MiSeq i100系列试剂盒
MiSeq i100 系列试剂采用即用型卡盒设计，并提供多种流动槽配置，带来灵活的测序选择。
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment为靶向RNA-Seq提供了一体化、基于酶法片段化的工作流程。它可支持低起始量和福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）样本，同时能够为基因表达、融合检测、小变异检测和剪接异构体分析提供高质量数据。
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment
快速、简单的RNA-Seq文库制备工作流程，具有定制富集功能，可将cDNA合成和接头标记结合到一个步骤中。
6.5小时
分析时间
＜1.5小时
手动操作时间
1-1000 ng总RNA，FFPE样本最少20 ng
起始量
周转速度快，手工操作时间短
约6.5小时即可完成测序级RNA文库制备，手工操作时间不足1.5小时。一体化的工作流程减少了人工干预，有助于实验室提高通量和效率。
不同起始量下性能稳定一致
从各种起始量生成高质量的RNA-Seq数据，适配灵活的研究设计与多样的样本类型，且不牺牲数据完整性。
对低起始量及FFPE样本具有高灵敏度检测能力
在20 ng至1000 ng总RNA范围内（包括具有挑战性的FFPE样本）均能实现可靠性能。该检测方案灵敏度高、重现性好，可确保下游分析结果的可靠性。
性能参数
| 分析时间 | 6.5小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | ⾃动化⼯作站 |
| 说明 | 一种快速的靶向RNA测序工作流程，将文库制备与富集步骤相整合，相较于标准的“RNA制备结合富集”方案，减少了操作步骤与检测时间，同时可支持低起始量及FFPE样本。 |
| 手动操作时间 | ＜1.5小时 |
| 起始量 | 1-1000 ng总RNA，FFPE样本最少20 ng |
| 系统 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, NovaSeq X测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪, MiSeq i100 Plus系统, MiSeq i100系统 |
| 作用机制 | 链接磁珠转座子转座酶、杂交捕获富集 |
| 方法 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 任何物种, 人, 病毒 |
| 链特异性 | 非链 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 转录本变异, 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel） |
应用
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment可在短短6.5小时内制备测序级靶向RNA-Seq文库，用于基因表达和变异分析，手动操作时间不到1.5小时。
工作流程示例
设计
文库制备
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment
计划推荐
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 2000测序仪, NovaSeq X测序仪, MiSeq i100系统, NovaSeq 6000测序仪 | 针对100个基因的靶向panel，旨在实现mRNA转录本平均500×的覆盖度（按平均每基因2000 bp计算），并以每基因5000条read为靶标，则每个样本需要50万条read。对于FFPE样本，建议RNA起始量至少为20 ng。 |
2 × 100 bp（变异检测的最小值） |
相关应用和方法
RNA外显子组的序列特异性捕获可从困难样本中生成高质量的RNA-Seq文库，进行价格低廉、高通量的转录组分析。
查找从降解的FFPE组织和其他低质量样本中获得高质量结果的FFPE RNA测序解决方案。
利用RNA新一代测序（RNA-Seq）检测癌症基因表达和转录组变化，鉴定新的癌症转录本。
比较
| Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment | Illumina RNA Prep with Enrichment | |
|---|---|---|
| 分析时间 | 6.5小时 | ＜9小时 |
| 自动化功能 | ⾃动化⼯作站 | ⾃动化⼯作站 |
| 说明 | 一种快速的靶向RNA测序工作流程，将文库制备与富集步骤相整合，相较于标准的“RNA制备结合富集”方案，减少了操作步骤与检测时间，同时可支持低起始量及FFPE样本。 | 一种可重现且经济的解决方案，可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本 |
| 手动操作时间 | ＜1.5小时 | < 2小时 |
| 起始量 | 1-1000 ng总RNA，FFPE样本最少20 ng | 10 ng RNA，20 ng FFPE RNA，最高1000 ng高质量RNA |
| 系统 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, NovaSeq X测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪, MiSeq i100 Plus系统, MiSeq i100系统 | MiSeq测序仪, iSeq 100测序仪, NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, MiniSeq测序仪, NovaSeq 6000测序仪, MiSeq i100 Plus系统, MiSeq i100系统 |
| 作用机制 | 链接磁珠转座子转座酶、杂交捕获富集 | 链接磁珠转座酶 |
| 方法 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 | mRNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | 多达384个唯一双标签（UDI） | 多达384个唯一双标签（UDI） |
