NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 인간 전장 엑솜 시퀀싱(WES)을 위한 비용 효율적이고 안정적인 솔루션을 제공합니다. 이 키트는 다음을 제공합니다.
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
포괄적인 최신 엑솜 인리치먼트 패널을 포함하는 빠르고 신뢰할 수 있는 고성능 인간 전장 엑솜 시퀀싱 솔루션.
6.5시간
Assay 시간
~2시간
수작업 시간
고품질 genomic DNA 50~1,000 ng(직접 혈액 및 타액의 경우, 참조 가이드 확인)
사용량
개요
단일 공급 업체로 간소화된 워크플로우 솔루션
이 전장 엑솜 시퀀싱 키트에는 라이브러리 준비 및 하이브리드화 시약, 세척/크기 선택 비드 및 인덱스가 포함되어 있습니다. 또한 이 키트에는 Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel이 포함되어 있는데, 이는 공공 데이터베이스에 보고된 변이에 대해 개선된 표적 영역 커버리지를 제공합니다.
맞춤형 콘텐츠
관심 대상에 맞게 설계된 추가 Custom Enrichment Panel을 통해 WES 실험에 대상을 쉽게 추가하거나 중요한 대상의 커버리지를 넓혀 보세요. 맞춤형 Illumina Custom Enrichment Panel v2를 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment에 스파이크인(spike-in)으로 추가해 보세요. 무료 assay 설계 도구인 DesignStudio를 사용하거나 Illumina Concierge 설계 팀의 도움을 받아 맞춤형 WES 스파이크인 패널을 설계해 보세요.
사양
| Assay 시간 | 6.5시간 |
|---|---|
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 콘텐츠 사양 | 37.5 Mb 코딩 콘텐츠(≥ 99%의 RefSeq, CCDS, ClinVar 및 ACMG 병원체/병원체일 가능성이 있는 변이, COSMIC 암 유전자 센서스), OMIM |
| 설명 | 비용 효율적이고 안정적인 인간 전장 엑솜 시퀀싱을 위한 최신 엑솜 콘텐츠의 집중 인리치먼트 프로브 패널을 사용하는 인리치먼트 워크플로우가 포함된 빠르고 사용하기 쉬운 라이브러리 준비입니다. |
| 수작업 시간 | ~2시간 |
| 사용량 | 고품질 genomic DNA 50~1,000 ng(직접 혈액 및 타액의 경우, 참조 가이드 확인) |
| 기기 | NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 |
| 작용 기전 | BLT(Bead-Linked Transposome) 및 하이브리드 캡처 chemistry |
| 방법 | 표적 DNA 시퀀싱, 엑솜 시퀀싱, 표적 인리치먼트 |
| 멀티플렉싱 | 최대 12플렉스의 사전 인리치먼트 풀링이 테스트됩니다. 키트 구성은 최대 192개 샘플의 멀티플렉싱을 지원합니다. 최대 384개가 가능합니다. |
| 핵산 종류 | DNA |
| 표적적중 리드 | 내부 테스트의 평균 성능을 기준으로 약 90% |
| 특수 샘플의 종류 | 혈액, 타액 |
| 종 카테고리 | 인간 |
| 기술 | 시퀀싱 |
| 균일성 | 내부 테스트의 평균 성능을 기준으로 ≥ 91%(5 Gb의 경우 20× 기준 % 커버리지) |
| 변이 클래스 | 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) |
필수 제품
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment 키트에는 라이브러리 준비, 인리치먼트, 인리치먼트 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터 시약이 포함되어 있습니다. 원하는 경우 다른 인덱스 세트를 선택해 보세요.
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel은 미토콘드리아 DNA 변이의 인리치먼트 및 시퀀싱을 가능하게 하는 선택적 고정 함량 스파이크인 패널입니다.
직접 혈액을 주입하려면 Flex Lysis Reagent Kit가 필요합니다.
Infinium MIDI Heatblock Insert는 SciGene HybEx Microheating 시스템에 적합하며 인리치먼트 단계에 필요합니다.
