在牧羊业中，最重要的动物是“培育公羊的公羊”，这种动物产生了整个行业中所使用的公羊。通过几千只公羊的基因分型，研究人员可评估重要经济性状的大量变异。为了开发绵羊BeadChip芯片，Illumina与国际绵羊基因组联盟（ISGC）合作，这个联盟包括来自AgResearch、贝勒大学、UCSC以及澳大利亚联邦科学与工业研究组织（CSIRO）的主要研究人员。为了开发低密度的绵羊芯片，Illumina在新西兰与AgResearch合作。
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