BovineSNP50 (24个样品)

BovineSNP50 (24个样品)

BovineSNP50 BeadChip芯片特有54,000多个SNP探针,它们均匀分布在牛基因组中,带来高通量且经济的遗传筛查。此分析提供了业界最高的检出率,允许灵活的内容部署,并实现了拷贝数变异的检测和测定。BovineSNP50是由Illumina与USDA-ARS、密苏里大学和阿尔伯塔大学共同开发的。BovineSNP50的内容已经用牛HapMap联盟描述的常见SNP(MAF ≥ 0.05)优化过,其SNP探针针对19种奶牛和肉牛的重要经济品种的新位点,这些位点是利用Illumina的Genome Analyzer进行测序而发现的。BovineSNP50实现了多个应用,如全基因组筛选、数量性状位点的鉴定、个体遗传优势的评估以及比较基因组研究。

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规格
固定标记的数量 54,609 新颖的SNP,它们来自Illumina Genome Analyzer对常见牛品种的测序 24,181
定制标记的最大量 30,000 Bovine HapMap SNPsBtau assembly SNPsWhole-Genome ShotgunHolstein BAC SNPsUMD 3.0 SNPs 12,342
9,404
6,038
1,411
54,060
样品数量 24 血统标记 120
DNA需求 200 ng FFPE兼容性
分析 Infinium HD Ultra 间隔 (kb) 平均/中值
49.4/36.9

产品和订购信息

  • BovineSNP50 v2 Whole-Genome Genotyping Kits: WG-450-2001 (48 Samples), WG-450-2002 (288 Samples), WG-450-2003 (1152 Samples).
  • BovineSNP50 Product Page