BovineHD BeadChip芯片是最全面的牛基因分型芯片,为拷问任何肉牛和奶牛品种的遗传变异提供了出色的能力。Illumina与主要的农业思想领袖合作开发了此产品,包括USDA-ARS、UNCEIA-INRA、辉瑞动物保健品公司和密苏里大学。
这款BeadChip芯片特有超过777,000个SNP,它们均匀分布在整个牛基因组上,实现了广泛的应用,如全基因组筛选、数量性状位点的鉴定、遗传优点的评估、跨品种作图、连锁不平衡研究、比较遗传学研究,以及用于评估生物多样性的品种鉴定。8个样品的BovinHD BeadChip芯片,以及成熟的Infinium HD Assay,代表了牛的全基因组研究的强大高通量方案。
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| 规格 | ||||
|---|---|---|---|---|
| 固定标记的数量 | 777,962 | 血统 | 116 | |
| 样品数量 | 8 | 多态性位点(MAF ≥0.05) | 749,577 | |
| DNA需求 | 200 ng | MAF | 平均/中值 0.28/0.28 |
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| 分析 | Infinium HD Super | 孟德尔不一致 | 0.08/<0.1 | |
| FFPE兼容性 | 是 | 间隔 (kb) | 平均/中值 3.43/2.68 |
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