2025年11月18日
世界正在最微小的战线上打响一场战役——抗菌药物耐药性（AMR）。抗菌药物用于治疗感染性疾病，当病原体对其失去响应时，便形成 AMR。细菌、病毒、真菌和寄生虫一旦耐药，治疗难度加大，更易引发重症或死亡，且传播更快。AMR 是进化的产物：人类研发药物对病原体施加选择压力，而过度处方与滥用则加速这一过程。适者生存，若新药开发跟不上，我们终将落败。
AMR 持续上升，研究显示它已成为全球 主要死因之一。仅 2021 年，细菌 AMR 直接导致 114 万人死亡，并间接促成 471 万人死亡。为应对 AMR，世界卫生组织（WHO）于 2015 年建立全球抗菌药物耐药与使用监测系统，统一数据收集、报告和共享，并制定战略重点：加强 AMR 监测、提高耐药感染诊疗质量。
每年 11 月 18 日至 24 日，WHO 举办“世界 AMR 认知周”，通过全球教育活动警示 AMR 危害，提升数据共享价值，并呼吁卫生、环境与政府系统采取果断联合行动。
从研究机构、制药企业到公共卫生专家，各方都在努力，Illumina 则通过基因组技术提供支持。新一代测序（NGS）的进步革新了微生物基因组学，使研究人员能够深入解析 AMR 的生物学机制，为公共卫生人员制定监测与防控措施、为药企发现治疗靶点、为临床医生提供治疗选择。
寻找“最小耐药路径”
为在 AMR 战役中占得先机，科学家必须精准了解其驱动力——基因组适应性。病原体的根本目标是存活并复制，感染控制成为与进化赛跑。科学家需持续鉴定耐药出现的基因组与表型指标，其中核心策略是：微生物全基因组测序，快速发现基因组变化；基因组流行病学，据此追踪并控制 AMR。
一个典型案例是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）。该菌对多种抗生素高度耐药，已从医院扩散至社区，运动员等人群因皮肤接触面临风险。若受伤感染 MRSA，常规抗生素可能失效，感染恶化并加速传播；一旦携带者进入医院等高危环境，传播风险骤增，危及生命。基因组测序可帮助流行病学家锁定 MRSA 暴发源头并及时干预。
“Illumina NGS 技术可在整个诊疗链条助力全球 AMR 危机应对。”Illumina 全球医学事务传染病总监 Courtney Maus 表示，“例如，WHO 推荐靶向 NGS 检测耐药结核分枝杆菌，实现个体层面 AMR 控制；NGS 也用于监测，阻止耐药菌传播，尤其在易感人群集中的医疗环境。”
借助 Illumina 全基因组测序（WGS）、NGS 及文库制备试剂盒，科研人员可优化 AMR 削减策略：检测并鉴定病原体与耐药基因，预测表型耐药、监测耐药趋势、实现快速检出；微生物基因组数据还能评估抗菌药物疗效，为新药研发提供依据，改善患者治疗。
跟随微生物基因组学之路
全球机构已利用 WGS 与 NGS 追踪病原体演变。研究机构、高校与实验室结成合作，在中低收入国家完善 AMR 监测基础设施，生成可共享的开放数据，支持公共卫生项目，开发有效干预措施应对新兴 AMR。
以下五家 Illumina 用户正用基因组学应对本地 AMR：
苏黎世大学医学微生物研究所微生物基因组学组 利用 NGS 解析 AMR 生物学机制，助力新诊断与疗法开发。
德州拉伯克 MicroGenDX 通过 NGS 微生物快速鉴定，为术后感染、脓毒症、急性与呼吸道感染患者提供靶向治疗窗口。
华盛顿特区公共卫生实验室 NGS 核心平台正建立呼吸道合胞病毒（RSV）监测系统，实时追踪不同毒株传播，指导防控。
德州泰勒 Advanta Genetics 采用精准宏基因组学，用 NGS 一次性检测感染样本的遗传与微生物谱及 AMR 标记。
约翰内斯堡国家传染病研究所结核中心利用 NGS 追踪南非耐药结核，实现早发现、早干预，降低传播风险。