| 核酸类型 | RNA | RNA |
| 特殊的样本类型 | 低起始量样本, FFPE组织 | 低起始量样本, FFPE组织 |
| 物种 | 任何物种, 人, 病毒 | 人, 病毒 |
| 链特异性 | 非链 | 非链 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 转录本变异, 单核苷酸位点变异（SNV）, 插入缺失（indel） | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
选择工具：
DesignStudio是基于网络的实验分析设计工具，可帮助研究人员设计并订购定制基因分型芯片探针，或定制测序检测。
数据图
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment的填充read富集性能观察
实验评估了包含20至109个基因的四个RNA富集panel。Seraseq Fusion RNA Mix v2和Seraseq FFPE Tumor Fusion RNA Reference Material v2在NextSeq™ 2000测序仪上使用2 × 151 bp双端read进行测序。对于这些样本，富集杂交时间为12小时过夜。
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment的中位片段长度观察
实验评估了包含20至109个基因的四个RNA富集panel。Seraseq Fusion RNA Mix v2和Seraseq FFPE Tumor Fusion RNA Reference Material v2在NextSeq™ 2000测序仪上使用2 × 151 bp双端read进行测序。对于这些样本，富集杂交时间为12小时过夜。
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment的重复read富集性能观察
实验评估了包含20至109个基因的四个RNA富集panel。Seraseq Fusion RNA Mix v2和Seraseq FFPE Tumor Fusion RNA Reference Material v2在NextSeq™ 2000测序仪上使用2 × 151 bp双端read进行测序。对于这些样本，富集杂交时间为12小时过夜。
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment的定制panel覆盖深度
在福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）的样本中，超过70%的panel靶标实现了平均≥ 100×的覆盖度，超过80%的靶区域实现了平均≥ 50×的覆盖度。在通用人类参考（UHR）样本中，＞ 80%的靶区域达到平均覆盖度＞ 100×，＞ 88%的靶区域达到平均覆盖度＞ 50×。实验评估了包含10至109个基因的五个RNA富集panel。
比对到基因转录区域的read
在观察到的转录本中，比对到外显子的read占比在10基因panel中为75–85%，而在包含20–109个基因的较大panel中则为85–90%。实验评估了包含10至109个基因的五个RNA富集panel。Seraseq Fusion RNA Mix v2、Seraseq FFPE Tumor Fusion RNA Reference Material v2和通用人类参考（UHR）RNA样本在NovaSeq™ 6000测序仪上使用2 × 101 bp bp双端read进行测序。对于这些样本，过夜富集杂交时间为12小时。
相关资源
深入了解链接磁珠转座酶的优势。
文库制备 (4)
Illumina Rapid RNA Prep, (S) Tagmentation（96样本）
20158824
包括使用因美纳纯化磁珠制备Rapid RNA文库的96个样本的试剂。UD标签序列单独出售。兼容mRNA Capture Kit（用于完整的mRNA文库制备工作流程）、RiboZero Plus Kit（用于完整的总RNA文库制备工作流程）或RNA Fast Hyb Enrichment Kit（用于完整的RNA富集工作流程），以上均需单独购买。
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Discounts:
Illumina Rapid RNA Prep, (S) Tagmentation（16样本）
20158823
包括使用因美纳纯化磁珠制备Rapid RNA文库的16个样本的试剂。UD标签序列单独出售。兼容mRNA Capture Kit（用于Rapid mRNA文库制备工作流程）、RiboZero Plus Kit（用于Rapid Total RNA文库制备工作流程）或Fast Hyb Enrichment Kit（用于Rapid RNA Enrichment文库制备流程），以上均需单独购买。
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Illumina® RNA Fast Hyb Enrichment (96 Samples)
20040541
包含Illumina RNA Prep with Enrichment Kit的快速杂交富集试剂，可用于32次3重富集反应。支持客户处理与建议不同的复杂度。不包括预富集试剂。如需进行富集的完整制备，请订购Illumina RNA Prep with Enrichment试剂盒。
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Illumina RNA Fast Hyb Enrichment（16样本）
20040540
包含Illumina RNA Prep with Enrichment Kit的快速杂交富集试剂，可用于16次1重富集反应。支持客户处理与建议不同的复杂度。不包括预富集试剂。如需进行富集的完整制备，请订购Illumina RNA Prep with Enrichment试剂盒。
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Panel (3)
