The SolCAP Tomato Consortium

The SolCAP Tomato Consortium

SolCAP番茄基因分型集合是由茄科协调农业计划（SolCAP）设计的，它致力于将最新的基因组进展转化到茄科的育种项目中。SNP包括通过对TA496 EST和Heinz 1706（加工番茄）品系的基因组测序而来的Sanger法eSNP，以及通过对NC84173（新鲜市场）、FL7600 （新鲜市场）、OH08-6405（新鲜市场）、OH9242（加工番茄）PI114490（樱桃）和PI128216 （S. pimpinellifolium）品系的Illumina转录组测序而鉴定出的SNP。SolCAP产生了四个栽培品种、一个S. lycopersicum var. cerasiformae品种和一个S. pimpinellifolium品种的序列数据。社区已提供SolCAP番茄SNP芯片的群集文件，适合各种项目规模的快速自动化分析。此芯片适合作为基本内容，并添加80,000个附加内容，形成定制的番茄基因分型芯片。