암 전장 엑솜 시퀀싱
암의 코딩 변이 식별
암 엑솜을 시퀀싱하면 종양 진행에 기여하는 코딩 변이에 대한 귀중한 정보를 얻을 수 있습니다. 엑솜이 유전체의 2% 미만을 차지하므로, 차세대 시퀀싱(NGS) 기술을 이용한 암 전장 엑솜 시퀀싱(WES)은 전장 유전체 시퀀싱(WGS)의 비용 효과적인 대안적 방법입니다. 암 엑솜 시퀀싱은 또한 전장 유전체 접근법에 비해 더 관리하기 쉬운 데이터 세트를 생성합니다.
암 엑솜 시퀀싱의 주요 이점
- 광범위한 애플리케이션 전반에서 암 변이 식별
- 전장 유전체 시퀀싱의 비용 효과적인 대체 방법 제공
- 희귀 암 관련 변이를 검출하기 위해 유전체의 코딩 영역을 딥 시퀀싱 가능
- WGS 데이터보다 더 쉽게 분석할 수 있도록 더 관리하기 쉬운 데이터 세트 생성
암 연구에서 WES의 잠재적 애플리케이션
바이오마커 발견
암 연구자들은 WES 및 RNA 시퀀싱을 사용하여 종양 관련 유전자 발현 프로파일을 발견할 수 있습니다.
혈액에서 변이체 데이터 포착
WES를 사용하여 혈액 샘플에서 유전적 변이를 발견하는 것은 최소한으로 침습적이면서 연구자들이 암의 예측 또는 진단 바이오마커를 포착하는 데 도움이 될 수 있습니다.
연구에 암 취약성 정보 제공
암 취약성 및 조기 발생과 관련된 요인에 대한 연구는 향후 번역 인사이트 및 표적 가능한 유전자 또는 경로에 매우 중요합니다.
종양 엑솜은 암 생물학에 대한 새로운 인사이트를 도출합니다
이탈리아의 연구자들이 종양 생검 샘플로부터 어떻게 암 WES를 실시하여 종양 발병과 진행의 유전적 토대를 보다 잘 이해하고, 바이오마커를 식별하며, 치료적 중재에 대한 반응을 예측하는지 알아보세요.
기사 읽어 보기포괄적인 암 전장 엑솜 시퀀싱 워크플로우
Illumina는 암 엑솜 시퀀싱을 위한 라이브러리 프렙, 시퀀싱 및 데이터 분석 연구 옵션을 제공합니다. 간소화된 라이브러리 프렙 워크플로우와 유연한 키트 구성으로 여러 연구 설계를 수용합니다. 사용이 용이한 도구로 데이터 분석을 단순화합니다.
라이브러리 프렙
엑솜 2.5 인리치먼트를 동반한 Illumina DNA 준비
라이브러리 프렙 및 하이브리드화 시약, 포괄적 엑솜 프로브 패널, 클린업/크기 선택 비드 및 인덱스를 포함하는 빠르고 완벽한 고성능 전장 엑솜 시퀀싱 키트입니다.
Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
민감하고 포괄적인 전장 엑솜 시퀀싱 솔루션이 FFPE(포르말린 고정, 파라핀 포매) 샘플에서 저빈도 변이를 검출하기 위한 종양-정상 워크플로우를 제공합니다.
시퀀싱
NextSeq 1000 및 2000 System
이러한 비용 효율적이고 사용이 용이하며 중간 수준의 처리량을 갖춘 벤치탑 시퀀싱 기기는 최신 애플리케이션을 지원하는 뛰어난 유연성을 제공합니다.
NovaSeq X 시리즈
NovaSeq X 시리즈는 프로덕션 규모에서 데이터 집약적인 방법을 수행할 수 있는 광범위한 애플리케이션을 제공합니다.
데이터 분석
Illumina DRAGEN 2차 분석
엑솜뿐만 아니라 유전체, 전사체 및 메틸롬 연구를 포함한 다양한 애플리케이션에 대한 정확하고 포괄적이며 효율적인 NGS 데이터 분석.
Illumina DRAGEN Somatic
DRAGEN Somatic Pipeline은 종양 샘플에서 낮은 대립유전자 빈도로 존재할 수 있는 체세포 변이를 식별합니다. 이 파이프라인은 종양/정상 쌍 및 Tumor-only 시퀀싱 데이터를 분석할 수 있습니다.
Illumina DRAGEN Enrichment
전체 엑솜 및 표적 패널 NGS 데이터를 위한 정확하고 효율적인 엔드투엔드(FASTQ~VCF) 2차 분석 솔루션. 이 앱은 생식세포 및 체세포 변이 검출 모두에 사용할 수 있습니다.
관련 시퀀싱 방법
암 전장 유전체 시퀀싱
암 연구를 위한 전장 유전체 시퀀싱을 통해 새로운 특징과 이점을 살펴보세요.
Cancer RNA 시퀀싱
RNA-Seq가 어떻게 암 유전자 발현과 종양 진행을 유도하는 유전자 융합에 대한 정보를 밝혀낼 수 있는지 알아보세요.
Cancer Research Methods Guide
암 연구 방법 가이드는 광범위한 암 연구 애플리케이션을 위한 간단하고 포괄적인 워크플로우가 포함된 40페이지 이상의 포괄적인 리소스입니다. 이 가이드에는 단일세포 시퀀싱, 공간 시퀀싱, 메틸화 프로파일링, 멀티오믹스, 세포유리 RNA 시퀀싱 등이 포함되어 있습니다.
무료 가이드 다운로드계속 둘러보기
소아암의 고유한 복잡성 처리하기
새로운 엑솜 기반 검사는 이러한 희귀 암을 유발하는 생식세포와 체세포의 유전자 변이를 파악하는 데 도움이 될 것입니다.
NGS가 희귀 바이오마커를 발견하는 것에 큰 가치가 있음을 입증
이 기사에서 Vivek Subbiah 박사는 희귀 바이오마커를 발견하는 것이 암 환자에게 어떤 큰 영향을 미칠 수 있는지 설명합니다.
왜 전장 유전체 또는 엑솜 시퀀싱을 선택하나요?
어떤 방법이 연구에 가장 적합한지 판단하기 위해 두 접근법의 장점을 살펴보세요.
참고 문헌
Schwarze K, Buchanan J, Taylor JC, Wordsworth, S. Are whole-exome and whole-genome sequencing approaches cost-effective? A systematic review of the literature. Genet Med. 2018 Oct;20(10):1122-1130. doi: 10.1038/gim.2017.247.