Pillar oncoReveal Nexus 21 Gene Panel

这是一种基于单管SLIMamp工作流程的稳健新一代测序(NGS)检测方案,旨在检测与血液肿瘤及实体瘤相关的基因。

检测时间 < 8小时;样本到结果 < 24小时

分析时间

约3小时

手动操作时间

20–60 ng DNA

起始量

详情请参见规格表

概览

oncoReveal Nexus 21 Gene Panel 是一款性能稳定的新一代测序(NGS)科研检测产品,旨在对 21 个与血液肿瘤及实体瘤均相关的基因进行检测分析。该检测 Panel 采用专利茎环结构抑制介导扩增技术(SLIMamp),这是一种基于重叠扩增子的文库构建化学方法,可在单管反应中高效完成目标区域富集。

核心特点

  • 检测流程高效快速,从样本处理到出具报告耗时<24 小时

  • 即使DNA投入量有限或样本质量不佳,也能实现低至1% VAF的变异检测

  • 提高实验室效率,减少"无结果判定(no calls)"和重复检测,简化数据解读

该Panel可检测从血液或FFPE组织中分离的DNA中的单核苷酸变异(SNVs)、中小型插入/缺失(indels)以及内部串联重复(ITDs)。

该Panel采用简化的富集工作流程,可快速制备测序文库,帮助实验室在同一天内完成从提取DNA到数据生成的全过程。

通过单管重叠扩增技术,任何NGS实验室均可在本地完成检测,实现对样本和检测结果的全程掌控。

规格

需要的产品

Pillar oncoReveal Nexus 21 Gene Panel还需搭配使用Pillar index试剂盒和测序试剂。如需进行二级分析并获取更深入的洞察,可兼容使用DRAGEN Amplicon和Illumina Connected Insights。

/ 结果

应用

Pillar oncoReveal Nexus 21 Gene Panel可在8小时内完成样本处理,仅需3小时手动操作时间,即可分析从实体瘤或血液肿瘤中提取的DNA。

工作流程示例

1
文库制备

Pillar oncoReveal Nexus 21 Gene Panel

比较

Pillar oncoReveal Nexus 21 Gene Panel Pillar® oncoReveal™ Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel Pillar® oncoReveal™ Myeloid Panel TruSight Oncology 500 v2
分析时间 检测时间 < 8小时;样本到结果 < 24小时 从样本到报告仅需48小时 48小时从样本到报告 3-4天完成从样本起始到最终结果的整个流程
内容说明 21 个基因 覆盖78个基因的小型泛肿瘤肿瘤学panel 对523个基因的DNA和55个基因的RNA进行靶向测序,panel总共1.94 Mb。包括MSI和TMB检测。  整合的HRD检测panel † 覆盖约25,000个SNP,可通过由Myriad Genetics提供支持的综合基因组不稳定性评分(LOH+TAI+LST)来评估同源重组修复缺陷。

日本尚不支持购买TruSight Oncology 500 v2
说明 新一代测序检测方案,可分析实体瘤和血液肿瘤相关21个基因的关键突变。 基于78个基因扩增子的panel,包含DNA和RNA内容,简单的单管工作流程 基于58个基因扩增子的DNA panel,简单的单管工作流程 可利用FFPE组织中的DNA和RNA对实体瘤进行全景变异分析。通过单个样本实现实现变异检测和生物标志物评估,以进行广泛的肿瘤特征分析。
手动操作时间 约3小时 约3小时 约3小时 自动化工作流程约 3.25 小时
手动工作流程约 5-7 小时
起始量 20–60 ng DNA 5–80 ng DNA, 10–50 ng RNA 10 ng - 80 ng DNA(推荐量为20 ng) 30 ng DNA(最低10 ng),40 ng RNA(最低20 ng)
方法 靶向DNA测序, 扩增子测序 靶向DNA测序, 扩增子测序, 靶向RNA测序 靶向DNA测序, 扩增子测序 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集
核酸类型 DNA DNA, RNA DNA DNA, RNA
扩增子数 Pool 1: 112 扩增子 池 1(DNA):341 个扩增子。池2(RNA):80 多个扩增子,另加 MET 外显子 14 跳跃 1个池,766个扩增子
反应次数 每个试剂盒24次反应 24次(DNA)/24次(RNA) 24次反应
在靶read > 99% 99.5% ± 0.1% 99.6% ± 0.2%
特殊的样本类型 血液, 低起始量样本, FFPE组织 血液, 低起始量样本, FFPE组织 血液, 低起始量样本 FFPE组织
物种
目标插入片段大小 162 bp 平均:120 bp(范围 86-185 bp) 平均:215 bp
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序
变异类别 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), Internal tandem duplications (ITDs) 基因融合, 体细胞变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) 基因融合, 转录本变异, 单核苷酸位点变异(SNV), 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV), 新型转录本, 单核苷酸多态性(SNP), 结构变异

Selection tools:

图表

基因列表

Pillar oncoReveal Nexus 21 Gene Panel包含21个基因

Panel 规格

Pillar oncoReveal Nexus 21 Gene Panel用于检测FFPE组织或血液来源DNA的规格参数

文库制备 (3)

OncoReveal Nexus 21 Gene Panel

HDA-HS-1012-24

OncoReveal Nexus 21 Gene Panel

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标签序列PI501-8、PI701-4(32个组合,96反应)

IDX-PI-1001-96

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试剂盒D,标签序列PI501-8、PI701-12

IDX-PI-1004-192

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MiSeq i100系列

简化的操作流程、先进的化学技术和机载信息学提供了易于使用、快速灵活的仪器,支持广泛的应用领域。

MiSeq i100系列试剂盒

MiSeq i100 系列试剂采用即用型卡盒设计,并提供多种流动槽配置,带来灵活的测序选择。

Illumina DRAGEN二级分析

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