스파이크인 패널
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment Kit는 Illumina Mitochondrial Panel 또는 Illumina Custom Enrichment Panel v2용 Twist Bioscience와 함께 스파이크인 패널로 사용할 수 있습니다. Custom Enrichment Panel은 DesignStudio 설계 도구 또는 Illumina Concierge 설계 팀을 통해 설계할 수 있습니다.
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건
애플리케이션
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 빠르고 포괄적인 end-to-end whole-exome 시퀀싱 솔루션으로, 샘플부터 보고까지 지원합니다.
워크플로우 예시
라이브러리 준비
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
프로젝트 권장 사항
| 기기 | 권장 샘플 수 | 리드 길이 |
|---|---|---|
| NextSeq 2000 시스템 | 런당 샘플 수(플로우 셀 타입별): P2: 19, P3: 57(50× 평균 표적 커버리지, 42M 개의 리드, 4.2 Gb의 데이터 기준) |
2 × 101 bp |
| NovaSeq 6000 시스템 | 런당 샘플 수(플로우 셀 타입별): SP: 34, S1: 69, S2: 176, S4: 428(50배 평균 표적 커버리지, 42M 개의 리드, 4.2 Gb의 데이터 기준) 참고: S4: 428에는 NovaSeq Xp Workflow 또는 추가 인덱스가 필요합니다. |
2 × 101 bp |
관련 애플리케이션 및 방법
전장 엑솜 시퀀싱은 유전체의 단백질 코딩 영역을 조사하여 질환이나 인구집단 건강 상태에 유전체가 미치는 영향을 밝히는 데 사용됩니다.
Comprehensive array and next-generation sequencing solutions to accelerate research of various genetic complex diseases.
Illumina의 시퀀싱 및 마이크로어레이 기술은 DNA부터 RNA 분석, 후성유전학 등에 이르기까지 다양한 암 유전체학 연구 애플리케이션을 지원합니다.
다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법
비교하기
| Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina DNA Prep with Enrichment | |
|---|---|---|
| Assay 시간 | 6.5시간 | ~6.5시간 |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 콘텐츠 사양 | 37.5 Mb 코딩 콘텐츠(≥ 99%의 RefSeq, CCDS, ClinVar 및 ACMG 병원체/병원체일 가능성이 있는 변이, COSMIC 암 유전자 센서스), OMIM |
엑솜: 45 Mb 엑손 콘텐츠(RefSeq, CCDS 및 Ensembl 코딩 콘텐츠의 ≥98%). 맞춤형: 관심 유전체 콘텐츠 0.5~15 Mb. 고정 패널: 콘텐츠는 패널에 따라 다릅니다. |
| 설명 | 비용 효율적이고 안정적인 인간 전장 엑솜 시퀀싱을 위한 최신 엑솜 콘텐츠의 집중 인리치먼트 프로브 패널을 사용하는 인리치먼트 워크플로우가 포함된 빠르고 사용하기 쉬운 라이브러리 준비입니다. | 전체 엑솜, 맞춤형 및 고정 패널 표적 시퀀싱을 포함한 다양한 실험을 위한 시퀀싱 라이브러리를 낮은 DNA 입력 및 다양한 샘플 유형으로부터 약 6.5시간 내에 준비합니다. |
| 수작업 시간 | ~2시간 | ~2시간, ~2시간 |
| 사용량 | 고품질 genomic DNA 50~1,000 ng(직접 혈액 및 타액의 경우, 참조 가이드 확인) | 고품질 genomic DNA 10~1,000 ng, FFPE DNA 50~1,000 ng. (혈액 및 타액의 경우 참조 가이드 확인). |
| 기기 | NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 |
| 작용 기전 | BLT(Bead-Linked Transposome) 및 하이브리드 캡처 chemistry | 비드 결합 트랜스포좀 및 하이브리드 캡처 chemistry |
| 방법 | 표적 DNA 시퀀싱, 엑솜 시퀀싱, 표적 인리치먼트 | 커스텀 시퀀싱, 표적 DNA 시퀀싱, 엑솜 시퀀싱, 표적 인리치먼트 |
| 멀티플렉싱 | 최대 12플렉스의 사전 인리치먼트 풀링이 테스트됩니다. 키트 구성은 최대 192개 샘플의 멀티플렉싱을 지원합니다. 최대 384개가 가능합니다. | 최대 384개의 사용 가능한 고유한 듀얼 인덱스. 최대 12플렉스의 사전 인리치먼트 풀링이 테스트됩니다. |
| 핵산 종류 | DNA | DNA |
| 표적적중 리드 | 내부 테스트의 평균 성능을 기준으로 약 90% | 엑솜 패널의 경우 ≥85%(예시 데이터 세트의 결과, 실제 성능은 다를 수 있음) |
| 특수 샘플의 종류 | 혈액, 타액 | 혈액, 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직, 타액 |
| 종 카테고리 | 인간 | 기타, 인간 |
| 기술 | 시퀀싱 | 시퀀싱 |
| 균일성 | 내부 테스트의 평균 성능을 기준으로 ≥ 91%(5 Gb의 경우 20× 기준 % 커버리지) | ≥90%(4 Gb의 경우 20x 기준 % 커버리지, Exome Panel의 경우) |
| 변이 클래스 | 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) | 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) |
선택 도구:
Library Prep and Array Kit Selector
Find the right sequencing library preparation kit or microarray for your needs. Filter by method, species, and more. Compare, share, and order kits.
