纽约的OmniSeq是美国最大的参考实验室之一,它是NGS检测的核心提供商。效率对于该实验室至关重要。“我们的首要任务之一就是确保我们能够满足高需求。”OmniSeq首席科学官Jeffrey Conroy说道。“我们能够在NovaSeq 6000上批量处理TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量)样本,并使用Clarity LIMS追踪我们的检测工作流程,这对于我们扩大规模并减少从样本到报告的周转时间至关重要。”

点击此处可查看所有TruSight Oncology产品新闻。

Illumina将在今年的美国分子病理学会(AMP)线上会议上介绍TSO 500产品系列的更新和强大之处,该会议的主题之一是CGP。一些Illumina客户将在我们的研讨会上讨论CGP实施的优势和环节。

如需查看我们的AMP活动页面,请点击此处

了解有关TruSight Oncology的更多信息:

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