NextSeq 550系统测序性能参数
| NextSeq 550 System High-Output Kit* | NextSeq 550 System Mid-Output Kit* | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 读长 | 总时间† | 产出 | 读长 | 总时间† | 产出 |
| 2 × 150 bp | 29小时 | 100–120 Gb | 2 × 150 bp | 26小时 | 32.5–39 Gb |
| 2 × 75 bp | 18小时 | 50–60 Gb | 2 × 75 bp | 15 小时 | 16.25–19.5 Gb |
| 1 × 75 bp | 11小时 | 25–30 Gb | |||
*安装参数是基于在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库（通过过滤的簇密度是129-165 K/mm2）所得。根据样本类型、样本质量、通过过滤的簇的不同，真实的性能参数可能有所差异。NextSeq 500的所有试剂盒都适用于双端测序。
†总时间包括NextSeq 500系统上双表面扫描所实现的簇生成、测序和碱基检出。
通过过滤的read
| NextSeq 550 System High-Output Kit | NextSeq 550 System Mid-Output Kit | |
|---|---|---|
| 单端Read | 达4亿条 | 达1.3亿条 |
| 双端Read | 达8亿条 | 达2.6亿条 |
质量评分††
| NextSeq 550 System High-Output Kit | NextSeq 550 System Mid-Output Kit |
|---|---|
| 在2 x 150 bp时，> 75%的碱基高于Q30 | 在2 x 150 bp时，> 75%的碱基高于Q30 |
| 在2 x 75 bp时，> 80%的碱基高于Q30 | 在2 x 75 bp时，> 80%的碱基高于Q30 |
| 在1 x 75 bp时，> 80%的碱基高于Q30 |
††质量评分（Q-score）是对碱基检出中错误可能性的预测。高于Q30的碱基百分比是在整个运行中取平均值。
主要应用的预计样本通量
| NextSeq 550 System High-Output Kit | NextSeq 550 System Mid-Output Kit |
|---|---|
| 1个人类全基因组 | 3个外显子组 |
| 12个外显子组 | 12个富集panel |
| 16个转录组 | 96个扩增子panel |
NextSeq 550系统芯片扫描参数
| 芯片 | 每个芯片的扫描时间 | 每个样本的扫描时间 |
|---|---|---|
| Infinium MethylationEPIC BeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
| Infinium CytoSNP-850K BeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
| HumanCytoSNP-12 BeadChip芯片 | 40分钟 | 3.3分钟 |
| Infinium HumanKaryomap-12 BeadChip芯片 | 40分钟 | 3.3分钟 |