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)
20073953
Illumina Custom Enrichment Panel V2支持120 bp的双链定制panel设计，使用DesignStudio或Concierge Services可处理100至1，000，000个探针，并提供32 µL材料（与Illumina DNA Prep with Enrichment搭配使用时，足够进行8次富集反应）。文库制备、富集和标签接头试剂需单独订购。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)
20073952
Illumina Custom Enrichment Panel V2支持120 bp的双链定制panel设计，使用DesignStudio或Concierge Services可处理100至1，000，000个探针，并提供384 µl材料（与Illumina DNA Prep with Enrichment搭配使用时，足以进行96次富集反应）。文库制备、富集和标签接头试剂需单独订购。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)
20111339
Illumina Custom Enrichment Panel V2支持通过DesignStudio或Concierge服务设计包含100到100万个探针的120 bp双链定制面板，并提供1536 µl的材料...
标签接头 (4)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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配套产品 (3)
因美纳纯化磁珠，30 mL
20119944
因美纳纯化磁珠，30 mL
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Illumin纯化磁珠, 100mL
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包含一个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
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Illumina纯化磁珠, 400mL
20060058
包含四个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
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常见问题解答
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment采用一种新的快速文库制备方法，包括以下步骤：
第1步：在单管反应中将第一和第二链cDNA合成与链接磁珠转座酶相结合
第2步：标签序列PCR和纯化以生成测序级文库
第3步：用简化的90分钟杂交步骤进行靶向富集
第4步：测序前的富集后扩增和纯化
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment支持广泛的RNA起始量，范围为1 ng至1000 ng总RNA。它可与高质量RNA以及具有挑战性的样本（包括FFPE）兼容，能够在不同的研究设计中保持一致的性能。
对于FFPE样本，建议RNA起始量至少为20 ng。
Illumina Custom Enrichment Panel v2支持靶向RNA-Seq应用，包括差异基因表达、转录本计数、基因融合检测、异构体和选择性剪接分析、SNV分析和路径分析。定制panel的设计可符合特定的研究需求，支持灵活和集中的研究设计。
使用免费的在线设计工具Illumina DesignStudio Portal，可以设计用于人类RNA应用的定制因美纳富集panel。探针以“外显子知情”的方式进行排布，避免跨越外显子-外显子连接区，从而使同一块定制panel既能用于基因表达分析，也能用于已知及新型基因融合的检测。针对非人类内容的设计支持，可通过Illumina Concierge设计团队获取。
对于使用定制panel的Illumina RNA Enrichment，每个样本的靶标数量取决于panel大小和数据分析目标。对于基因表达图谱分析，我们建议每个基因靶标靶向约1000-2000个簇。对于在体细胞肿瘤样本中检测低频融合或小核苷酸变异，我们建议以靶标mRNA转录本区域约500×的覆盖度为目标，即假设平均mRNA转录本长度为2000 bp时，每个基因约5000条read。这种高覆盖深度可检测低频变异，并且能够解释样本中跨基因panel靶标的基因表达变异。
/
结果
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
NovaSeq X 系列试剂盒
NovaSeq X 系列试剂盒包括试剂卡盒、缓冲液卡盒、流动槽、冻干插片、预载缓冲液和文库联管。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
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Illumina RNA Prep with Enrichment
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Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
高性能、快速、可靠的人类全外显子组测序解决方案，包括全面、最新的外显子组富集panel。
TruSight RNA Fusion Panel
全面的基因融合检测，覆盖来自FFPE和其他癌症研究样本的507个基因。
TruSight RNA Pan-Cancer Panel
靶向1385个癌症基因进行基因表达、变异和融合检测研究，适用于多种RNA样本类型，包括血液、骨髓和FFPE组织。
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
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