단일세포 및 초저사용량 RNA-Seq
단일세포 RNA 시퀀싱 소개
복잡한 생물학적 체계는 개별 세포의 조정된 기능에 의해 결정됩니다. 벌크 유전체(bulk genome) 또는 전사체 데이터를 제공하는 기존의 방법으로는 이러한 복잡성을 유발하는 세포 이질성을 밝힐 수 없습니다. 단일세포 시퀀싱은 개별 세포의 유전체 또는 전사체를 검사하여 세포 간 변이에 대한 고분해능 보기를 제공하는 차세대 시퀀싱(NGS) 방법입니다.
초저사용량 및 단일세포 RNA 시퀀싱(scRNA-Seq) 방법을 통해 연구진은 복잡한 조직에서 개별 세포의 독특한 생물학을 탐색하고 환경 단서에 대한 세포 아집단 반응을 이해할 수 있습니다. 민감도 높은 scRNA-Seq 접근법은 분화, 증식, 종양 형성 등 시간 의존적 과정에서 세포 기능 및 이질성을 연구하는 데 유용합니다.
단일세포 RNA-Seq의 장점
단일세포 및 초저사용량 RNA-Seq 방법은 최소한의 사용량으로 편향되지 않은 방식으로 전사체를 연구하기 위한 강력한 도구입니다. 단일세포 RNA 시퀀싱은 다양한 연구 분야에 적용될 수 있으며, 건강과 질병에서 세포 기능에 대한 이해를 변화시킬 가능성이 있습니다.
- 고품질 샘플을 위한 단일세포 사용량 수준까지 강력한 전사체 분석.
- 통합 프로토콜은 전체 세포에서 직접 진행되며 샘플 무결성을 보존합니다.
- 고해상도 분석을 통해 일반적으로 벌크 샘플링 및 RNA-Seq 방법으로 가려지는 세포 차이를 발견할 수 있습니다.
단일세포 시퀀싱 및 분석 워크플로우 비디오
단일세포 시퀀싱을 실시하면 어떤 세포 타입이 존재하는지, 각각의 세포가 복잡한 생물학적 체계의 기능에 어떤 방식으로 기여하는지 발견할 수 있습니다. 조직 준비부터 분석에 이르기까지 Illumina 단일세포 시퀀싱 워크플로우를 활용하는 방법을 확인해보세요.
벌크 및 단일세포 RNA-Seq 간의 차이
벌크 RNA-Seq는 전체 조직에 대한 통찰력을 제공하는 데 탁월합니다. 이는 연구자들이 큰 그림을 이해하는 데 도움이 될 수 있으며 새로운 발견을 위한 비표적 접근법으로 사용될 수 있습니다. 그러나, 벌크 RNA-Seq는 줄기 세포 또는 순환 종양 세포와 같이 드물지만 생물학적으로 관련된 아집단에서 전사물을 캡처하지 못할 수 있습니다. 또한, 벌크 RNA-Seq에서 식별된 저발현 유전자는 대신 희귀 세포 타입에서 강건하게 발현될 수 있습니다.
대조적으로, 개별 세포에 대해 단일세포 RNA 시퀀싱 데이터가 생성되어, 동일한 검체 내 세포 간의 미묘한 구분에 대한 보다 깊은 통찰력을 가능하게 합니다. 개별 세포 간의 변이는 동일한 세포 아집단을 검사할 때에도 엄청날 수 있습니다. 이는 특히 전사체, 즉 유전체 및 후성유전체의 상대적 안정성에 비해 반응성이 더 높고 역동적인 유전체에 적용됩니다. 단일세포 분해능에서 복잡한 장기 및 조직을 검사하는 것은 많은 질병 및 시스템에 대한 이해를 증진하는 데 매우 중요합니다.
고처리량 및 저처리량 scRNA-Seq 방법
단일세포 RNA 시퀀싱 방법은 세포 처리량으로 구분할 수 있습니다.
실험당 수억에서 수백만 개의 세포를 비용 효과적인 방식으로 검사하고자 하는 연구자들에게는 고처리량 단일세포 프로파일링 방법이 권장됩니다.
저처리량 방법은 실험당 수십 개에서 수백 개의 세포를 처리해야 하는 과학자들에게 권장됩니다. 저처리량 접근법은 일반적으로 기계적 조작 또는 세포 분류/분할 기술을 포함합니다.
아래에서 고처리량 및 저처리량 단일세포 RNA-Seq 방법에 대한 워크플로우를 살펴보세요. 두 방법 모두 검증된 Illumina sequencing by synthesis(SBS) chemistry를 활용합니다. Illumina의 시퀀싱 시스템은 규모와 상관없이 단일세포 시퀀싱 연구에 이용할 수 있는 입증된 NGS 솔루션을 제공하기 위해 유연한 처리량과 높은 데이터 정확도를 지원하고 있습니다.
초저사용량 및 단일세포 RNA-Seq을 위한 고처리량 워크플로우
이 민감하고 확장 가능하며 비용 효과적인 고처리량 scRNA-Seq 방법을 통해 유전자 발현에 대한 귀중한 인사이트를 얻으세요.