공간 전사체학

공간 전사체학이란?

공간 전사체학의 주요 이점은 조직 절편에 매핑된 유전자 발현 패턴의 지형학적 배열을 제공하여 구조와 활성을 연결한다는 점입니다. 이 기능을 통해 연구자들은 세포 수준에서 생물학적 상호 작용을 명확하게 파악하여 종양 미세환경과 같은 복잡한 조직에 대한 새로운 통찰력을 얻을 수 있을 뿐만 아니라, 정상 조직과 질병 조직의 세포 활동을 비교 분석하고, 세포 활동의 정량적 아틀라스를 작성하는 등 다양한 작업을 수행할 수 있습니다.

기존에는 조직 절편에서 유전자의 공간적 발현을 확인하는 데 면역조직화학염색법(IHC)과 제자리 하이브리드화가 일반적으로 사용되었습니다. 다만 이러한 방법은 처리량에 한계가 있어 한 번에 몇 개의 유전자만을 분석할 수 있습니다. 고처리량 이미징과 시퀀싱을 결합한 RNA-Seq를 이용한 공간 전사체학은 이전에는 접근이 불가능했던 형태학적 맥락에서 전사체를 볼 수 있게 해줍니다. 조직 샘플 내 생물학적 분자의 정확한 위치를 유지하는 공간 RNA-Seq 방법은 Illumina의 건강과 질병 기전에 대한 이해의 폭을 넓혀 줄 수 있습니다.

공간 생물학은 세포 수준에서 후성유전체학, 유전체학 및 단백질체학 정보와 같은 다른 분석 방법을 통합하는 동시에 보존된 조직 내에서 맥락적 정보를 유사하게 제공할 수 있습니다. 이러한 방법은 집합적으로 공간 멀티오믹스라는 용어에 포함되며, 생물학적 시스템을 포괄적으로 이해하기 위한 다차원적 접근법을 제공합니다. 다수의 공간 멀티오믹스 애플리케이션에 사용할 수 있도록, Illumina는 구조적, 기능적 및 공간적 인사이트를 연결하여 다음 발견을 가능하게 하는 NGS 기반 기술을 제공합니다.