TruSeq Stranded mRNA + Ribo-Zero Epidemiology
TruSeq Stranded mRNA + Ribo-Zero Epidemiology
从流行病学样本中制备转录组文库时，我们建议使用Ribo-Zero rRNA Removal Epidemiology Kit以及TruSeq stranded mRNA kit。这个试剂盒适用于由人类/小鼠/大鼠、革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌RNA组成的样品，可去除细胞质和线粒体rRNA。
起始材料:从1-5 ug总RNA开始RiboZero，然后将10-100 ng RiboZero产物用于TruSeq操作（请参阅用户指南中“Purify and Fragment mRNA”一节的第二点说明）。
LT HT
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| * 文库制备与Illumina所有仪器兼容。建议仪器是根据所选应用的典型产量和分析需求选择的。 † 基于RNA图谱分析时每个样品有20M序列，转录组分析时每个样品有50M序列。FFPE或降解样品的序列数使用两次。 |
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| 项目建议 | ||||
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| 物种兼容性 | 带有细菌的人类、小鼠、大鼠 请使用MatchMaker Tool™检验其他物种的兼容性 |
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| 建议的Illumina仪器* | NextSeq 500 | HiSeq 2500 (双流动槽) | ||
| 每次运行建议的样品数量† | RNA图谱分析: 6–20 转录组分析: 2–8 |
RNA图谱分析: 30–200 转录组分析: 12–80 |
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| 运行模式 | 中等产量t | 高产量 | 快速运行 | 高产量 |
| 建议的最长读长 | 2x75 bp | 2x75 bp | 2x75 bp | 2x75 bp |
| 建议的二次分析 |
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| 建议的下游分析 |
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