Infinium Global Diversity Array-8 Kit

BeadChip将临床研究变异的出色覆盖度与优化的多种族全基因组内容相结合,用于基因型筛查。

每周约1728个样本

样本通量

每个芯片8个样本

样本数量

1,825,277个固定标记。定制标记物扩展容量:高达175K

标志物数量

详情请参见规格表

Infinium Global Diversity Array-8 Kit是Infinium Multi-Ethnic Global、Multi-Ethnic AMR/AFR和Multi-Ethnic EUR/EAS/SAS Kit的推荐替代品,现已停产。Global Diversity Array是Multi-Ethnic Kit的更新版本。

概述

Infinium Global Diversity Array 8-Kit(GDA)BeadChip是一款功能强大、经济高效的芯片,具有优化的多种族全基因组内容。

主要特点

  • 更新了临床研究变异的广泛覆盖范围,适用于各种应用

  • 优化的内容可实现研究的多样性

  • 高通量、可扩展的工作流程让用户能够快速收集和报告数据

All of Us计划选择

GDA是NIH精准医疗计划所信任的芯片的商业版本,它将收集>1M人群的数据,以改善健康结果。

最大限度提高变异覆盖度

高密度SNP全球骨架,用于基因组的跨群体填补覆盖,能够开发多基因风险评分并鉴定不同群体的遗传结构。

 

多种族内容

这一强大的全基因组支架旨在通过与美洲非洲血统群体哮喘联盟(CAAPA)和使用基因组学和流行病学的群体架构(PAGE)合作,标记全球人群中的常见和低频变异。内容包括非洲血统和美洲人口的>1K全基因组序列。

 

 


性能参数


所需产品

将您选择的试剂盒大小与每次运行的样本数量相匹配。每个试剂盒均按单批次处理,不可用于多个实验。如果要处理多个低通量批次,请订购多个小型试剂盒。

您可以选择使用DesignStudio自定义您的内容,也可以从作为联盟助推器的可选附加内容列表中选择。Booster附加内容可用于:

  • 神经退行性疾病(约75K SNP)

  • 肿瘤学(约9万个SNP) 

  • 携带者筛查(与Igentify合作进行解读)

请咨询您的销售代表,确认可用性和定价。

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应用

Infinium Global Diversity Array-8 Kit是一款功能强大、经济高效的BeadChip芯片,具有经过优化的多种族全基因组内容,适用于群体规模的遗传研究、变异筛查和精准医疗研究。  

工作流程示例

1
选择内容

Infinium Global Diversity Array

3
追踪、分析和报告

相关应用和方法

比较

Infinium Global Diversity Array-8 Kit Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx Infinium Global Screening Array-24 Kit Infinium Global Diversity Array with Carrier Screening Content-8 v2.0 Kit Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8
Assay type Infinium LCG Infinium LCG Infinium HTS Infinium LCG
Automation capability Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader Liquid Handling Robots, Automated Array Loader
Method Genome-Wide Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array, High-Throughput Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array Genome-Wide Genotyping Array, Cytogenomic Array
Specialized sample types FFPE Tissue, Buccal Swabs, Blood, Saliva Blood FFPE Tissue, Buccal Swabs, Blood, Saliva Blood FFPE Tissue, Buccal Swabs, Blood, Saliva
Variant class Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants Chromosomal abnormalities, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs) Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Single nucleotide polymorphisms (SNPs)
技术 Illumina芯片 Illumina芯片 Illumina芯片 Illumina芯片
标志物数量

1,825,277个固定标记。定制标记物扩展容量:高达175K

总计1,933,117个标志物;定制扩展容量175,000个

654,027个固定标记。自定义标记附加功能: 高达100K 

样本数量 每个芯片8个样本 每个芯片8个样本 每张芯片24个样本 每个芯片8个样本 每个芯片8个样本
样本通量 每周约1728个样本 每周约1728个样本 每周约5760个样本
核酸类型 DNA DNA DNA DNA DNA
物种
系统 iScan iScan iScan iScan iScan
说明 8样本的Infinium Diversity Array为整个基因组的4800多个关键基因提供了目标区域覆盖度。BeadChip中包含约180万个标记物,可高度覆盖疾病相关区域的外显子,提供高度准确的拷贝数变异检出,平均分辨率为1.5 Mb。

Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx基于8样本BeadChip芯片构建,包含>190万个标记。它是最全面的基因分型芯片,可用于药物基因组学(PGx)研究,还支持疾病和多样性研究以及其他应用。  

Infinium Global Screening Array-24 Kit是用于群体规模遗传学、转化研究、变异筛查研究和精准医学研究的经济型基因分型芯片,结合了优化的多种族全基因组内容、精选的临床研究变异和QC标记。

Infinium Global Diversity Array with Carrier Screening Content-8 BeadChip扩展了携带者筛查研究,在全球多样性芯片骨架上具有超过45K00个高影响力标记。Igentify Analyze软件简化了分析,可对关键疾病实现高检出率。 8样本Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8可广泛靶向覆盖整个基因组中的4800多个关键基因。BeadChip中包含约180万个标记物,可高度覆盖疾病相关区域的外显子,提供高度准确的拷贝数变异检出,平均分辨率为1.5 Mb。
起始量 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA

选择工具:

Infinium Global Diversity Array内容

内部饼图显示了选择用于全基因组覆盖、临床研究和质量控制(QC)的芯片的比例。外环显示1kGP中存在的唯一变异的加权参考全局等位基因频率。2未标记1kGP中的变异。计数代表唯一变异。

Global Diversity Array上的临床研究内容

临床研究内容是由专家从科学界公认的数据库中挑选的,用于为临床研究应用创建一款信息量大的芯片。变异数量可能会有变化。

Global Diversity Array上广泛的药物基因组学标记

根据CPIC指南和PharmGKB数据库选择。3PGx公共数据库变异,在PharmGKB、PharmVar、CPIC中注释的变异;全基因组PGx覆盖度,包括位于扩展ADME基因或CPIC A级基因中的标记,包括靶向填补标签SNP和CPIC A级CNV标签。

广泛覆盖全球多样性芯片上的疾病类别

(A) 根据ClinVar美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)注释,按病理学分类范围对变异进行分类。(B) ClinVar数据库中按类别划分的全球多样性芯片临床研究内容。变异数量可能会有变化。

Global Diversity Array上的QC标记

芯片上的QC变异支持各种样本追踪功能,例如性别确定、大陆血统、人类鉴定等。

相关资源

Illumina多基因风险评分解决方案是一套全面、易于实施且通用的基因组分析工具,适用于转化研究人员。

固定内容 (4)

Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (16 samples)

20031669

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含两个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测16个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (48 Samples)

20031810

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us. U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可切割的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含6个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测48个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (96 samples)

20031811

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含12个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测96个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (384 Samples)

20031812

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含48个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测384个DNA样本的试剂。

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附加内容 (4)

Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (16 Samples)

20031813

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含两个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测16个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (48 Samples)

20031814

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含6个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测48个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (96 Samples)

20031815

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含12个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测96个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (384 Samples)

20031816

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含48个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测384个DNA样本的试剂。

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Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

在客户现场提供为期三天的实践指导,帮助用户熟悉Infinium实验方案的基本步骤。本课程提供了有关样本和BeadChip制备、使用iScan系统进行样本扫描以及使用芯片分析软件进行原始数据评估和分析的实践培训。

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常见问题解答

Infinium GDA在Illumina人类芯片产品系列中提供了最具成本效益的每种变异覆盖度,是旨在最大限度地提高基因分型投资回报率的精准医疗项目的理想选择。与所有市售芯片相比,Infinium GDA with Enhanced PGx Content是可用于PGx研究的最全面的芯片。1查看 Infinium GDA with Enhanced PGx Content产品页面的更多差异。

多基因风险评分(PRS)代表个体具有的遗传变异总数,会增加其患上某种复杂疾病的风险。Global Diversity Array 8-Kit让研究人员能够在不同的群体中进行PRS评估。深入了解多基因风险评分

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参考文献
  1. 根据存档数据计算。Illumina公司 2021 年 3 月。

  2. 千人基因组计划。 1000 genomes.org。 2021 年 8 月 24 日查阅。

  3. PharmGKB,药物基因组学知识库。 www.pharmgkb.org。2021年8月4日查阅。

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