订购NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3可覆盖关键癌症基因，包括参与DNA修复的激酶域和基因。
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3
靶向DNA和RNA研究panel，可研究161种基因中与一系列癌症类型相关的变异。
5-6小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间）
分析时间
<1.5小时
手动操作时间
1–100 ng（建议每个混池10 ng）
起始量
概览
主要特点
该panel涵盖了热点区域、全长基因*、拷贝数基因、基因间和基因内融合。即用型panel助您节省鉴定目标基因、设计引物和优化panel所需的时间和精力。
Comprehensive Panel v3是集成工作流程的一部分，该工作流程包括基于AmpliSeq for Illumina聚合酶链式反应（PCR）的文库制备、采用因美纳边合成边测序（SBS）的新一代测序（NGS）技术以及自动化分析过程。
*对于该panel，因美纳将全长基因内容定义为覆盖基因的大部分编码区域的内容，计算机模拟覆盖度通常高于90%，而且，大多数基因的覆盖度均高于99%。有关详细信息，请参阅我们提供的产品清单文件。
规格
| Cancer type | Solid Tumor |
|---|---|
| Method | Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Specialized sample types | FFPE Tissue |
| Variant class | Gene fusions, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants |
| 作用机制 | 多重PCR |
| 内容说明 | 161个癌基因的DNA和RNA靶点 |
| 分析时间 | 5-6小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间） |
| 多重分析 | 96个双标签序列组合 |
| 手动操作时间 | <1.5小时 |
| 扩增子数 | 总共4，648个混合池（DNA混合池1：1，891个扩增子。 DNA池2：1，890个扩增子。 RNA池1：447个扩增子。 RNA池2：420个扩增子。） |
| 技术 | Illumina测序 |
| 核酸类型 | DNA, RNA |
| 物种 | 人 |
| 系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode |
| 说明 | 与实体瘤癌症相关的基因*热点和全长靶点的体细胞分析研究。 |
| 起始量 | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） |
应用
工作流程示例
文库制备
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3
项目建议
| 仪器 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| MiniSeq System | 3 samples per run (high output; assumes minimum coverage of 500×) |
2 × 150 bp |
| MiSeq System | 3 samples per run with v3 reagents (assumes minimum coverage of 500×) |
2 × 150 bp |
| NextSeq 550 System | Samples per run: mid output: 16, high output: 48 (assumes minimum coverage of 500×) |
2 × 150 bp |
相关应用和方法
文档
产品资料
手册与支持信息
- AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 Support - Documentation & Literature 文档
- AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 Reference Guide 文档
- Illumina Adapter Sequences 文档
- Index Adapters Pooling Guide 文档
- AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 Checklist 文档
- AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA Kit Reference Guide 文档
- 全部 AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 Support
比较
| AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | TruSight Tumor 170 | TruSight Tumor 15 | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | |
|---|---|---|---|---|---|
| Cancer type | Solid Tumor | Solid Tumor | Pan-Cancer, Solid Tumor | Solid Tumor | Pan-Cancer, Solid Tumor |
| Method | Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing | Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing | Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Specialized sample types | FFPE Tissue | Low-Input Samples, FFPE Tissue | FFPE Tissue | FFPE Tissue | FFPE Tissue |
| Variant class | Gene fusions, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants | Gene fusions, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Structural variants, Somatic variants | Insertions-deletions (indels), Somatic variants | Gene fusions, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants | Insertions-deletions (indels), Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants |
| 作用机制 | 多重PCR | 多重PCR | 多重PCR | ||
| 内容说明 | 161个癌基因的DNA和RNA靶点 | 探针富集了170个基因的完整编码序列。可检测151个基因中的单核苷酸变异、小插入和缺失，59个基因中的扩增，以及55个基因中的融合和剪接变异。 | 从15个实体瘤相关基因中扩增250个扩增子 | 52个癌基因的DNA和RNA靶点 | 50种与癌症具有已知关联的基因的热点区域 |
