면역 종양학 연구
종양 특성 규명 연구를 위한 유전체 도구
면역종양학은 종양이 자연 면역 반응을 회피하는 방법에 대한 이해를 바탕으로 암과의 싸움에서 큰 진전을 이룬 새롭게 부상하는 분야입니다. 선도적인 면역종양학 연구자들은 면역요법 반응 인자, 생체표지자, 유전체학을 연구하기 위해 차세대 시퀀싱(NGS)을 활용하여 개인 맞춤형 면역요법 연구를 개선하고 있습니다.
종양이 면역 반응을 회피하기 위해 사용하는 작용 기전에 대한 면역종양학 연구는 유망한 치료 표적 연구를 도출해 냈습니다. 이러한 치료 연구는 암을 표적으로 삼는 면역 체계의 능력을 강화하거나 종양이 면역 반응을 회피하는 능력을 제한합니다. 또한 NGS는 종양 환경에서 어떤 경로가 활성화되고 암세포 증식, 생존, 침입, 전이와 같은 과정에 어떻게 관여하는지 파악하는 데 도움을 줄 수 있습니다.
면역요법: 차세대 암 치료 연구
이 Application Note는 이 빠르게 발전하는 분야를 지원하기 위해 진화하는 트렌드, 연구자의 요구사항, 유전체 기술 등 면역종양학의 최근 발전을 강조합니다.
NGS 기반 면역종양학 연구 솔루션
종양 미세환경과 면역 구성
NGS는 암 유전체학에 관한 상세한 분석을 제공할 수 있는 강력한 도구입니다. 또한 실시간 종양 미세환경을 높은 민감도로 효율적으로 평가하여 종양 성장이나 치료 연구에 반응하는 면역 표지자 발현을 모니터링할 수 있습니다. NGS는 면역세포 레퍼토리의 특성 규명, 미세환경 내 다양한 세포집단 식별, 수천 개의 표적에서 동시에 유전자 발현에 대한 포괄적 정량화가 가능합니다.
종양 돌연변이 부담 및 신생항원 예측
NGS는 연구자들이 신생항원을 식별하고, 면역 반응을 촉진하는 혁신적인 치료를 연구하며, 유전자 변이가 그 효능에 어떻게 영향을 미칠 수 있는지 이해하는 데도 도움이 될 수 있습니다. 또한 NGS는 종양 특이적 반응을 유도하는 데 적용할 수 있는 새로운 종양 항원을 예측적으로 선택할 수 있게 해 줍니다.
종양 미세환경 분석을 위한 공간 전사체학
공간 전사체학은 조직 절편에 매핑된 유전자 발현 패턴의 지형학적 배열을 제공하여 구조와 활성을 연결합니다. 이 기능을 통해 연구자들은 세포 수준에서 생물학적 상호 작용을 명확하게 설명하고 종양 미세환경과 같은 복잡한 조직에 대한 새로운 인사이트를 얻을 수 있습니다.
암의 장내 미생물 구성
NGS는 암 발생, 진행, 치료 효능에 대한 숙주-마이크로바이옴 상호 작용의 영향을 연구하는 데 사용할 수 있습니다. NGS는 다양한 맥락에서 미생물 군집을 프로파일링할 수 있으며, 이는 암에 대한 새로운 치료 접근법 개발 연구에 있어 표적이 될 수 있는 종이나 상태의 확인에 매우 중요합니다.
종양 미세환경에서의 단일세포 분석
암과 종양 미세환경의 전사체 프로파일을 단일세포 분해능으로 조사하기 위해 단일세포 RNA 시퀀싱(scRNA-Seq)이 점점 더 많이 사용되고 있습니다. 면역세포 연구는 단일세포 전사체와 병용하여 암 면역감시 및 면역요법에 대한 내성의 핵심 인자를 이해하는 데 적용되고 있습니다.
NGS 기반 암 연구 애플리케이션
| 신생항원, 돌연변이 부담 |
발현 프로파일링 |
마이크로바이옴(16S) 시퀀싱 |
TCR/BCRa 프로파일링 |
후성유전학 프로파일링 |
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|---|---|---|---|---|---|
| 치료 연구 애플리케이션 | |||||
| 체크포인트 억제제 | |||||
| 백신 | |||||
| 입양 세포 치료 연구 | |||||
| 예후 진단 | |||||
| 마이크로바이옴 | |||||
| 면역 레퍼토리 | |||||
| 모니터링 |
- 주요 애플리케이션
a TCR, T세포 수용체(T-cell receptor); BCR, B세포 수용체(B-cell receptor)
종양학 연구에서의 멀티오믹스—여러 층위의 정보는 단일 오믹스 연구만으로는 해결할 수 없는 종양 생물학에 대한 새로운 인사이트를 제공합니다.
면역 종양학 연구의 멀티오믹스 접근법
멀티오믹스 연구는 유전체, 후성유전체, 전사체, 메타지노믹, 단백체 접근법에서 얻은 고차원 데이터 세트를 통합하며, 이러한 기술로 생성된 방대한 양의 데이터를 해석하기 위해 계산 및 네트워크 생물학을 사용하는 경우가 많습니다. 임상 연구 데이터에 멀티오믹스를 적용하면 기존 오믹스 방법론의 발견 역량을 증폭시켜 새로운 생체표지자와 면역요법 표적을 발굴할 수 있습니다.
또한 멀티오믹스 접근법은 종양 및 미세환경의 분자 프로필에 대한 종합적인 관점을 제공할 수 있습니다.
면역요법 연구를 위한 NGS 워크플로우
Illumina는 면역종양학 연구를 위한 데이터 분석 옵션에 대한 액세스와 함께 여러 라이브러리 준비 및 시퀀싱 옵션을 제공합니다. 간소화된 워크플로우와 유연한 키트 구성으로 다양한 연구 설계를 수용할 수 있습니다.