遗传&罕见疾病, 社区

Rarebase正在寻找治疗机会

加州一家公司的精准医疗平台可同时研究数千种罕见遗传病

Rarebase正在寻找治疗机会
Reyna,Jainu和Shruti Jogani | 图片来源: Jaime Borschuk
2022年10月31日

旧金山湾区居民Jainu和Shruti Jogani刚出生的女儿Reyna已经在家中生活近三周了。在这段时间里,他们发现女儿出现了一些类似癫痫的症状——症状发作的速度很快,他们甚至无法用视频记录下来。于是,他们带女儿去做了标准血液检查、核磁共振扫描和心电图检查,检查结果显示一切正常,只有癫痫基因panel显示异常。此外,Reyna的视力较弱等症状也一直不见好,所以,身为父母的他们做了最坏的打算。

在Reyna三个月生日前后,她的基因测序结果出来了,显示她患有CDKL5缺乏症。就在那一刻,Jainu和Shruti开始明白,等待他们的将是一段充满挑战的旅程。他们选择让女儿接受全基因组测序,以便更好地了解突变的程度,并可能有助于选择反义寡核苷酸(ASO)等基于研究的疗法。这种由同名基因突变引起的罕见病在新生儿中的发病率为1/40,000-1/60,000——奇怪的是,大约90%的确诊新生儿是女孩

后来,在为有罕见病患者的家庭举办的一次聚会上,Jainu结识了Rarebase的联合创始人Onno Faber和Omid Karkouti。Rarebase是一家精准医疗公司,致力于为罕见遗传病患者探索治疗机会。这次引见使Rarebase与非营利组织Hope4Harper建立了合作关系,该组织致力于支持为CDKL5缺乏症患儿开展的研究。

CDKL5缺乏症以从婴儿期开始出现的癫痫发作和发育迟缓为特征,是Rarebase的研究组合中的罕见遗传病之一。Rarebase也位于旧金山湾区,旨在为缺乏医疗服务的罕见病社区开发一种更具可扩展性的药物发现方法。目前,该实验室共有7名研究人员和2名工程师,负责人是Chris Moxham博士——一位在罕见病临床阶段药物开发方面具备专业知识的药物研发者。

Rarebase的联合创始人兼首席运营官Omid Karkouti和Jogani全家以及Rarebase发现研究总监Sabine Topka博士。

生物医学研究领域经历的大数据革命让Rarebase能够以一种新颖的方式来填补罕见病药物发现的空白:即在单个研究平台内研究数千种罕见遗传病。Rarebase将该平台命名为Function™。团队可以利用这些数据为个别疾病发现精准医疗机会,并评估整个罕见遗传病空间。

Function可以确定直击罕见遗传病的生物学根源的候选药物。通过直击根源,该公司旨在“重新平衡失调的基因表达”,同时缓解各种疾病的多种症状,最终加快在整个遗传罕见疾病领域内发现新药的速度。

Faber表示:“我们正在利用Function研究平台,在大约2,700种经FDA批准的药物的疗效与每种疾病的潜在生物学根源之间寻找匹配关系。”为了开展能够为Function提供信息的药物筛选,Rarebase研究人员使用Illumina NovaSeq™ 6000NextSeq™ 2000进行基因表达输出。新一代RNA测序让Rarebase团队能够从系统层面了解包括CDKL5缺乏症在内的各种罕见遗传病的潜在生物学根源。他们预计,这种测序的详细程度将全面改善药物预测。“我们正在对更多细胞类型进行筛选,针对我们的现有数据集开发推断方法,以此来扩展我们的数据集,努力覆盖更多治疗领域。”

关于Reyna的病情,他解释道:“到目前为止,我们已经确定了几种有望改变CDKL5基因表达的候选药物。我们还需要对这些候选药物进行更多评估,因此,接下来,我们会在包含CDKL5基因变异的细胞模型中对这些化合物进行试验。”

在研究的每个阶段,Rarebase都需要患者和家属的支持和配合。他们同那些与Reyna家有着类似遭遇的家庭合作,这样,患者社区就能及早为亲人找到治疗机会。迄今为止,Rarebase团队已经对近4,000种化合物进行了初步筛选,其中一半以上已经获得了FDA的批准。此外,该团队还为目前正在与他们合作的27个患者群体确定了能够“老药新用”的初步候选药物。

图片来源:Jaime Borschuk

如今,Reyna已经四岁了。Jainu表示,了解Reyna体内的CDKL5突变能够帮助他们更好地获得精准医疗和可选方案:“我们对Reyna抱有很高的期望。许多人认为我们的想法很疯狂,但是,我们真的希望她能独立生活,能够正常读书,上大学,组建家庭,过上她想要的生活。这肯定不容易,但我们认为,随着医学的进步,一切皆有可能。”

Jainu和Shruti创立了非政府组织CDKL5 South Asia,致力于在当地提高人们对CDKL5缺乏症的认识,因为,当地的新生儿罹患CDKL5缺乏症的可能性是美国的三倍,但基因检测却难以获得。目前,他们正在帮助医院区分CDKL5缺乏症和雷特综合征——一种具有相似特征的疾病,支持制药公司对潜在的治疗药物开展试验,努力消除由此类导致患者身体衰弱的罕见病带来的耻辱感,尽量改善孩子们的生活质量。

此外,Jainu还担任CDKL5联盟的主席。该联盟由来自35个国家/地区的团体组成,致力于为患有这种疾病的儿童提供公平的治疗选择。

Faber表示,成立两年以来,Rarebase已经取得了重大进展:“我们正在通过大规模应用尖端的药物搜寻技术,来改变发现和开发罕见遗传病潜在治疗候选药物的方式——我们十分看好未来的发展前景。”

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