BovineSNP50 BeadChip芯片特有54,000多个SNP探针,它们均匀分布在牛基因组中,带来高通量且经济的遗传筛查。此分析提供了业界最高的检出率,允许灵活的内容部署,并实现了拷贝数变异的检测和测定。BovineSNP50是由Illumina与USDA-ARS、密苏里大学和阿尔伯塔大学共同开发的。BovineSNP50的内容已经用牛HapMap联盟描述的常见SNP(MAF ≥ 0.05)优化过,其SNP探针针对19种奶牛和肉牛的重要经济品种的新位点,这些位点是利用Illumina的Genome Analyzer进行测序而发现的。BovineSNP50实现了多个应用,如全基因组筛选、数量性状位点的鉴定、个体遗传优势的评估以及比较基因组研究。
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| 规格 | ||||
|---|---|---|---|---|
| 固定标记的数量 | 54,609 | 新颖的SNP,它们来自Illumina Genome Analyzer对常见牛品种的测序 | 24,181 | |
| 定制标记的最大量 | 30,000 | Bovine HapMap SNPsBtau assembly SNPsWhole-Genome ShotgunHolstein BAC SNPsUMD 3.0 SNPs | 12,342 9,404 6,038 1,411 54,060 |
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| 样品数量 | 24 | 血统标记 | 120 | |
| DNA需求 | 200 ng | FFPE兼容性 | 是 | |
| 分析 | Infinium HD Ultra | 间隔 (kb) | 平均/中值 49.4/36.9 |
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