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农业, 人物

甘薯测序加强食品安全

G. Craig Yencho和Bode Olukolu共同获得2017 Agricultural Greater Good Initiative基金资助

甘薯测序加强食品安全
2017年1月18日

自2011年以来,Agricultural Greater Good Initiative已经向许多研究人员资助了Illumina的产品用以开展各类基因组学项目,这些项目致力于消解全球发展中国家的饥饿、营养不良和贫困。得到资助的研究项目遍布全球,包括各个科学发现的领域,增进了对粮食不稳定地区主要作物和牲畜的研究。

本周在圣地亚哥举行的动植物基因组会议上,Illumina向来自北卡罗莱纳州立大学的研究人员颁发了2017年度的奖项,他们的项目为六倍体甘薯(Ipomoea batatas)开发了高质量的从头全基因组组装和一个SNP芯片。园艺学部的教授G. Craig Yencho博士和研究助理教授Bode Olukolu博士将会使用此次资助来开发并验证代表甘薯全球多样性的SNP芯片。

“我们为继续颁发这个奖项感到自豪,这是我们推动开展相关研究的方式,这些研究对化解全球各个地方的营养不良和贫困具有巨大的潜力,”Illumina农业基因组学副总监Ryan Rapp博士说道。我们收到了数以百计的Agricultural Greater Good Initiative申请,这说明了基因组学在解决全球食品需求方面是何等重要。

甘薯因为极强的气候适应能力,是全球第七大重要的粮食作物。[1]然而,由于甘薯的基因组是杂合六倍体,拥有96条染色体,要使用分子育种技术培育更多富含营养甘薯的同时,为满足不同地区的需求而对品种进行优化,这是非常复杂而艰巨的任务。

“甘薯对化解发展中国家营养不良和饥饿的状况具有巨大的潜力,” Yencho说道。“橙色肉质的甘薯就是一个绝佳的例子。这种甘薯富含原维生素A,对其进行生物改造和强化以后作为主食在撒哈拉以南非洲和东南亚地区能很好地抗击维生素A缺乏症。”

“Greater Good Initiative能够帮助我们更好地解开甘薯遗传复杂性的谜团,为我们开发全球甘薯培育者的现代育种工具添砖加瓦,”Olukolu补充道。

资助的测序试剂可以产出20Tb的数据,这些数据可以用来完成从头组装项目并增强SNP检出,从而帮助开发用于全球甘薯育种项目的SNP芯片。该团队也计划凭借他们与撒哈拉以南非洲、亚洲和南美洲研究人员的合作关系将所掌握的知识应用起来,加强营养资源匮乏地区的食品安全。

 

[1] Rodriguez-Bonilla L, Cuevas HE, Montero-Rojas M, Bird-Pico F, Luciano-Rosario D, Siritunga D (2014) Assessment of genetic diversity of sweet potato in Puerto Rico. PLoS One. 9(12):e116184.

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