유전체학으로 면역학적 질환에 대한 인사이트 획득

면역유전체학 연구

유전체학 분석 기술은 면역 세포 기능과 신호전달을 설명함으로써 면역학 연구를 발전시킬 수 있습니다. 복잡한 자가면역 질환(루푸스, 류마티스 관절염, 다발성 경화증 등)과 기타 면역학적 장애의 원인은 아직 잘 알려져 있지 않습니다.

Illumina의 면역유전체학 솔루션은 면역학 연구자들이 잠재적 자가면역 질환 기전, 면역 레퍼토리, 면역 관련 유전자 변이의 기능적 결과에 대한 인사이트를 얻는 데 도움이 될 수 있습니다. 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)은 연구 커뮤니티가 높은 해상도에서 면역 반응을 매핑하는 데 필요한 품질, 처리량, 리드 길이를 제공합니다. 마이크로어레이(microarray)는 인간 면역계의 유전자 변이에 대한 대규모 연구를 위해 고밀도 콘텐츠를 제공합니다. 

면역학 연구 간행물 리뷰
면역학 연구 리뷰

면역학자가 NGS를 사용하는 다양한 방법을 보여주는 피어 리뷰 간행물의 요약을 살펴보세요.

리뷰 읽어 보기

차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)은 겉으로 보기에는 무한한 표적 배열을 인식할 수 있는 면역 세포의 방대한 레퍼토리를 매핑하는 고성능 면역유전체학 연구 도구인 것으로 입증되고 있습니다.1 레퍼토리 시퀀싱을 통해 연구자들은 자가면역 질환, 혈액암, 기타 질병에 취약성이 있는 개인에서 발견되는 고유한 수용체 변이를 식별할 수 있었습니다.2  

T세포 수용체 레퍼토리 분석

연구자들은 미토콘드리아 DNA 및 피위 상호작용 RNA뿐만 아니라 T세포 수용체(TCR) 레퍼토리의 시퀀싱을 통해 질병의 작용 기전을 밝혀냅니다.

인터뷰 읽어 보기
단일세포 수준에서의 면역학 발견
단일세포

중증 천식 환자의 기도 T세포에 대한 단일세포 분석부터 반응성 성상세포 연구에 이르기까지, 단일세포 시퀀싱 접근법을 활용한 면역학 연구에 대해 들어 보세요.

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면역학에서의 시퀀싱 기반 발견
형광 세포

옥스퍼드 대학교, 하버드 의과대학, 그리고 뉴욕대학교의 교수들이 NGS 데이터가 비정형 면역 세포 집단과 조직 특이적 면역 반응에 대한 이해도를 향상시킨 방법에 대해 논의합니다.

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단일세포 기술 및 멀티오믹스를 사용한 보다 심층적인 면역 발견 촉진
단일세포

단일세포 도구를 사용한 멀티오믹스 분석을 통해 희귀 면역 세포 유형에서 새로운 바이오마커를 발견하고 이를 통해 고함량 유세포 분석 특성 확인 실험이 이루어지는 과정을 살펴보세요.

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면역유전체학을 사용한 항종양 T세포 레퍼토리 디코딩
T세포 및 종양 세포

존스홉킨스 대학교 의과대학 조교수인 Kellie Smith 박사가 암 신생항원과 면역 반응의 상호 작용에 대해 논의합니다.

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면역유전체학 연구 기사

 
종양 특이적 HLA 리간드
종양 특이적 HLA 리간드를 이용한 정밀 면역요법

RNA-Seq 및 인간 백혈구 항원(HLA) 형별 검사를 통해 표적 발견 플랫폼의 역량과 효율성이 증가하고 있습니다.

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표적 DNA 분석
HLA 유전학과 자가면역 질환

연구자들은 NGS로 유전체를 쿼리하고, 면역 매개 질병에 대한 새로운 위험 유전자좌를 식별하기 위해 고처리량 유전형 분석을 실시합니다.

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유방암
NGS가 바이오마커 발견에 있어 높은 가치를 입증

연구자들은 암 유전자 발현 분석, 면역학 연구, 면역요법 바이오마커 연구 등에 NGS를 활용합니다.

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AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel: T세포 수용체(T-cell receptor, TCR) 베타 사슬 재배열을 시퀀싱하여 T세포 다양성 및 클론 확장 조사.

AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR (Short Read) Panel: TCR 베타 사슬 재배열을 시퀀싱하여 종양 샘플에서 T세포 다양성 및 클론 확장을 측정하기 위한 FFPE 적합 패널입니다.

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel: 종양-면역 체계 상호작용에 관여하는 395개의 유전자를 조사하는 표적 RNA 발현 패널입니다.

NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템: 이러한 벤치탑 시퀀싱 시스템은 면역 레퍼토리를 자세히 살펴보는 데 필요한 판독 자료를 제공하고 광범위한 애플리케이션에서의 유연성을 제공합니다.

Partek Flow 소프트웨어: 이 소프트웨어는 사용이 용이하며 V(D)J 시퀀싱 데이터를 포함한 멀티오믹스 데이터의 분석 및 시각화를 지원합니다.

Infinium Immunoarray: 단일 마이크로어레이(microarray)에서 자가면역 질환 및 면역 기능 관련 유전자 변이를 평가해 보세요.

Infinium 글로벌 스크리닝-24 키트: 확장 가능하고 비용 효과적인 집단 유전학 연구를 수행하고 HLA 및 KIR 유전자 변이와 같은 면역학 관련 변이를 연구합니다.

단일세포 오믹스 및 세포 면역학 연구

Illumina Genomics Podcast의 에피소드 45에서 Shalin Naik 박사는 면역계를 이해하기 위한 단일세포 유전체학의 사용에 대해 논의합니다.

지금 들어 보기
NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템의 전장 IR-Seq

NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템이 전장 V(D)J 시퀀싱을 포함한 복잡한 면역 레퍼토리 시퀀싱(IR-Seq) 연구를 어떻게 가능하게 하는지 알아보세요.

Application Note 읽어 보기
애플리케이션 노트: NextSeq 1000 및 2000 시스템의 IR-Seq
종양 면역원성 연구
종양 및 T세포

NGS는 연구자들이 종양이 면역반응을 회피할 수 있는 돌연변이와 T세포 매개 면역을 강화할 수 있는 신생항원을 식별하는 데 도움이 될 수 있습니다. 면역종양학 연구에 대해 더 알아보세요.

복합 질환 유전체학
복합 질환 유전체학

Illumina의 시퀀싱 기술은 분자 수준에서 자가면역 질환 및 류마티스 질환, 죽상동맥경화증, 정신 질환 및 기타 질환의 이해를 돕는 새로운 연구 방법을 제시하고 있습니다. 복합 질환 연구에 대해 자세히 알아보세요.

COVID-19 면역반응 연구

SARS-CoV-2 바이러스에 대한 개별 면역계 반응을 조사하면 질병 취약성 및 중증도에 대한 이해를 높일 수 있습니다. 바이러스에 대한 면역학적 반응을 연구하고 유전적 위험 인자를 식별하는 방법에 대해 살펴보세요.

면역 반응 프로파일링에 대해 더 알아보기
면역 반응 프로파일링
통합 유전체학으로 IBD 발견 주도
면역유전체학을 통한 IBD 발견 촉진

Carl Anderson 박사는 염증성 장질환(IBD) 연구의 통합된 연구 접근방식에 관해 논의합니다.

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세포 및 항체
자가면역의 미스터리 밝혀내기

Carola Vinuesa 박사는 NGS가 자가면역을 조절하는 세포와 분자의 복잡한 상호작용을 어떻게 밝혀낼 수 있는지에 대해 논의합니다.

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팟캐스트를 듣는 사람
유전체학 및 면역 질환

Janna Saarela 박사는 유전체학을 사용하여 흔한 면역 질환과 희귀한 면역 질환의 배후 작용 기전을 식별하는 것에 대해 논의합니다.

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단일세포의 암 특이적 단백질 패턴
단일세포의 암 특이적 단백질 패턴

막 단백질을 정량화하고 공간적으로 매핑하며 면역 세포 행동 메커니즘을 발견합니다.

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참고 문헌
  1. Woodsworth D.J., Castellarin M., and Holt R.A. Sequence analysis of T-cell repertoires in health and disease. Genome Med. 2013; 5:98.
  2. Robins H. Immunosequencing: applications of immune repertoire deep sequencing. Curr Opin Immunol. 2013; 25: 646-652.