MiSeq Reporter软件预安装在MiSeq测序仪上,可开展二次数据分析。它处理测序运行过程中Real Time Analysis软件产生的碱基检出。
一旦实时分析完成,MiSeq Reporter自动启动。它产生每个基因组和样本的比对、结构变异和contig组装信息。它根据样本表中指定的流程开展分析。
MiSeq Reporter以简单直观的图形格式提供初次和二次分析的数据,以及每个样本的质量和覆盖度信息。
学习如何分析您的数据,并探索获得支持的流程。
大多数流程都需要参考基因组来进行比对。MiSeq Reporter包含一些预安装的数据库和基因组。
数据库: miRbase(人类)、dbSNP(人类)和refGene(人类)
基因组: 拟南芥、牛(Bos taurus), 大肠杆菌DH10b、人类(Homo sapiens)hg19版本、小鼠(Mus musculus),大鼠(Rattus norvegicus), 金黄色葡萄球菌和酵母 (Saccharomyces cerevisiae).
您也可以上传自己的fasta格式(*.fasta或 *.fa)的参考基因组。
了解如何将您感兴趣的参考基因组添加到MiSeq Reporter。
MiSeq Reporter以一种Windows服务的方式运行,可以通过web浏览器查看。如果您希望在MiSeq系统开展后续运行时分析您的数据,那么您可以在另一台电脑上安装软件的另一个副本。
查看MiSeq Reporter计算要求支持页面,了解更多要求。
看看最新版本的MiSeq Reporter有哪些变化,并下载最新的版本。或访问MiSeq Reporter的技术支持信息。
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