| 分析时间 | 5-6小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间） | 约2天 | 7小时 | 5-6小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间） | 5小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间） |
| 多重分析 | 96个双标签序列组合 | 使用两个标签集，DNA可重达32重，RNA可重达16重 | 1-24重 | 96个双标签序列组合 | 96个双标签序列组合 |
| 手动操作时间 | <1.5小时 | 约10.5小时 | 3.5小时 | < 1.5小时 | < 1.5小时 |
| 扩增子数 | 总共4，648个混合池（DNA混合池1：1，891个扩增子。 DNA池2：1，890个扩增子。 RNA池1：447个扩增子。 RNA池2：420个扩增子。） | 共553个。2个混合池。（DNA池：269个扩增子。 RNA池：284个扩增子。） | 共207个。1个混合池。 | ||
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 核酸类型 | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA | DNA, RNA | DNA |
| 物种 | 人 | 人 | 人 | 人 | 人 |
| 系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 500 Desktop Sequencer, HiSeq 2500 | MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System |
| 说明 | 与实体瘤癌症相关的基因*热点和全长靶点的体细胞分析研究。 | 利用DNA和RNA的变异检出信息，在实体瘤中开展全面的体细胞变异检测研究。 |
使用20 ng DNA对实体瘤中的15个常见突变基因进行NGS检测。 |
针对52个实体瘤相关基因的体细胞分析研究。 | 针对50个癌症相关基因的热点区域的体细胞分析研究。 |
| 起始量 | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 40 ng DNA和/或RNA |
20 ng FFPE DNA |
1–100 ng（建议每个混池10 ng） | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） |
Panel (1)
AmpliSeq™ Comprehensive Panel v3 for Illumina®
20019109
DNA和RNA靶向panel，靶向SNV、插入缺失、CNV和基因融合。试剂盒可进行24次反应。Library PLUS和标签接头均为单独出售。
List Price:
Discounts:
文库制备 (3)
AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®
20019101
包含用于制备24个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®
20019102
包含用于制备96个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®
20019103
包含用于制备384个文库的试剂。单独购买AmpliSeq for Illumina panel和标签接头。
List Price:
Discounts:
标签接头 (7)
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)
20019104
包含足以标记24个样本的24个标签。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
包含96个标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂和探针panel。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)
20031676
包含四组AmpliSeq CD Indexes for Illumina、Set A、Set B、Set C和Set D。每组包含96、8 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和探针panel。
List Price:
Discounts:
Ampliseq™ CD Indexes Large Volume for Illumina® (96 Indexes, 96 Samples)
20019108
AmpliSeq for Illumina CD Indexes Large Volume提供了更高的填充量，可在进行涉及4个或更多混池的AmpliSeq for Illumina Exome或自动化的AmpliSeq for Illumina文库制备工作流程时，让添加过程更加方便。
List Price:
Discounts:
配套产品 (3)
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
使用AmpliSeq for Illumina RNA Panel（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus和 Comprehensive Panel v3以及定制或社区RNA Panel）时，包含反应混合物和酶混合物，可将总RNA转化为cDNA。反应次数因panel而异（例如，AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、 Comprehensive Panel v3和Custom Panel的每个试剂盒有100次反应，AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus和TCR beta Panel的每个试剂盒有200次反应）。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA
20023378
包括24次反应，用于使用AmpliSeq for Illumina实验方案从未染色的玻片固定FFPE组织中制备DNA，无需脱蜡或DNA纯化。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
在制备用于测序的AmpliSeq for Illumina文库时，包含用于文库归一化的磁珠和试剂。
List Price:
Discounts:
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MiSeq Reagent Kit v3
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel
用于研究395种参与肿瘤—免疫系统相互作用基因的靶向RNA表达panel。
AmpliSeq for Illumina文库制备、标签序列及配套产品
用AmpliSeq for Illumina文库制备试剂和标签接头快速制备用于因美纳测序仪的扩增子文库。
TruSight Hereditary Cancer Panel
评估与遗传癌症风险倾向相关的113个基因和125个SNP的生殖系突变的靶向测序panel。
iSeq 100试剂
iSeq 100系统的试剂采用即用型卡盒以及单通道SBS化学和CMOS技术，可实现简单、低成本的测序。
AmpliSeq for Illumina On-Demand
从5000多个经测试的基因目录中选取，高效方便地为人类疾病研究定制panel设计。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
优化的靶向定制RNA研究panel，可测序多达1200个感兴趣的基因组靶点。
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