NovaSeq X系列软件和信息学

重新思考机载DRAGEN带来的可能性

使用NovaSeq X系列大规模实施准确、高效的信息学工作流程

测序仪上的机载集成二级分析

准确、全面且高效的二级分析被整合到带有机载DRAGEN的NovaSeq X系列中。

NovaSeq X系列是唯一一款具有机载集成变异检出功能的超高通量仪器,可简化您的操作并缩短测序周转时间。自动启动数据分析,包括FASTQ文件生成、比对和变异检出。

简化您的工作流程

更快、更简单的数据分析

机载DRAGEN二级分析兼具速度、灵活性和操作效率,能够缩短测序工作流程周转速时间。使用以下四个最常用的机载DRAGEN流程快速、无缝地分析数据。

采用一体化工作流程减少手动操作次数

与独立分析解决方案相比,手动接触点数量减少了4倍。1

轻松规划运行和配置数据

通过简单易用的图形界面或导入样本表在本地或云端配置二级分析。在屏幕上查看QC指标、运行报告和分析进度。

DRAGEN机载运行时间a

DRAGEN流程 样本数量b 运行时间c
BCL Convert(采用ORA压缩) 24,576 约1小时30分钟
RNA(包含差异表达) 1536个转录组(mRNA) 约1小时30分钟
Enrichment(Germline) 512个外显子组 约4小时30分钟至5小时30分钟
富集(体细胞) 31 1,056× 44分钟至53分钟
生殖系 48个30×全基因组 约3小时30分钟至约7小时30分钟
体细胞 8 344× 约5小时40分钟至6小时40分钟
甲基化 40 64× 5小时15分钟

a. 这些代表性运行时间基于Illumina内部数据。客户运行时间可能会因样本质量、分析设置和样本配置而有所不同。

b. 根据Illumina内部数据推断双10B流动槽的样本数量。

c. 相同配置的双 10B 流动槽同时启动或单 10B 流动槽启动。

d. 定位的运行时间为3小时30分钟,所有变异检出程序的运行时间为7小时30分钟。

轻松扩展您的研究

通过硬件加速快速处理高通量数据

通过硬件加速快速处理高通量数据。凭借四个机载现场可编程门阵列(FPGA),您可以实现更强大的DRAGEN分析,轻松处理NovaSeq X系统数据。在每次运行中,每个流动槽最多可同时执行四个应用程序。

减少数据占用空间,以更低的成本和能耗轻松管理和存储数据,内置压缩功能可将FASTQ文件的大小减少多达80%2。

将数据直接传输到位于云端的Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub,实现可扩展的数据管理、分析和整合。

按照您的方式可靠地分析数据

通过DRAGEN分析生成极其准确的结果

DRAGEN分析提供卓越的变异检出准确性。DRAGEN中的多基因组(图)参考和Illumina机器学习实现了出色的准确性,正如使用PrecisionFDA基准数据的F1评分所证明的那样。3

通过DRAGEN二级分析实现持续创新

持续扩展产品创新,包括新流程、靶向检出程序,并提高难绘制区域的覆盖度。

灵活地按照您的方式运行DRAGEN分析,在仪器上、云端、服务器上均可

通过Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上的云端工作流程访问更广泛的应用菜单。

节省分析成本

在利用NovaSeq X系列上的机载DRAGEN扩大生产规模的同时提高成本效益

利用机载DRAGEN以及可压缩至原来1/5的无损ORA(Original Read Archive)基因组数据压缩功能降低数据存储成本。无损数据压缩功能可减少FASTQ文件的数据占用空间,从而将数据存储成本降低多达80%2。NovaSeq X系列附带DRAGEN硬件和软件许可证,其费用包含在仪器成本中。

通过整合DRAGEN机载二级分析与NovaSeq X系列,有助于您节省使用其他二级分析解决方案相关的成本。*

机载DRAGEN的综合节省,包括软件许可证和云端存储5年,NovaSeq X系统的平均节省额约为100万美元,NovaSeq X Plus系统的平均节省额约为170万美元。4

深入了解: DRAGEN二级分析

*数据仅用于说明,具体结果可能有所不同,请联系您的因美纳代表了解更多详细信息。节省成本与通量呈正相关。此处的比较基于使用DRAGEN服务器和机载DRAGEN,并假设NovaSeq X系统需要两台服务器,NovaSeq X Plus系统需要四台服务器,再加上年度许可证和云端存储成本。

使用Illumina Connected软件实现灵活的信息学工作流程

NovaSeq X系列可与因美纳互联软件完全集成

从运行规划、运行管理、数据分析和数据解读方面让您按照自己的方式运行测序。

1
实验室管理
2
测序和运行管理
4

†Connected Insights在部分国家/地区可用

参考文献
  1. 与独立分析解决方案相比,手动操作次数减少,因美纳内部存档数据,2023年。
  2. https://developer.illumina.com/news-updates/introducing-dragen-original-read-archive-ora
  3. Illumina DRAGEN二级分析是第一个基于2020年 PrecisionFDA v2真值挑战基准数据实现99.83%准确性的单一平台。 详情请点击此处
  4. 假设NovaSeq X系统每年处理10,000个基因组,NovaSeq X Plus系统每年运行20,000次WGS,因美纳内部存档数据,2023年。

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