MiSeq i100系列试剂盒
MiSeq i100 系列试剂采用即用型卡盒设计，并提供多种流动槽配置，带来灵活的测序选择。
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment是因美纳产品系列中速度最快、操作最简单的RNA-Seq外显子文库制备解决方案。此方案采用一体化的30分钟单管反应，将cDNA合成与链接磁珠转座酶相结合。该快速工作流程支持低起始量或降解的RNA样本，并可提供高准确度的靶向数据。
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
用于RNA外显子组分析的快速、简单的文库制备工作流程，可将cDNA合成和接头标记结合到一个步骤中。
6.5小时
分析时间
＜1.5小时
手动操作时间
1–1000 ng RNA
起始量
主要特点
快速、简化的文库制备
整个简化工作流程（含富集步骤）仅需6.5小时，手动操作时间不足1.5小时，即可生成测序级的外显子富集RNA文库。
优化的富集性能
采用全面且更新的Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel，通过90分钟杂交，实现对编码转录组的集中覆盖度。
从低起始量样本中获取高质量数据
从低至1 ng的高质量RNA或20 ng FFPE* RNA中即可获得可重复的结果，同时实现出色的靶标覆盖度。
*FFPE，福尔马林固定、石蜡包埋样本。
性能参数
| 分析时间 | 6.5小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | ⾃动化⼯作站 |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
| 说明 | 用于RNA外显子组分析的快速简便工作流程 |
| 手动操作时间 | ＜1.5小时 |
| 起始量 | 1–1000 ng RNA或20–1000 ng FFPE RNA |
| 系统 | NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, NovaSeq X测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪, MiSeq i100 Plus系统 |
| 作用机制 | 链接磁珠转座子转座酶、杂交捕获富集 |
| 方法 | 外显子组测序, mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 人 |
| 链特异性 | 非链 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 转录本变异, 单核苷酸位点变异（SNV） |
需要的产品
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment Kit包含：Illumina Rapid RNA Prep Kit、Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel、杂交试剂及因美纳纯化磁珠。标签集单独销售。
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结果
应用
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment可在短短6.5小时内完成用于全转录组分析的测序级RNA-Seq文库制备，手动操作时间少于1.5小时。
工作流程示例
文库制备
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
计划推荐
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| MiSeq i100 Plus系统 | 每个流动槽的样本数：25M个簇/样本；25M：1，50M：2，100M：4 |
2 × 100 bp |
| NextSeq 2000测序仪 | 每个流动槽的样本数：25M个簇/样本；P1：4，P2：16，P3：48，P4：72 |
2 × 100 bp |
| NovaSeq X测序仪 | 每个流动槽的样本数：25M个簇/样本；1.5B：60（30/泳道），5B：200（25/泳道），10B：400（50/泳道），25B：1000（125/泳道） |
2 × 100 bp |
相关应用和方法
RNA外显子组的序列特异性捕获可从困难样本中生成高质量的RNA-Seq文库，进行价格低廉、高通量的转录组分析。
查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。
利用RNA新一代测序（RNA-Seq）检测癌症基因表达和转录组变化，鉴定新的癌症转录本。
比较
| Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina RNA Prep with Enrichment | TruSeq RNA Exome | |
|---|---|---|---|
| 分析时间 | 6.5小时 | ＜9小时 | 约2天 |
| 自动化功能 | ⾃动化⼯作站 | ⾃动化⼯作站 | ⾃动化⼯作站 |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 | |
| 说明 | 用于RNA外显子组分析的快速简便工作流程 | 一种可重现且经济的解决方案，可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本 | 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图，链信息精确且样本起始量低。 |
| 手动操作时间 | ＜1.5小时 | < 2小时 | 约11小时 |
| 起始量 | 1–1000 ng RNA或20–1000 ng FFPE RNA | 10 ng RNA，20 ng FFPE RNA，最高1000 ng高质量RNA | 来自新鲜/冷冻样本的10 ng总RNA，或来自FFPE样本的20 ng总RNA |
| 系统 | NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, NovaSeq X测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪, MiSeq i100 Plus系统 | MiSeq测序仪, iSeq 100测序仪, NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, MiniSeq测序仪, NovaSeq 6000测序仪, MiSeq i100 Plus系统, MiSeq i100系统 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NovaSeq X测序仪, NextSeq 500测序仪, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪 |
