NovaSeq系统参数

测序的扩展性出类拔萃

NovaSeq 6000系统具有惊人的通量,展现更多可能

每个流动槽的序列产出*

NovaSeq 6000系统
流动槽类型 SP S1 S2 S4
1 × 35 bp N/A N/A N/A 280-350 Gb
2 × 50 bp 65–80 Gb 134–167 Gb 333–417 Gb N/A
2 × 100 bp 134–167 Gb 266–333 Gb 667–833 Gb 1600–2000 Gb
2 × 150 bp 200–250 Gb 400–500 Gb 1000–1250 Gb 2400–3000 Gb
2 x 250 bp 325-400 Gb N/A N/A N/A

*参数基于Illumina PhiX 标准文库支持簇密度下数据产出的情况。

每个流动槽通过过滤的read

NovaSeq 6000系统
流动槽类型 SP S1 S2 S4
单端Reads 650–800 M 1.3–1.6 B 3.3 B–4.1 B 8-10 B
双端Reads 1.3–1.6 B 2.6–3.2 B 6.6–8.2 B 16–20 B

质量分值*与运行时间

NovaSeq 6000系统
流动槽类型
v1.5 Reagent Kits
SP S1 S2 S4
质量分值  
1 × 35 bp 在1 × 35 bp时,≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 50 bp 在2 × 50 bp时,≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 100 bp 在2 × 100 bp时,≥ 85%的碱基分值高于Q30
2 × 150 bp 在2 × 150 bp时,≥ 85%的碱基分值高于Q30
2 × 250 bp 在2 × 250 bp时,≥ 75%的碱基分值高于Q30
运行时间  
1 × 35 bp N/A N/A N/A 约14小时
2 × 50 bp 约13小时 约13小时 约16小时 N/A
2 × 100 bp 约19小时 约19小时 约25小时 约36小时
2 × 150 bp 约25小时 约25小时 约36小时 约44小时
2 × 250 bp 约38小时 N/A N/A N/A
流动槽类型
v1.0 Reagent Kits
SP S1 S2 S4
质量分值  
2 × 50 bp 在2 × 50 bp时,≥ 85%的碱基分值高于Q30
2 × 100 bp 在2 × 100 bp时,≥ 80%的碱基分值高于Q30
2 × 150 bp 在2 × 150 bp时,≥ 75%的碱基分值高于Q30
2 × 250 bp 在2 × 250 bp时,≥ 75%的碱基分值高于Q30
运行时间  
2 × 50 bp 约13小时 约13小时 约16小时 约N/A
2 × 100 bp 约19小时 约19小时 约25小时 约36小时
2 × 150 bp 约25小时 约25小时 约36小时 约44小时
2 × 250 bp 约38小时 N/A N/A N/A

* 质量分值 (Q-score) 是对碱基检出中错误发生几率的预测。 bases > Q30 的百分比为整个运行中数据的平均值。
† 运行时间包括在NovaSeq 6000系统上进行簇生成、测序以及运行双S2流动槽进行碱基读取的时间。

对关键应用估计的样品通量*

NovaSeq 6000系统
流动槽类型 SP S1 S2 S4
每次运行的人类基因组数 ~4 ~8 ~20 ~48
每次运行的外显子数 ~40 ~80 ~200 ~500
每次运行的转录组数 ~32 ~64 ~164 ~400

*有的样品通量是基于双流动槽运行的估计值。人类基因组假设每个样品能够生成 > 120 Gb的数据,从而实现30x的基因组覆盖度。外显子假设以 ≥ 2 x 75 bp生成 ≥ 50M的reads。转录组假设以 ≥ 2 x 50 bp生成 ≥ 50M的reads。

NovaSeq规格

仪器配置
  • 计算机和触摸屏显示
  • 安装设置和附件
  • 数据采集和分析软件
仪器控制计算机
  • 主机:Portwell WADE-8022 及 Intel i7 4700EQ CPU
  • 内存:2 × 8 GB DDR3L SODIMM
  • 硬盘:无
  • 固态硬盘: 256 GB mSATA
  • 操作系统: Windows 10
  • 注意:计算机配置将定期升级,请联系您当地的客户经理,了解当前的配置
操作环境
  • 温度:19°C–25°C(22°C±3°C),每小时变化<2°C
  • 湿度:相对湿度20%–80%,非冷凝
  • 海拔:低于2000米(6500英尺)
  • 通风:最大8530 BTU/h,平均6000 BTU/h
  • 仅供室内使用
激光
  • • 波长: 532 nm, 660 nm, 780 nm, 790 nm
尺寸
  • 宽×深×高:80.0 cm(31.5英寸)× 94.5 cm(37.2英寸)× 165.6 cm(65.2英寸),含显示器
  • 重量:481 kg(1059磅),包括漏液盘3.5 kg(7.8磅)和键盘鼠标0.9 kg(2磅)毛重:628 kg(1385磅)
包装尺寸
  • 包装宽×深×高:92 cm × 120 cm × 118 cm
  • 毛重:232 kg
电源要求
  • 200–240 VAC 50/60Hz,16A,单相,2500 W
  • Illumina提供区域特定的不间断电源
网络连接
  • 仪器和数据管理系统之间专用的1 Gb连接。直接连接或通过网络连接
网络连接带宽
  • 内部网络上传速度:200 Mb/s/仪器
  • BaseSpace Sequence Hub上传速度:200 Mb/s/仪器
  • 仪器操作数据上传速度:5 Mb/s/仪器
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novaseq 6000 system drawing

关键技术

合成测序技术

NovaSeq 6000系统使用Illumina成熟的边合成边测序(SBS)技术产生的数据准确,表现可靠。边合成边测序技术使用荧光标记的核苷酸作为可逆终止子。该方法在单碱基进入不断增长的DNA链时发现它们,并行读取数十亿个序列。

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看看SBS如何工作

图案化流动槽技术

NovaSeq 6000系统整合了图案化流动槽技术,能够为一系列广泛的测序应用生成前所未有的通量。图案化流动槽在某些固定的位置包含数十亿个纳米孔,这种设计甚至为待测序的簇之间提供了间隔距离。这大幅增加了系统的reads数以及的总产出。

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看看图案化流动槽技术如何工作

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