Sequencing Coverage Calculator
Calculator to help determine the reagents and sequencing runs needed to arrive at desired coverage for your experiment.
그림
Exome 2.5 Panel의 성능 향상
라이브러리 제품군은 1.5시간 또는 16시간의 하이브리드화 시간이 포함된 Exome 2.5 Panel 또는 1.5시간 하이브리드화 시간을 갖는 Illumina Exome Panel(IEP, 20020183) 중 하나를 갖는 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment을 사용하여 구성 및 농축하였습니다. 농축한 라이브러리는 NovaSeq 6000 시스템에서 시퀀싱하고 DRAGEN Enrichment App을 사용하여 분석했습니다.
인실리코에서 높은 데이터베이스 표적 커버리지.
Exome 2.5 Panel 및 Exome Panel에 대한 bed files를 열거된 공개 데이터베이스와 비교하고 중첩 백분율을 결정하여 보고했습니다.
공공 데이터베이스에서 질병 관련 변이에 대한 탁월한 커버리지
1.5시간(주황색) 또는 16시간(파란색)의 하이브리드화 시간을 사용하는 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 공공 데이터베이스 표적의 ≥ 20×에서 높은 평균 커버리지 백분율을 보여줍니다.
자원
프로브 설계부터 데이터 분석까지 다양한 표적 시퀀싱 응용 프로그램을 위한 포괄적인 솔루션입니다. 맞춤형으로 설계된 패널은 GC가 풍부하고 시퀀싱이 어려운 영역에 대한 향상된 적용 범위를 제공하여 높은 균일성과 적용 범위를 보장합니다.
엑솜 키트 (2)
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation Set B (96 Samples, 12-plex)
20077595
Includes Illumina DNA Prep with Enrichment library preparation and enrichment reagents, Twist Bioscience for Illumina Exome 2.0 Plus Panel, Illumina Purification Beads, and IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation for whole exome enrichment of 96 libraries (eight, 12-plex enrichment reactions).
List Price:
Discounts:
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation Set D (96 Samples, 12-plex)
20077596
Includes Illumina DNA Prep with Enrichment library preparation and enrichment reagents, Twist Bioscience for Illumina Exome 2.0 Plus Panel, Illumina Purification Beads, and IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation for whole exome enrichment of 96 libraries (eight, 12-plex enrichment reactions).
List Price:
Discounts:
패널 (4)
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel
20093180
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel can be used for combined enrichment of both human exome plus mitochondrial DNA from whole exome libraries. Provides 32 ul of material, sufficient for 96 samples when paired with Exome 2.5 Panel in the Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment kits (8 hybridization reactions at 12-plex with up to 4 ul oligo panel per reaction), or a minimum of 64 samples when paired with Exome 2.5 Panel in the lllumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment kit (16 hybridization reactions at 4-plex with 2 ul oligo panel per hybridization reaction).
List Price:
Discounts:
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)
20073953
Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 32 µl of material (sufficient for 8 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)
20073952
Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 384 µl of material (sufficient for 96 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)
20111339
Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 1536 µl of material (sufficient for 384 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.
