产品

TruSeq Stranded mRNA

从mRNA制备测序文库，获得清晰的编码转录组视图以及链特异性信息。

约10.5小时

分析时间

约4.5小时

手动操作时间

0.1–1 ug 总RNA或10 - 100 ng先前分离的mRNA（来自带polyA尾巴的种系）

起始量

详情请参见规格表

概述

TruSeq Stranded mRNA为编码转录组分析提供了经济的一体化可扩展解决方案，可兼容多种样本。

链方向检测

可精确测量mRNA链方向，用于检测反义转录、增强转录本注释和提高比对效率。高覆盖度均一性让诸如替代转录物、基因融合和等位基因特异性表达的发现变得更为容易。

性价比高

通过链的信息来鉴别给定RNA转录本是由两条DNA链中哪一条衍生而来的。该信息提高了转录本注释的可信度，特别是对于非人类样本。鉴别链的起源增加了比对read的百分比，降低了每个样本的测序成本。

可扩展

工作流程能够可靠分析标准和低质量样本，且兼容多种研究设计。

快速、自动化的工作流程

一天内即可制备好用于因美纳测序的文库。Illumina认证方法可通过 我们的合作伙伴在一系列自动化平台上使用。

阅读Illumina rRNA去除方案的全面评估

性能参数

Automation capability Liquid Handling Robots
Method mRNA Sequencing
Specialized sample types Not FFPE-Compatible
Strand specificity Stranded
Variant class Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts
作用机制 寡核苷酸-dT微珠捕获polyA尾巴
内容说明 捕获编码转录组（带链信息）
分析时间 约10.5小时
多重分析 1–96
手动操作时间 约4.5小时
技术 Illumina测序
核酸类型 RNA
物种 Mammalian, 牛, 小鼠, 人, 大鼠
物种详情 适用于来自任何带polyA尾巴的种系的高质量RNA
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
自动化详情 探索可用的自动化方法
说明 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图以及精确的链信息。
起始量 0.1–1 ug 总RNA或10 - 100 ng先前分离的mRNA（来自带polyA尾巴的种系）

所需产品

Illumina现提供模块化产品的预订，让您的工作流程变得灵活。您可以订购具有以下任何标签的以下任何文库制备产品。 

/

应用

工作流程示例

1
制备

TruSeq Stranded mRNA

2
测序
3
分析

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

RNA Profiling: 13–40 samples per run (based on 10 million reads per sample)
Transcriptome Analysis: 5–16 samples per run (based on 25 million reads per sample)

2×75 bp
2×75 bp
NovaSeq 6000 System

RNA Profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 320, S2:384, S4:768. Limited by index combinations (dual). Based on 10 million reads.
Transcriptome Analysis (samples per run, dual flow cell): S1: 128, S2: 256, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 25 million reads. 

≤ 2 × 100 bp
≤ 2 × 100 bp

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mRNA测序

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文档

产品资料
Support documentation

比较

TruSeq Stranded mRNA Illumina Stranded mRNA Prep Illumina RNA Prep with Enrichment
Automation capability Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots
Method mRNA Sequencing mRNA Sequencing Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing
Specialized sample types Not FFPE-Compatible Low-Input Samples, Not FFPE-Compatible Low-Input Samples, FFPE Tissue, Blood
Strand specificity Stranded Stranded Non-Stranded
Variant class Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts
作用机制 寡核苷酸-dT微珠捕获polyA尾巴 PolyA捕获，连接接头和标签 链接磁珠转座酶
内容说明 捕获编码转录组（带链信息） 捕获编码转录组（带链信息） 与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组
分析时间 约10.5小时 6.5小时 ＜9小时
多重分析 1–96 多达384个唯一双标签（UDI） 多达384个唯一双标签（UDI）
手动操作时间 约4.5小时 ＜3小时 < 2小时
核酸类型 RNA RNA RNA
物种 Mammalian, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 Mammalian, 牛, 小鼠, 人, 大鼠 人, Virus
物种详情 适用于来自任何带polyA尾巴的种系的高质量RNA 适用于来自任何带polyA尾巴的种系的高质量RNA
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NovaSeq 6000 System
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
说明 为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图以及精确的链信息。 简单、经济的编码转录组分析解决方案，可提供精确的链信息 一种可重现且经济的解决方案，可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本，包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织和其他低质量样本
起始量 0.1–1 ug 总RNA或10 - 100 ng先前分离的mRNA（来自带polyA尾巴的种系） 25-1000 ng标准质量的总RNA 10 ng RNA；20 ng FFPE RNA

选择工具：

文库制备和芯片试剂盒选择器

根据您的起始材料和感兴趣的方法，确定能够满足您需求的最佳文库制备试剂盒或芯片。

图

技术平行分析

FFPE组织的技术平行分析显示出高度的一致性，表明文库制备的性能稳定。轴为log2(FPKM)。显示 R2 值。

文库制备 (2)

TruSeq® Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)

20020594

包括用于前期polyA捕获步骤的RNA纯化磁珠、用于将mRNA转录成cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头。PolyA捕获步骤后需要纯化磁珠，并单独出售。

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TruSeq Stranded mRNA Library Prep (96 Samples)

20020595

包括用于前期polyA捕获步骤的RNA纯化磁珠、用于将mRNA转录为cDNA的PCR预混液，以及用于制备48个样本的试剂。单独购买标签接头。PolyA捕获步骤后需要纯化磁珠，并单独出售。

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标签接头 (4)

TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)

20020492

包括24个标签中的12个（标签：2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19），用于制备48个单独的RNA样本。

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TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)

20020493

包括24个标签中的12个（标签：1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27），用于制备48个单独的RNA样本。

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TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)

20019792

TruSeq Stranded RNA HT Kit 96样本接头孔板盒

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IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040871

包含96、8 bp标签，足以标记96个样本，与TruSeq Stranded mRNA和TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit兼容。版本 2 包含板 20022371 中 192 个标签寡核苷酸中 8 个的改进，其余 184 个未作更改。单独购买文库制备和探针panel。

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将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

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TruSight Oncology 500

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Illumina DNA Prep

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NextSeq 500/550 v2.5 Kit

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TruSeq Stranded Total RNA

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TruSeq RNA Exome

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