微生物基因组学, 社区, 产品

废水监测能否保护公众健康?

Biobot Analytics正在使用废水数据来预测COVID-19激增和其他疫情爆发

废水监测能否保护公众健康?
2022年3月21日

无论我们是否意识到,我们每次使用卫生间时都会留下与健康有关的线索。

我们毫不犹豫地冲进下水道的排泄物为Biobot Analytics提供了丰富数据,使他们能深入了解公众健康。Biobot是全球第一家将废水数据商业化的公司。我们食用的食物、携带的病原体以及使用的药物最终都会进入废水中,因此这些污水中包含了大量关于公众健康的信息。

对于首席执行官兼联合创始人Mariana Matus来说,从事废水领域的工作与个人经历有关。Matus在墨西哥城长大,她曾经看到许多河流和湖泊被污染,渐渐失去生机,因为大部分废水未经处理就被排放到环境中。她说:“我从小就目睹了人类和废水对环境的直接影响,我想为改善环境贡献自己的力量。”

当Matus来到美国麻省理工学院Eric J. Alm的实验室攻读博士学位时,Alm正参与在NIH人类微生物组计划中。在实验室,Matus解释说:“我们已经习惯于将粪便视为反映个人健康状况的数据。”进而,她想了解:如果我们可以通过研究个人的粪便来了解其健康状况,那么通过观察污水中的人类排泄物,我们是否可以了解一个城市的健康状况呢?

Biobot Analytics于2017年分拆出来,当时Matus即将结束她的博士项目。她与联合创始人——建筑师Newsha Ghaeli,首先开发了Biobot来追踪社区中阿片类药物(鸦片类药物)和其他高风险药物的使用情况。他们的目的始终是为了改变公共卫生官员的关注点,这些官员更关注的不是药物消费率,而是过量服用药物致死的人数,以此作为核心指标——即使这些数据在不同城市之间的追踪、记录和共享情况不一致。

2020年,当COVID大流行发生时,公司的规模扩大,并开始专注于传染病。最近,Biobot与Illumina 合作 ,对Biobot提供的废水样本进行 Illumina COVIDSeq™检测 验证。

在大流行期间,Biobot的工作证明,相比与医院报告,废水数据可以帮助公共卫生体系提前两周,预测COVID激增情况。Biobot使用聚合酶链式反应(PCR)和RNA测序(利用Illumina的工具)来收集有关疾病传播的信息,后者使科学家能够监测变异株的传播。Matus说:“在COVID之前,[废水]数据纯粹是一项学术研究。”但借助Biobot的数据,波士顿市区的医院能够在Omicron激增之前采取预防措施,减少他们的择期手术并增加急诊室的容量。

到目前为止,Biobot已与包括美国卫生与公众服务部和美国疾病控制与预防中心 (CDC) 在内的政府机构合作来应用他们的技术。Biobot每周测试200多个社区样本,这些样本代表美国44个州的3000多万人。Matus说,公司还将与希望监测其工作区域中COVID爆发情况的雇主及其他人合作。

展望未来,Matus希望将Biobot测试推向美国的各个州和大都市。最终,她希望公司能够从世界各地的城市和国家收集数据,成为全球传染病和人类健康数据的来源。Matu说:“我最大的愿望是,这些数据可以从全新未知转变为足够可信,最终成为了解人类健康的新标准。”

 

如需了解更多有关通过废水测序监测传染病的信息,请点击 此处.

如需阅读更多有关鉴定新型冠状病毒株和其他新型病原体的信息,请点击 此处.

Recent Articles

开拓农业基因组学研究与保护之路
开拓农业基因组学研究与保护之路
鲜为人知的基因组学应用:减轻奶牛打嗝强度
鲜为人知的基因组学应用:减轻奶牛打嗝强度
Nucleus Genomics致力推动个性化医疗成为现实
Nucleus Genomics致力推动个性化医疗成为现实