TruSeq RNA v2

TruSeq RNA v2

TruSeq RNA v2提供了一个简单而经济的方案,能够利用oligo dT磁珠从总RNA中产生poly-A mRNA文库。

起始材料:为100 ng总RNA而优化,最多可使用1 ug总RNA,或从0.1-1 ug总RNA中纯化而来的mRNA部分。

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* 文库制备与Illumina所有仪器兼容。建议仪器是根据所选应用的典型产量和分析需求选择的。
基于RNA图谱分析时每个样品有10M序列,转录组分析时每个样品有25M序列。
项目建议
物种兼容性 任何带有poly-A尾的高质量RNA
建议的Illumina仪器* NextSeq 500 HiSeq 2500 (双流动槽)
每次运行建议的样品数量 RNA图谱分析: 13–40
转录组分析: 5–16
RNA转录组分析: 60–400
转录组分析: 24–160
运行模式 中等产量 高产量 快速运行 高产量
建议的最长读长 2x75 bp 2x75 bp 2x75 bp 2x75 bp
建议的二次分析
  • TopHat Alignment BaseSpace App
  • Cufflinks Assembly & DE BaseSpace App
  • RNA Express v1.0 BaseSpace App
建议的下游分析
  • Genomatix Pathway
  • iPathway Guide