MiSeq i100系列试剂盒
MiSeq i100 系列试剂采用即用型卡盒设计，并提供多种流动槽配置，带来灵活的测序选择。
Illumina Rapid mRNA Prep是因美纳产品系列中速度最快、操作最简单的mRNA-Seq文库制备解决方案。此方案采用一体化的30分钟单管反应，将cDNA合成与链接磁珠转座酶相结合。这一快速工作流程支持低起始量的RNA样本（1–1000 ng），并可提供高准确度的非链基因表达数据。
Illumina Rapid mRNA Prep
用于编码转录组分析的快速、简单的mRNA文库制备工作流程，可将cDNA合成和接头标记结合到一个步骤中
3小时
分析时间
＜1.5小时
手动操作时间
1–1000 ng RNA
起始量
主要特点
性能参数
| 分析时间 | 3小时 |
|---|---|
| 自动化功能 | ⾃动化⼯作站 |
| 说明 | 用于编码转录组分析的快速简便工作流程 |
| 手动操作时间 | ＜1.5小时 |
| 起始量 | 1–1000 ng RNA |
| 系统 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, NovaSeq X测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪, MiSeq i100 Plus系统, MiSeq i100系统 |
| 方法 | mRNA测序 |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE, 低起始量样本 |
| 物种 | 哺乳动物, 小鼠, 人, 大鼠 |
| 链特异性 | 非链 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异, 单核苷酸位点变异（SNV） |
需要的产品
完整的Illumina Rapid mRNA Prep工作流程需要Rapid RNA文库制备试剂、mRNA捕获试剂盒与标签序列（均单独出售）：
- Illumina Rapid RNA Prep - 包含文库制备试剂（96样本或16样本试剂盒可选）
- Illumina mRNA Capture Kit - 包含用于捕获多腺苷酸化mRNA的试剂（96样本或16样本试剂盒可选）
- Illumina DNA/RNA UD Index Set, Tagmentation - 每组96标签序列可支持标签标记96样本
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结果
应用
Illumina Rapid mRNA Prep可在3小时内完成用于编码转录组分析的测序级mRNA-Seq文库制备，手动操作时间少于1.5小时。
工作流程示例
计划推荐
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| MiSeq i100系统, MiSeq i100 Plus系统 | 10–25M个簇/样本：25M：1–2，50M：1–5，100M：1–10 |
1 × 100 bp或2 × 50 bp（基因表达），最高2 × 100 bp（变异检测） |
| NextSeq 1000测序仪, NextSeq 2000测序仪 | 10M个簇/样本：P1：10，P2：40，P3：120，P4：180 25M个簇/样本：P1：4，P2：16，P3：48，P4：72 |
1 × 100 bp或2 × 50 bp（基因表达），最高2 × 100 bp（变异检测） |
| NovaSeq X测序仪, NovaSeq X Plus测序仪 | 10M个簇/样本：1.5B：150（75/泳道），5B：500（62/泳道），10B：1000（125/泳道），25B：2500（312/泳道） 25M个簇/样本：1.5B：60（30/泳道），5B：200（25/泳道），10B：400（50/泳道），25B：1000（125/泳道） |
1 × 100 bp或2 × 50 bp（基因表达），最高2 × 100 bp（变异检测） |
相关应用和方法
比较
| Illumina Rapid mRNA Prep | Illumina Stranded mRNA Prep | |
|---|---|---|
| 分析时间 | 3小时 | 6.5小时 |
| 自动化功能 | ⾃动化⼯作站 | ⾃动化⼯作站 |
| 说明 | 用于编码转录组分析的快速简便工作流程 | 简单、经济的编码转录组分析解决方案，可提供精确的链信息 |
| 手动操作时间 | ＜1.5小时 | ＜3小时 |
| 起始量 | 1–1000 ng RNA | 25-1000 ng标准质量的总RNA |
| 系统 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NextSeq 550Dx测序仪下的科研模式, NovaSeq X测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪, MiSeq i100 Plus系统, MiSeq i100系统 | NextSeq 550测序仪, NextSeq 2000测序仪, NextSeq 1000测序仪, NovaSeq X测序仪, NextSeq 500测序仪, NovaSeq 6000测序仪, NovaSeq X Plus测序仪 |
| 方法 | mRNA测序 | mRNA测序 |
| 核酸类型 | RNA | RNA |
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE, 低起始量样本 | 不兼容FFPE, 低起始量样本 |
| 物种 | 哺乳动物, 小鼠, 人, 大鼠 | 哺乳动物, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 |
| 链特异性 | 非链 | 链状 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异, 单核苷酸位点变异（SNV） | 单核苷酸多态性（SNP）, 基因融合, 新型转录本, 转录本变异 |
选择工具：
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数据图
Illumina Rapid mRNA Prep可实现高文库复杂性
使用1、10、25和100 ng通用人类参考（UHR）RNA进Illumina Rapid mRNA Prep测试，数据显示了在下采样至1M–32M簇（2M–64M双端read）的测序深度范围内，检测到的唯一基因数量（≥ 5个映射读取）。
使用Illumina Rapid mRNA Prep实现高比对效率