액세서리 제품 (8)
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)
20018706
Includes reagents for processing blood samples with the Illumina DNA Prep and Illumina DNA Prep with Enrichment. Purchase library prep, enrichment, enrichment probe panel, and index adapter reagents separately.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) Includes 96, 10 bp indexes sufficient for labeling 96 samples. Purchase library prep and enrichment reagents and probe panels separately.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) Includes 96, 10 bp indexes sufficient for labeling 96 samples. Purchase library prep and enrichment reagents and probe panels separately.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) Includes 96, 10 bp indexes sufficient for labeling 96 samples. Purchase library prep and enrichment reagents and probe panels separately.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) Includes 96, 10 bp indexes sufficient for labeling 96 samples. Purchase library prep and enrichment reagents and probe panels separately.
List Price:
Discounts:
Infinium MIDI Heatblock Insert
BD-60-601
Heatblock insert for the SciGene Hybex Microheating system required for the Nextera Flex for Enrichment hybridization steps.
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
Includes one, 100-ml container of beads for library clean-up and size selection. Purchase library prep and enrichment reagents, probe panels, and indexes separately.
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
Includes four, 100-ml container of beads for library clean-up and size selection. Purchase library prep and enrichment reagents, probe panels, and indexes separately.
List Price:
Discounts:
표시 /
선택 품목 요약
제품
수량
단가
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요약
제품
카탈로그 ID
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단가
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카탈로그 ID:수량:
자주 묻는 질문
예, 10~49 ng의 gDNA를 사용할 수 있습니다. 그러나, 본 프로토콜은 최종 사전 인리치먼트 라이브러리 수율이 < 50 ng을 표준화하지 않으며, 따라서 인리치먼트 전과 후에 라이브러리의 정량화 및 표준화가 필요합니다.
이 프로토콜은 EDTA 채취 튜브에 채취한 신선 혈액으로 검증되었습니다. 다른 항응고제를 사용할 수 있지만 이 키트에 사용할 수 있는지는 보장할 수 없습니다.
본 프로토콜은 Oragene DNA 타액 채취 튜브에서만 채취된 타액에 대해 검증되었습니다.
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel은 미토콘드리아 유전체(chrM)의 16,659개 염기쌍(bp)과 37개 유전자를 포괄하도록 설계된 선택적 고정 함량 패널이며 미토콘드리아 DNA(mtDNA) 변이의 인리치먼트 및 시퀀싱을 허용합니다. Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment 프로토콜에서 이 패널을 스파이크 인 패널로 사용하고 실험에 ChrM 커버리지를 추가해 보세요.
이전에 Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment라고 알려진 제품은 이제 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment(카탈로그 번호 20077595 및 20077596)라는 이름으로 선보입니다. Exome Panel의 올리고는 변경되지 않았지만 포함된 인덱스는 Illumina DNA/RNA UD Indexes로 업데이트되었습니다.
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건
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.
TruSight Oncology 500
모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.
Illumina DNA Prep
다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.
Illumina DNA Prep with Enrichment
맞춤형 및 고정 인리치먼트 패널을 위한 빠른 통합 워크플로우 및 옵션을 갖춘 광범위한 애플리케이션을 위한 완벽한 표적 재시퀀싱 솔루션입니다.
Illumina DNA Prep
다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.
Pan-Coronavirus Panel
이 패널은 인간과 동물 저장소에서 얻은 225종의 알려진 신종 코로나바이러스에 대한 특성 규명과 유전체 감시 시스템을 지원합니다.
Illumina UD Indexes
고유한 듀얼(UD) 인덱스를 사용하면 처리량을 늘리고 비용 절감의 이점을 위해 다중화할 수 있는 고품질 라이브러리를 준비할 수 있습니다.
Illumina DNA PCR-Free Prep
민감한 시퀀싱 애플리케이션을 위한 매우 정확한 데이터를 산출하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 준비 워크플로우.
Illumina RNA Prep with Enrichment
광범위한 샘플 유형 및 RNA 사용량에서 강화되고 인덱싱된 시퀀싱 라이브러리를 생산하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우.
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