Comparison Table
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| Nextera Mate Pair | TruSeq Synthetic Long-Read | |
|---|---|---|
| 用途 | 目前唯一一种可制备12 kb mate pair文库且无需跑胶的方法，对DNA投入量的要求最低。它是比对长的配对末端的理想方法，适合de novo组装和结构变异的检测。 | 合成的长片段文库制备，适合组装成长序列或人类全基因组的分相。带来了更高的准确性，适合de novo基因组组装、基因组finishing研究，并能够区分同源染色体上的变异。 |
| 投入量 | Gel-Free: 1 ug Gel-Plus: 4 ug |
500 ng |
| 多重分析 | 12重 | 不可用 |
| 方法 | 靶定大的环化片段的连接位点的方法。 | 随机剪切gDNA产生长片段的方法。这些大的片段随后用Nextera酶标记，用于下游的组装。 |
| 仪器兼容性 | HiSeq, NextSeq, MiSeq, GAII | HiSeq |
| 分析 | 能够分析mate-pair序列的第三方软件 | TruSeq Long-Read Assembly App 或 TruSeq Phasing Analysis App |