International Brassica SNP Consortium

International Brassica SNP Consortium

SNP是从80个B. napus品系、4个B. oleracea品系和4个B. rapa品系中提取并验证的，因此适用于任何芸苔属A或C基因组物种。人们可以预计，B. napus种质资源中最高数量的SNP将是多态的。国际芸苔属SNP联盟提供了多达16个独立的SNP来源，在选择SNP时考虑。这些数据集来自80多个芸苔属品系，包括转录组和基因组的新一代测序数据。13,000多个SNP经过多个实验室的验证，以确保SNP独立开发通路的效果。社区已开发此产品的群集文件，而主要的贡献者来自TraitGenetics公司和Agriculture and Agrifood Canada。此芯片最多可添加30,000个附加的标记，形成一个真正定制的芸苔属基因分型芯片。