OvineSNP50 BeadChip芯片是最全面的全基因组基因分型芯片,适合绵羊基因组,为拷问多个品种的遗传变异提供了出色的能力。这款BeadChip芯片是由Illumina与国际绵羊基因组联盟(ISGC)合作开发的,其成员包括AgResearch、Baylor、UCSC以及澳大利亚的联邦科学与工业研究组织(CSIRO)的顶尖研究人员。OvineSNP50 BeadChip芯片特有54,000多个SNP,它们均匀分布在整个绵羊基因组上,实现了多个应用,如全基因组筛选、数量性状位点(QTL)的鉴定、遗传优势的评估、跨品种作图、连锁不平衡研究、比较基因组研究,以及评估生物多样性的品种鉴定。
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规格 | ||||
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固定标记的数量 | 54,241 | 经过验证的SNPs Illumina RRS mtDNA 其他 |
557 17,042 8 36,634 |
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样品数量 | 12 | 多态性位点(所有家养品种) | 49,451 | |
DNA需求 | 200 ng | MAF | 平均/中值 0.30/0.28 |
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分析 | Infinium HD Ultra | 孟德尔不一致 | 0.01/<0.1 | |
FFPE兼容性 | 是 | 间隔 (kb) | 平均/中值 50.9/42.6 |
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