循环肿瘤DNA的前景

组织活检的补充方法

循环肿瘤DNA测序

无细胞循环肿瘤DNA(ctDNA)可作为非侵入性癌症生物标志物,为侵入性组织活检提供潜在的替代方案。转化癌症研究人员正在探索使用液体活检来检测肿瘤来源的ctDNA。1 ctDNA测序是一种非侵入性方法,可用于实时监测治疗反应和识别治疗候选方案。2

新一代测序(NGS)为研究人员提供了检测血液中低水平ctDNA所需的灵敏度和特异性。除了靶向单个基因或部分基因外,NGS还可以识别ctDNA中全基因组范围的肿瘤来源变异。

传统上,血清蛋白已被用作疾病监测的癌症生物标志物,但这种方法应用有限,且无法提供驱动突变或肿瘤异质性的信息。1 肿瘤DNA中的体细胞突变提供了更为特异和准确的生物标志物。

NGS的出现以及与癌症相关的基因组变异知识的增加,使得灵敏且准确地识别罕见体细胞突变成为可能。

了解NGS在癌症研究液体活检应用中的优势。理解液体活检相较于实体组织活检的优点,并探索用于分析ctDNA的常见分子技术。

阅读应用亮点
ctDNA Analysis Samples

循环肿瘤DNA测序在识别靶向治疗生物标志物和测量治疗反应方面发挥着重要作用。


ctDNA测序在癌症中的潜力
伴随诊断
  • 无需侵入性活检即可识别肿瘤中的可干预变异
  • 识别肿瘤异质性
治疗反应监测
  • 确定治疗效果
  • 检测新的可干预变异或耐药标志物
残留疾病监测
  • 评估潜在的疾病缓解或进展
筛查
  • 在无任何先前证据的情况下确定疾病是否存在

ctDNA测序研究文章

 
Variant Data from Blood
ctDNA与RNA分析的价值

来自根特大学(Ghent University)和 Biogazelle 的 Jo Vandesompele 博士分享了关于基于 DNA 的液体活检测序、RNA 分析以及长链非编码 RNA 在癌症中的作用的研究。

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Nucleosome Patterns
在ctDNA中寻找癌症驱动基因表达线索

对ctDNA样本进行全基因组测序,使研究人员能够分析核小体模式,并推断癌症驱动基因的表达状态。

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2

检测试剂盒,针对血浆中的多种体细胞变异类型,包括肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性。

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TruSight Oncology UMI 试剂

这些独特的分子标识符可降低测序数据中的背景噪音,实现低频变异的检测。

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NovaSeq 6000 测序仪

将可扩展的通量、速度和灵活性相结合,适用于几乎任何测序方法、基因组和项目规模。

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癌症RNA测序

该方法提供关于癌症基因表达及驱动肿瘤进展的基因融合的功能性信息。

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体细胞突变分析

NGS提供高灵敏度、易用性和准确的数据质量,成功识别甚至罕见的突变。

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泛癌分析

专家定义的泛癌NGS panel可全面评估与多种常见癌症相关的基因变异和异常,不受肿瘤起源限制。

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ctDNA与无创产前筛查

科学家通过分析无细胞DNA检测到母体恶性肿瘤的迹象。

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在早期和晚期人类恶性肿瘤中检测ctDNA

Bettegowda等人展示了ctDNA作为多种肿瘤类型癌症生物标志物的应用。

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一种超灵敏的ctDNA定量方法

Newman等人介绍了通过深度测序进行癌症个性化分析(CAPP-Seq)用于ctDNA定量。

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ctDNA作为转移性乳腺癌生物标志物的分析

Dawson等人使用ctDNA监测转移性乳腺癌。

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2在NextSeq 2000上的应用

在桌面式系统上实现内部CGP(全面基因组分析)。

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参考文献
  1. Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ, et al. Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies. Sci Transl Med. 2014;6:224ra24.
  2. DeMartin T (2014) Gene Trek: Clinical Impacts of Next Generation Sequencing. AG Scientific (info.agscientific.com/blog/bid/203182/Gene-Trek-Clinical-Impacts-of-Next-Generation-Sequencing)