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NextSeq 550测序系统规格

高准确度测序和芯片扫描

可调读长和多种输出配置

NextSeq550

不同读长下每个流动槽的输出a

读段长度 NextSeq 550系统中通量试剂盒 NextSeq 550系统高通量试剂盒
1ｘ75 bp N/A 25–30 Gb
2 × 75 bp 16.25–19.5 Gb 50–60 Gb
2 × 150 bp 32.5–39 Gb 100–120 Gb

a. 基于支持的簇密度下的Illumina PhiX对照文库（129至165 k/mm²通过过滤的簇）。由于样本类型、样本质量和通过过滤的簇的情况不同，实际性能参数可能略有变化。所有NextSeq 550系统试剂盒均支持双端测序。

关键应用的预计样本通量

NextSeq 550系统中通量试剂盒 NextSeq 550系统高通量试剂盒
3个外显子组 1个全人类基因组
12个富集panel 12个外显子组
96个扩增子panel 16个转录组

每个流动槽通过过滤的read

  NextSeq 550系统中通量试剂盒 NextSeq 550系统高通量试剂盒
单端read ≤ 130M ≤ 400M
双端read ≤ 260 M ≤ 800 M

质量分值a

读段长度 NextSeq 550系统中通量试剂盒 NextSeq 550系统高通量试剂盒
1ｘ75 bp N/A 比Q30高＞80%的碱基
2 × 75 bp 在2 × 75 bp下，碱基比Q30高＞80% 比Q30高＞80%的碱基
2 × 150 bp 在2 × 150 bp下，比Q30高＞75%的碱基 比Q30高＞75%的碱基

a. 质量分值是对碱基检出中错误发生几率的预测。整个运行中＞Q30的碱基百分比取平均值。

运行时间

读段长度 NextSeq 550系统中通量试剂盒 NextSeq 550系统高通量试剂盒
1ｘ75 bp N/A 11小时
2 × 75 bp 15小时 18小时
2 × 150 bp 26小时 29小时

芯片扫描参数

芯片 每个芯片的扫描时间 扫描时间/样本
Infinium MethylationEPIC BeadChip 40分钟 5分钟
Infinium CytoSNP-850K BeadChip 40分钟 5分钟

仪器参数表

NextSeq 550 System specifications
  • 发光二极管（LED）
    波长

    （激光二极管780 nm，IIIb类）
    绿色510-525 nm，红色645-655 nm
  • 尺寸
    W×D×H
    53.3 cm × 63.5 cm × 58.4 cm
    （21.0 英寸 × 25.0 英寸 × 23.0 英寸）
  • 重量
    83 kg（183磅）
  • 板条箱重量
    151.5 千克（334 磅）
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关键技术

边合成边测序技术

NextSeq 550系统利用成熟的Illumina边合成边测序（SBS）技术，为多种应用提供高度准确的数据和可靠的性能。SBS利用一种可逆终止子方法，荧光标记的核苷酸可在单个碱基掺入不断延伸的DNA链时对其进行检测。

2-Channel边合成边测序

NextSeq 550系统利用双通道边合成边测序（SBS），与原始Illumina 4通道SBS技术相比，数据生成速度更快，数据准确性也相同。