Comparison Table
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| TruSeq RNA v2 | TruSeq Stranded mRNA | TruSeq RNA Access | |
|---|---|---|---|
| 用途 | 简单、经济的方案，适用于编码转录组的分析。 | 最清晰、最完整的编码转录组视图，带有精确的链信息。 | 最清晰、最完整的编码转录组视图，带有精确的链信息，且起始量要求低。 |
| 适用于NeoPrep系统 |
否 | 是 | 否 |
| 起始量 | 0.1 – 1ug 高质量的总RNA 10-400ng 过去分离的mRNA |
NeoPrep: 25-100ng LT/HT: 0.1 – 1ug 总RNA或 10-100ng 过去分离的mRNA |
10ng 高质量的总RNA 20ng 降解的总RNA |
| 手工操作时间a | ~4.5 小时 | NeoPrep: ~30 分钟 LT/HT: ~4.5 小时 |
~11 小时 |
| 分析时间b | ~10.5 小时 | NeoPrep: ~10.5 小时 LT/HT: ~10.5 小时 |
~2 天 |
| FFPE兼容性 | 否 | 否 | 是 |
| 捕获方法 | Oligo dT磁珠捕获poly-A尾 | Oligo dT磁珠捕获poly-A尾 | 捕获探针靶定编码RNA序列 |
| 捕获内容 | 编码转录组 | 编码转录组 | 编码转录组 |
| 链型 | 无 | 有 | 有 |
a NeoPrep分析时间包括文库制备、定量和均一化。
b 手工操作时间是指16个文库从文库制备到均一化的时间。