TruSeq Stranded mRNA

TruSeq Stranded mRNA

TruSeq Stranded mRNA LT利用oligo dT磁珠分离poly-A mRNA,并保留转录本的链型。链信息对反义转录检测和转录本注释有用,并提高了比对效率。
起始材料:为100 ng总RNA而优化,最多可使用1 ug总RNA,或从0.1-1 ug总RNA中纯化而来的mRNA部分。

TruSeq Stranded mRNA利用oligo dT磁珠分离poly-A mRNA,并保留转录本的链型。链信息对反义转录检测和转录本注释有用,并提高了比对效率。
起始材料:为100 ng总RNA而优化,最多可使用1 ug总RNA,或从0.1-1 ug总RNA中纯化而来的mRNA部分。

TruSeq Stranded mRNA for NeoPrep利用oligo dT磁珠分离poly-A mRNA,并保留转录本的链型。链信息对反义转录检测和转录本注释有用,并提高了比对效率。在全面整合的数字微流体NeoPrep文库制备系统上采用同样成熟的TruSeq RNA生物化学。NeoPrep系统可大大简化文库制备,带来高度重现且立即可测序的文库,实现卓越的数据质量和基因组覆盖,而手工操作时间极少。

LT HT NeoPrep

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* 文库制备与Illumina所有仪器兼容。建议仪器是根据所选应用的典型产量和分析需求选择的。
基于RNA图谱分析时每个样品有10M序列,转录组分析时每个样品有25M序列。
项目建议
物种兼容性 任何带有poly-A尾的高质量RNA
建议的Illumina仪器* NextSeq 500 HiSeq 2500 (双流动槽)
每次运行建议的样品数量 RNA图谱分析: 13–40
转录组分析: 5–16
RNA图谱分析: 60–400
转录组分析: 24–160
运行模式 中等产量 高产量 快速运行 高产量
建议的最长读长 2x75 bp 2x75 bp 2x75 bp 2x75 bp
建议的二次分析
  • TopHat Alignment BaseSpace App
  • Cufflinks Assembly & DE BaseSpace App
  • RNA Express v1.0 BaseSpace App
建议的下游分析
  • Genomatix Pathway
  • iPathway Guide