| 作用机制 | 链接磁珠转座子转座酶、杂交捕获富集 | 链接磁珠转座酶 | 以编码RNA为靶标的生物素化的捕获探针。不要求RNA带有poly-A尾巴。 |
| 方法 | 外显子组测序, mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | 外显子组测序, mRNA测序 |
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） | 多达384个唯一双标签（UDI） | 多达24个单标签、96个组合（CD）双标签 |
| 核酸类型 | RNA | RNA | RNA |
| 特殊的样本类型 | 低起始量样本, FFPE组织 | 低起始量样本, FFPE组织 | 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 人 | 人, 病毒 | 人 |
| 链特异性 | 非链 | 非链 | 链状 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 转录本变异, 单核苷酸位点变异（SNV） | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 新型转录本, 转录本变异 |
数据图
编码转录本的有效富集
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment的测序比对指标显示，在以下多种起始量下，靶向read占比均超过98%：1 ng、10 ng和100 ng通用人类参考（UHR）RNA，以及25 ng FFPE RNA参考样本和融合RNA混合商业样本。
长短杂交时间下的等效富集指标
针对以下一系列起始量，实验比较了90分钟（橙色）与12小时（蓝色）杂交时长下Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment的reads比对率、填充的唯一read富集、中位片段长度、重复率和平均靶标覆盖度：1 ng、10 ng和100 ng通用人类参考（UHR）RNA。Picard富集指标由DRAGEN Enrichment v4.3.13生成。
高和低RNA起始量的高可重复性
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment显示1 ng和100 ng通用人类参考（UHR）RNA起始量之间归一化基因计数的高度相关性（R2= 0.99）。每百万转录本数（TPM）由DRAGEN RNA v4.4生成。
相关资源
了解有关链接磁珠转座酶的更多信息，这是一种新型化学方法，可将DNA提取、片段化、文库制备和文库归一化集成到一体化的工作流程中。此方法支持多种起始量，可为不同的样本类型提供灵活性。
文库制备 (1)
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation （96样本）
20158825
包含的试剂可用于制备和富集Rapid RNA文库样本的试剂（含32个杂交反应，每个反应包含3个文库）的96个样本，配套Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel及因美纳纯化磁珠。UD标签序列单独出售。
List Price:
Discounts:
标签接头 (4)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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配套产品 (3)
因美纳纯化磁珠，30 mL
20119944
因美纳纯化磁珠，30 mL
List Price:
Discounts:
Illumin纯化磁珠, 100mL
20060057
包含一个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
List Price:
Discounts:
Illumina纯化磁珠, 400mL
20060058
包含四个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
List Price:
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常见问题解答
第1步 - Illumina Rapid RNA Prep将cDNA合成与链接磁珠转座酶结合在单管30分钟反应中
第2步 - 标签PCR与纯化
第3步 - 用90分钟杂交富集RNA外显子组
第4步 - PCR扩增和纯化
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment可提供96样本配置。这些试剂盒设计用于完成32个反应的三重（3‑plex）富集。
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment包含Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel，与Illumina RNA Prep with Enrichment相比，总检测时间快30%。
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结果
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
NovaSeq X 系列试剂盒
NovaSeq X 系列试剂盒包括试剂卡盒、缓冲液卡盒、流动槽、冻干插片、预载缓冲液和文库联管。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment
快速、简单的RNA-Seq文库制备工作流程，具有定制富集功能，可将cDNA合成和接头标记结合到一个步骤中。
Illumina Rapid mRNA Prep
用于编码转录组分析的快速、简单的mRNA文库制备工作流程，可将cDNA合成和接头标记结合到一个步骤中
Illumina Rapid Total RNA Prep
用于全转录组分析的快速、简单的总RNA文库制备流程，将cDNA合成和接头标记结合到一个步骤中
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
提供90分钟的工作流程，以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
高性能、快速、可靠的人类全外显子组测序解决方案，包括全面、最新的外显子组富集panel。
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