流动槽类型 | SP | S1 | S2 | S4 |
---|---|---|---|---|
1 × 35 bp | N/A | N/A | N/A | 280-350 Gb |
2 × 50 bp | 65–80 Gb | 134–167 Gb | 333–417 Gb | N/A |
2 × 100 bp | 134–167 Gb | 266–333 Gb | 667–833 Gb | 1600–2000 Gb |
2 × 150 bp | 200–250 Gb | 400–500 Gb | 1000–1250 Gb | 2400–3000 Gb |
2 x 250 bp | 325-400 Gb | N/A | N/A | N/A |
*参数基于Illumina PhiX 标准文库支持簇密度下数据产出的情况。
流动槽类型 | SP | S1 | S2 | S4 |
---|---|---|---|---|
单端Reads | 650–800 M | 1.3–1.6 B | 3.3 B–4.1 B | 8-10 B |
双端Reads | 1.3–1.6 B | 2.6–3.2 B | 6.6–8.2 B | 16–20 B |
流动槽类型 v1.5 Reagent Kits |
SP | S1 | S2 | S4 |
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质量分值 | ||||
1 × 35 bp | 在1 × 35 bp时,≥ 90%的碱基分值高于Q30 | |||
2 × 50 bp | 在2 × 50 bp时,≥ 90%的碱基分值高于Q30 | |||
2 × 100 bp | 在2 × 100 bp时,≥ 85%的碱基分值高于Q30 | |||
2 × 150 bp | 在2 × 150 bp时,≥ 85%的碱基分值高于Q30 | |||
2 × 250 bp | 在2 × 250 bp时,≥ 75%的碱基分值高于Q30 | |||
运行时间 | ||||
1 × 35 bp | N/A | N/A | N/A | 约14小时 |
2 × 50 bp | 约13小时 | 约13小时 | 约16小时 | N/A |
2 × 100 bp | 约19小时 | 约19小时 | 约25小时 | 约36小时 |
2 × 150 bp | 约25小时 | 约25小时 | 约36小时 | 约44小时 |
2 × 250 bp | 约38小时 | N/A | N/A | N/A |
流动槽类型 v1.0 Reagent Kits |
SP | S1 | S2 | S4 |
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质量分值 | ||||
2 × 50 bp | 在2 × 50 bp时,≥ 85%的碱基分值高于Q30 | |||
2 × 100 bp | 在2 × 100 bp时,≥ 80%的碱基分值高于Q30 | |||
2 × 150 bp | 在2 × 150 bp时,≥ 75%的碱基分值高于Q30 | |||
2 × 250 bp | 在2 × 250 bp时,≥ 75%的碱基分值高于Q30 | |||
运行时间 | ||||
2 × 50 bp | 约13小时 | 约13小时 | 约16小时 | 约N/A |
2 × 100 bp | 约19小时 | 约19小时 | 约25小时 | 约36小时 |
2 × 150 bp | 约25小时 | 约25小时 | 约36小时 | 约44小时 |
2 × 250 bp | 约38小时 | N/A | N/A | N/A |
* 质量分值 (Q-score) 是对碱基检出中错误发生几率的预测。 bases > Q30 的百分比为整个运行中数据的平均值。
† 运行时间包括在NovaSeq 6000系统上进行簇生成、测序以及运行双S2流动槽进行碱基读取的时间。
流动槽类型 | SP | S1 | S2 | S4 |
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每次运行的人类基因组数 | ~4 | ~8 | ~20 | ~48 |
每次运行的外显子数 | ~40 | ~80 | ~200 | ~500 |
每次运行的转录组数 | ~32 | ~64 | ~164 | ~400 |
*有的样品通量是基于双流动槽运行的估计值。人类基因组假设每个样品能够生成 > 120 Gb的数据,从而实现30x的基因组覆盖度。外显子假设以 ≥ 2 x 75 bp生成 ≥ 50M的reads。转录组假设以 ≥ 2 x 50 bp生成 ≥ 50M的reads。
NovaSeq 6000系统使用Illumina成熟的边合成边测序(SBS)技术产生的数据准确,表现可靠。边合成边测序技术使用荧光标记的核苷酸作为可逆终止子。该方法在单碱基进入不断增长的DNA链时发现它们,并行读取数十亿个序列。
NovaSeq 6000系统整合了图案化流动槽技术,能够为一系列广泛的测序应用生成前所未有的通量。图案化流动槽在某些固定的位置包含数十亿个纳米孔,这种设计甚至为待测序的簇之间提供了间隔距离。这大幅增加了系统的reads数以及的总产出。