Illumina Rapid mRNA Prep数据显示，在以下不同起始量下均保持高比例的映射读取：1、10、25和100 ng通用人类参考（UHR）RNA，向下采样至20M簇（40M双端read）。
使用Illumina Rapid mRNA Prep实现转录本的均匀覆盖
Illumina Rapid mRNA Prep数据显示：在以下不同RNA起始量下沿转录本长度分布均保持一致的归一化覆盖度：1、10、25和100 ng通用人类参考（UHR）RNA，向下采样至20M簇（40M双端read）。
高和低RNA起始量的高可重复性
Illumina Rapid mRNA Prep显示1 ng和100 ng起始量之间归一化基因计数的高度相关性（R2 = 0.99）。每百万转录本数（TPM）由DRAGEN RNA v4.4生成。
文库制备 (4)
Illumina Rapid RNA Prep, (S) Tagmentation（96样本）
20158824
包括使用因美纳纯化磁珠制备Rapid RNA文库的96个样本的试剂。UD标签序列单独出售。兼容mRNA Capture Kit（用于完整的mRNA文库制备工作流程）、RiboZero Plus Kit（用于完整的总RNA文库制备工作流程）或RNA Fast Hyb Enrichment Kit（用于完整的RNA富集工作流程），以上均需单独购买。
List Price:
Discounts:
Illumina Rapid RNA Prep, (S) Tagmentation（16样本）
20158823
包括使用因美纳纯化磁珠制备Rapid RNA文库的16个样本的试剂。UD标签序列单独出售。兼容mRNA Capture Kit（用于Rapid mRNA文库制备工作流程）、RiboZero Plus Kit（用于Rapid Total RNA文库制备工作流程）或Fast Hyb Enrichment Kit（用于Rapid RNA Enrichment文库制备流程），以上均需单独购买。
List Price:
Discounts:
Illumina mRNA Capture Kit（96样本）
20158830
包含用于捕获和纯化96样本的多腺苷酸化mRNA的试剂。与Illumina Rapid RNA Prep兼容，单独出售。适用于完整的Rapid mRNA文库制备流程。
List Price:
Discounts:
Illumina mRNA Capture Kit（16样本）
20158829
包含用于捕获和纯化16样本的多腺苷酸化mRNA的试剂。与Illumina Rapid RNA Prep兼容，单独出售。适用于完整的Rapid mRNA文库制备流程。
List Price:
Discounts:
标签接头 (4)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation（96标签，96样本）
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96标签, 96样本)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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配套产品 (3)
因美纳纯化磁珠，30 mL
20119944
因美纳纯化磁珠，30 mL
List Price:
Discounts:
Illumin纯化磁珠, 100mL
20060057
包含一个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
List Price:
Discounts:
Illumina纯化磁珠, 400mL
20060058
包含四个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
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常见问题解答
第1步：用Illumina mRNA Capture Kit捕获poly(A) RNA
第2步：Illumina Rapid RNA Prep将cDNA合成与链接磁珠转座酶结合在单管30分钟反应中
第3步：PCR添加标签序列接头
第4步：使用随附的因美纳纯化磁珠进行纯化
Illumina Rapid RNA Prep可提供96样本和16样本配置。Illumina mRNA Capture也可提供96样本或16样本配置。
两种方法均以oligo(dT)磁珠捕获poly(A) mRNA为起始步骤。然后，Illumina Rapid mRNA Prep将采用酶法片段化生成非链状文库（总工作流程时间3小时，手动操作时间< 1.5小时），而Illumina Stranded mRNA Prep则通过连接生成链状文库（总工作流程时间6.5小时，手动操作时间< 3小时）。
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结果
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
NovaSeq X 系列试剂盒
NovaSeq X 系列试剂盒包括试剂卡盒、缓冲液卡盒、流动槽、冻干插片、预载缓冲液和文库联管。
Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
用于RNA外显子组分析的快速、简单的文库制备工作流程，可将cDNA合成和接头标记结合到一个步骤中。
Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit
单独的试剂盒，用于去除人类、小鼠、大鼠和细菌样本中的核糖体RNA和人珠蛋白mRNA。
Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit
从复杂的微生物样本（例如：粪便）中快速、高效地去除不需要的宿主和泛细菌rRNA，以便进行宏转录组学研究。
Illumina Rapid Total RNA Prep
用于全转录组分析的快速、简单的总RNA文库制备流程，将cDNA合成和接头标记结合到一个步骤中
TruSeq Stranded Total RNA
可靠的、扩展自如的全转录组分析（RNA-Seq）解决方案适用于各种物种与样本类型，包括人类、小鼠与福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本。
Illumina Rapid RNA Prep with Enrichment
快速、简单的RNA-Seq文库制备工作流程，具有定制富集功能，可将cDNA合成和接头标记结合到一个步骤中。
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